73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1569 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1569  hypothetical protein  100 
 
 		 209 aa  429  1e-119  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.849012  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4087  hypothetical protein  37.84 
 
 		 188 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00226644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5507  hypothetical protein  37.11 
 
 		 201 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2220  protein of unknown function DUF330  36.92 
 
 		 197 aa  119  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000082506 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2001  protein of unknown function DUF330  37.82 
 
 		 196 aa  118  4.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.142199  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44160  hypothetical protein  35.29 
 
 		 192 aa  113  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.266274  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0652  hypothetical protein  36.36 
 
 		 196 aa  113  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.049729  normal  0.69496 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0364  putative lipoprotein  32.34 
 
 		 201 aa  100  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.14709  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2417  hypothetical protein  29.9 
 
 		 204 aa  95.9  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0242841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0041  putative lipoprotein  35.2 
 
 		 206 aa  94.7  9e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.240026  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3241  protein of unknown function DUF330  32.63 
 
 		 199 aa  92.4  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3534  hypothetical protein  33.33 
 
 		 253 aa  89  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0808039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0710  protein of unknown function DUF330  31.52 
 
 		 248 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0404  hypothetical protein  26.24 
 
 		 203 aa  76.3  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0041  protein of unknown function DUF330  34.62 
 
 		 197 aa  76.3  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4001  hypothetical protein  30.32 
 
 		 250 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2634  hypothetical protein  24.04 
 
 		 212 aa  72  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0256  hypothetical protein  29.77 
 
 		 205 aa  71.6  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3046  hypothetical protein  25.13 
 
 		 207 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.796041  normal  0.0181531 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1055  protein of unknown function DUF330  24.38 
 
 		 198 aa  69.3  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2536  hypothetical protein  31.52 
 
 		 233 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0677  hypothetical protein  29.55 
 
 		 239 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0204159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0710  hypothetical protein  29.55 
 
 		 238 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2126  putative lipoprotein  29.57 
 
 		 233 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0863972  normal  0.08915 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0327  protein of unknown function DUF330  27.32 
 
 		 204 aa  68.2  0.00000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6349  hypothetical protein  29.06 
 
 		 225 aa  67  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.238642  normal  0.295075 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0226  hypothetical protein  29.55 
 
 		 238 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3798  hypothetical protein  29.55 
 
 		 240 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.860154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3508  resolvase, RNase H-like fold  29.23 
 
 		 217 aa  64.3  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0625  hypothetical protein  27.72 
 
 		 240 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435543  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2892  protein of unknown function DUF330  29.5 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.529816  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0601  hypothetical protein  28.41 
 
 		 242 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.391552  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2675  hypothetical protein  28.16 
 
 		 243 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.681553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0667  hypothetical protein  27.08 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3139  hypothetical protein  27.01 
 
 		 200 aa  60.8  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.260987  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3180  lipoprotein, putative  23.62 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.131862  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0516  protein of unknown function DUF330  26.4 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2832  hypothetical protein  28.42 
 
 		 183 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.766034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0529  hypothetical protein  34.02 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1153  putative lipoprotein  28.76 
 
 		 256 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3375  putative lipoprotein  27.74 
 
 		 252 aa  57  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.203626  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3383  hypothetical protein  28.76 
 
 		 256 aa  57  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1267  hypothetical protein  27.81 
 
 		 264 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2560  putative lipoprotein  28.76 
 
 		 252 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0291  putative lipoprotein  28.76 
 
 		 252 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2377  putative lipoprotein  28.76 
 
 		 256 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3341  hypothetical protein  28.76 
 
 		 239 aa  57  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.376866  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2680  putative lipoprotein  26.71 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.208689  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1982  putative lipoprotein  25.87 
 
 		 195 aa  53.9  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0024934  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4964  hypothetical protein  27.97 
 
 		 214 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.340246  normal  0.72478 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1444  hypothetical protein  26.15 
 
 		 208 aa  50.1  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.753012  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0600  hypothetical protein  26.36 
 
 		 211 aa  49.7  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0442544  normal  0.826922 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5279  hypothetical protein  26.13 
 
 		 233 aa  48.9  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0231  hypothetical protein  28.81 
 
 		 241 aa  48.9  0.00006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4959  lipoprotein, putative  27.7 
 
 		 231 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5803  hypothetical protein  26.88 
 
 		 236 aa  48.5  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000107973  hitchhiker  0.000892453 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1684  protein of unknown function DUF330  22.96 
 
 		 186 aa  48.1  0.00008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2448  hypothetical protein  24.52 
 
 		 201 aa  48.1  0.00008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.136482  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0230  hypothetical protein  19.16 
 
 		 241 aa  47.8  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1231  protein of unknown function DUF330  25.34 
 
 		 202 aa  47.8  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.228197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4703  hypothetical protein  27.12 
 
 		 236 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0763396  normal  0.775889 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0504  hypothetical protein  27.86 
 
 		 237 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0320775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5258  hypothetical protein  32 
 
 		 194 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.960126  normal  0.0530177 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2579  hypothetical protein  24.26 
 
 		 191 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.621383 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0555  hypothetical protein  25.35 
 
 		 232 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2578  hypothetical protein  26.35 
 
 		 176 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.130696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0578  hypothetical protein  25.69 
 
 		 195 aa  45.8  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.410916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4787  hypothetical protein  25.42 
 
 		 251 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00573127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3138  hypothetical protein  26.57 
 
 		 176 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4911  hypothetical protein  25.42 
 
 		 251 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5692  hypothetical protein  24.65 
 
 		 236 aa  42.4  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65590  hypothetical protein  24.65 
 
 		 236 aa  41.6  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1921  hypothetical protein  24.67 
 
 		 199 aa  41.6  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>