43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3078 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3078  putative lipoprotein  100 
 
 		 186 aa  380  1e-105  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.378307  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2075  hypothetical protein  37.99 
 
 		 191 aa  115  3e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00929812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1703  hypothetical protein  31.02 
 
 		 197 aa  96.7  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0364  putative lipoprotein  28.02 
 
 		 201 aa  71.6  0.000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.14709  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02657  hypothetical protein  28.09 
 
 		 202 aa  67.8  0.00000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1982  putative lipoprotein  23.86 
 
 		 195 aa  65.5  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0024934  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1464  hypothetical protein  29.67 
 
 		 188 aa  54.7  0.0000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000157242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5507  hypothetical protein  27.97 
 
 		 201 aa  53.9  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1353  putative lipoprotein  25 
 
 		 192 aa  53.9  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000161061  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2009  hypothetical protein  25.33 
 
 		 221 aa  51.2  0.000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1106  putative lipoprotein  26.92 
 
 		 187 aa  50.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00265959  normal  0.0111053 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1174  hypothetical protein  26.92 
 
 		 187 aa  50.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00770681  normal  0.496959 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1128  putative lipoprotein  26.92 
 
 		 187 aa  50.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000973487  normal  0.73613 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1023  putative lipoprotein  26.92 
 
 		 187 aa  50.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000948477  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4087  hypothetical protein  23.16 
 
 		 188 aa  50.8  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00226644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1140  putative lipoprotein  26.92 
 
 		 187 aa  50.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000741069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1116  putative lipoprotein  26.78 
 
 		 187 aa  48.9  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000042581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1747  hypothetical protein  29.19 
 
 		 185 aa  49.3  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00777543  decreased coverage  0.000000370009 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2167  putative lipoprotein  26.78 
 
 		 187 aa  48.9  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000482452  normal  0.394753 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0652  hypothetical protein  24.44 
 
 		 196 aa  48.9  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.049729  normal  0.69496 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2644  hypothetical protein  26.78 
 
 		 187 aa  48.9  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000251515  hitchhiker  0.00000297897 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00956  hypothetical protein  26.63 
 
 		 182 aa  48.9  0.00005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000276204  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1067  hypothetical protein  26.78 
 
 		 187 aa  48.9  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000185697  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1061  hypothetical protein  26.78 
 
 		 187 aa  48.9  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000240203  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00963  hypothetical protein  26.63 
 
 		 182 aa  48.9  0.00005  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000461465  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2691  protein of unknown function DUF330  26.78 
 
 		 187 aa  48.9  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000327636  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1991  putative lipoprotein  28.05 
 
 		 192 aa  48.1  0.00008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2365  putative lipoprotein  26.78 
 
 		 187 aa  47.8  0.00009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0264734  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2637  hypothetical protein  28.05 
 
 		 192 aa  47.4  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.2573  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2548  putative lipoprotein  28.05 
 
 		 192 aa  47.4  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00417943  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0041  protein of unknown function DUF330  26.87 
 
 		 197 aa  47  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6349  hypothetical protein  29.29 
 
 		 225 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.238642  normal  0.295075 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2417  hypothetical protein  25.81 
 
 		 204 aa  46.6  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0242841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1055  protein of unknown function DUF330  27.63 
 
 		 198 aa  46.6  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44160  hypothetical protein  21.23 
 
 		 192 aa  47  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.266274  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4854  hypothetical protein  28.12 
 
 		 182 aa  43.5  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000642046 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0367  hypothetical protein  28.12 
 
 		 182 aa  43.5  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3139  hypothetical protein  29 
 
 		 200 aa  41.6  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.260987  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2723  hypothetical protein  21.71 
 
 		 211 aa  41.6  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1684  protein of unknown function DUF330  25.6 
 
 		 186 aa  41.6  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2634  hypothetical protein  21.39 
 
 		 212 aa  41.6  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0667  hypothetical protein  32.35 
 
 		 211 aa  41.2  0.008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4622  hypothetical protein  21.08 
 
 		 214 aa  41.2  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>