18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3500 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_3500  hypothetical protein  100 
 
 		 212 aa  423  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2448  hypothetical protein  44.04 
 
 		 201 aa  153  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.136482  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0364  putative lipoprotein  33.52 
 
 		 201 aa  68.2  0.00000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.14709  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1231  protein of unknown function DUF330  42.15 
 
 		 202 aa  67.4  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.228197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2634  hypothetical protein  29.57 
 
 		 212 aa  67  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1106  putative lipoprotein  25.95 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00265959  normal  0.0111053 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1140  putative lipoprotein  25.95 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000741069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1023  putative lipoprotein  25.95 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000948477  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1128  putative lipoprotein  25.95 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000973487  normal  0.73613 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1174  hypothetical protein  25.95 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00770681  normal  0.496959 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2417  hypothetical protein  28.89 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0242841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5507  hypothetical protein  28.43 
 
 		 201 aa  50.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5821  hypothetical protein  26.52 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0514246  normal  0.606405 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2068  protein of unknown function DUF330  29.44 
 
 		 188 aa  48.9  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.742737  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1714  hypothetical protein  35.25 
 
 		 232 aa  46.6  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000167749 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3329  hypothetical protein  28.48 
 
 		 185 aa  44.7  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.488614  normal  0.577133 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1444  hypothetical protein  29.78 
 
 		 208 aa  44.3  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.753012  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1684  protein of unknown function DUF330  30.19 
 
 		 186 aa  42.4  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>