40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4959 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4959  lipoprotein, putative  100 
 
 		 231 aa  461  1e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0555  hypothetical protein  96.1 
 
 		 232 aa  444  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4911  hypothetical protein  72.46 
 
 		 251 aa  331  5e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4787  hypothetical protein  72.03 
 
 		 251 aa  328  6e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00573127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4703  hypothetical protein  70.34 
 
 		 236 aa  319  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0763396  normal  0.775889 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0504  hypothetical protein  67.62 
 
 		 237 aa  318  6e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0320775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4964  hypothetical protein  72.3 
 
 		 214 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.340246  normal  0.72478 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0600  hypothetical protein  57.4 
 
 		 241 aa  246  2e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65590  hypothetical protein  50 
 
 		 236 aa  224  7e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5692  hypothetical protein  50.42 
 
 		 236 aa  223  1e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43450  hypothetical protein  54.02 
 
 		 242 aa  215  5.9999999999999996e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140988  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0327  protein of unknown function DUF330  28.49 
 
 		 204 aa  72.8  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0041  protein of unknown function DUF330  32.32 
 
 		 197 aa  70.1  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1055  protein of unknown function DUF330  29.19 
 
 		 198 aa  67  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0364  putative lipoprotein  28.06 
 
 		 201 aa  66.2  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.14709  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1959  hypothetical protein  27.53 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000996139  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2634  hypothetical protein  27.17 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0404  hypothetical protein  28.75 
 
 		 203 aa  57  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2417  hypothetical protein  30.41 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0242841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0256  hypothetical protein  25.68 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1982  putative lipoprotein  28.79 
 
 		 195 aa  52.4  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0024934  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2579  hypothetical protein  27.32 
 
 		 191 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.621383 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4087  hypothetical protein  28.91 
 
 		 188 aa  50.4  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00226644  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0231  hypothetical protein  20.21 
 
 		 241 aa  50.4  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2448  hypothetical protein  28.87 
 
 		 201 aa  50.8  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.136482  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1444  hypothetical protein  27.36 
 
 		 208 aa  49.7  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.753012  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0667  hypothetical protein  26.89 
 
 		 211 aa  49.7  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2220  protein of unknown function DUF330  24.7 
 
 		 197 aa  49.3  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000082506 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0230  hypothetical protein  21.47 
 
 		 241 aa  47.8  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02852  hypothetical protein  25.95 
 
 		 189 aa  48.1  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003027  putative lipoprotein  23.18 
 
 		 192 aa  47.4  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44160  hypothetical protein  27.27 
 
 		 192 aa  47.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.266274  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3139  hypothetical protein  29.79 
 
 		 200 aa  45.8  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.260987  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1569  hypothetical protein  28.36 
 
 		 209 aa  44.7  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.849012  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1866  hypothetical protein  29.03 
 
 		 197 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.235297 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1921  hypothetical protein  28.1 
 
 		 199 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5507  hypothetical protein  26.62 
 
 		 201 aa  44.3  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2112  hypothetical protein  29.03 
 
 		 197 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.178277  normal  0.022349 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0652  hypothetical protein  24.6 
 
 		 196 aa  42.7  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.049729  normal  0.69496 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3377  hypothetical protein  31.37 
 
 		 201 aa  42.7  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.237475  normal  0.194903 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>