More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1014 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1014  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 262 aa  526  1e-148  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12170  transcriptional regulator  43.08 
 
 		 262 aa  154  2e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08770  transcriptional regulator, GntR family  25 
 
 		 244 aa  72  0.000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000139729  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2477  GntR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 244 aa  68.2  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.698104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0543  trehalose operon repressor  26.2 
 
 		 235 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.405615  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0527  trehalose operon transcriptional repressor  25.33 
 
 		 235 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0698  trehalose operon transcriptional repressor  28.3 
 
 		 236 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0759  trehalose operon repressor  27.83 
 
 		 236 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0913  transcription regulator GntR family  26.42 
 
 		 232 aa  64.7  0.000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0175976  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0597  trehalose operon transcriptional repressor  27.36 
 
 		 236 aa  63.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.464881  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0630  trehalose operon transcriptional repressor  27.36 
 
 		 236 aa  63.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0666  trehalose operon repressor  26.42 
 
 		 236 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4031  GntR domain-containing protein  45.83 
 
 		 243 aa  63.5  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4671  trehalose operon repressor  26.42 
 
 		 236 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.38863e-21 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33520  transcriptional regulator  29.88 
 
 		 263 aa  63.5  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.422261  normal  0.208572 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2634  GntR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 245 aa  63.9  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.864303 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1179  GntR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 244 aa  63.2  0.000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0543  GntR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 236 aa  63.2  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0541  trehalose operon transcriptional repressor  27.36 
 
 		 236 aa  62.8  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0541  trehalose operon transcriptional repressor  27.36 
 
 		 236 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2388  GntR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 248 aa  62.8  0.000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02029  predicted DNA-binding transcriptional regulator  26.06 
 
 		 248 aa  62.8  0.000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1556  transcriptional regulator, GntR family  26.06 
 
 		 248 aa  62.8  0.000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.868549  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3079  transcriptional regulator, GntR family  26.06 
 
 		 248 aa  62.8  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.104176 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1546  GntR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 248 aa  62.8  0.000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.599104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1138  transcriptional regulator, GntR family  26.06 
 
 		 248 aa  62.8  0.000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.252402  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0964  GntR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 248 aa  62.8  0.000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2237  GntR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 248 aa  62.8  0.000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01993  hypothetical protein  26.06 
 
 		 248 aa  62.8  0.000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4206  transcriptional regulator, GntR family  30.86 
 
 		 261 aa  62.4  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4094  transcriptional regulator, GntR family  30.86 
 
 		 261 aa  62.4  0.000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2078  histidine utilization repressor  29.84 
 
 		 251 aa  61.6  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7288  putative transcriptional regulator, GntR family  29.55 
 
 		 249 aa  61.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.767574 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1710  GntR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 245 aa  62  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2073  GntR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 245 aa  60.8  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0165652  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5445  histidine utilization repressor  27.88 
 
 		 245 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0118538  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0781  GntR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 266 aa  60.8  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2213  GntR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 264 aa  60.5  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.042368  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1424  putative transcriptional regulator, GntR family  29.9 
 
 		 246 aa  60.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.07575  normal  0.0454978 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0685  trehalose operon repressor  26.89 
 
 		 236 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.327487 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3981  GntR domain-containing protein  45.95 
 
 		 233 aa  60.5  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2843  GntR family transcriptional regulator  49.23 
 
 		 243 aa  60.1  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.726493 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0253  GntR domain-containing protein  46.38 
 
 		 262 aa  60.5  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27900  putative transcriptional regulator  28.72 
 
 		 239 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3927  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  30.34 
 
 		 242 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.341956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0404  transcriptional regulator, GntR family  28.87 
 
 		 249 aa  59.7  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3714  GntR family transcriptional regulator  50.75 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421261  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4895  histidine utilization repressor  27.4 
 
 		 245 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.108836 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5417  transcriptional regulator, GntR family  28.05 
 
 		 271 aa  60.1  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.774443 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1950  transcriptional regulator, GntR family  25.76 
 
 		 256 aa  59.7  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000832464 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3333  transcriptional regulator, GntR family  41.03 
 
 		 253 aa  59.7  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 249 aa  59.7  0.00000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2215  transcriptional regulator, GntR family  36.07 
 
 		 270 aa  59.7  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.587929  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4185  GntR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 249 aa  58.9  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.188072  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3110  GntR family transcriptional regulator  45.57 
 
 		 268 aa  58.9  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.371117  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3229  histidine utilization repressor  28.93 
 
 		 245 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.259882 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1419  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 247 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3766  GntR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 248 aa  58.9  0.00000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1359  GntR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 249 aa  58.5  0.00000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.516922 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2332  GntR family transcriptional regulator  23.64 
 
 		 248 aa  58.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.491871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2381  transcriptional regulator, GntR family  23.64 
 
 		 248 aa  58.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.770781 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2489  GntR family transcriptional regulator  23.64 
 
 		 248 aa  58.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000412  transcriptional regulator of succinyl CoA synthetase operon  27.5 
 
 		 235 aa  58.2  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  25.81 
 
 		 243 aa  58.5  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2377  GntR family transcriptional regulator  23.64 
 
 		 248 aa  58.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0977965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2288  transcriptional regulator, GntR family  23.64 
 
 		 248 aa  58.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.545924  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0075  histidine utilization repressor  26.61 
 
 		 245 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.510846  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3733  transcriptional regulator, GntR family  28.81 
 
 		 245 aa  58.2  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.502794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2009  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  28.84 
 
 		 246 aa  58.2  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.378179  normal  0.0458399 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0374  GntR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 243 aa  58.2  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0369  transcriptional regulator  30.5 
 
 		 243 aa  58.5  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1535  transcriptional regulator  23.11 
 
 		 233 aa  58.5  0.0000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.178039  normal  0.468584 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2475  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  33.12 
 
 		 255 aa  58.5  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.505105  normal  0.226466 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2141  GntR domain-containing protein  45.95 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4612  histidine utilization repressor  27.1 
 
 		 245 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0980762  hitchhiker  0.00350601 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2556  GntR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 248 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000796144 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0971  GntR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 248 aa  57.4  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0558982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5864  GntR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 248 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.564885  normal  0.734875 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0833  GntR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 272 aa  57.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0464324 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2355  putative transcriptional regulator  28.19 
 
 		 239 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1920  GntR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 248 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5243  histidine utilization repressor  27.1 
 
 		 245 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.846899  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2778  transcriptional regulator, GntR family  33.58 
 
 		 249 aa  57.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.021703  normal  0.068173 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1491  GntR family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 249 aa  57.8  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0628675  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2444  GntR family transcriptional regulator  25 
 
 		 241 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000401833  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2283  GntR family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 255 aa  57.4  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.666323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0303  GntR family transcriptional regulator  22.92 
 
 		 249 aa  57.4  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2532  GntR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 248 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00685301  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5616  histidine utilization repressor  27.1 
 
 		 245 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.321981  normal  0.0803951 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2818  GntR domain-containing protein  45.68 
 
 		 249 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.325191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0283  GntR family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 233 aa  57  0.0000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.696412  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4276  GntR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 253 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0786169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4392  GntR family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 257 aa  57  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.599846 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4956  GntR domain protein  41.67 
 
 		 258 aa  57  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.114514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3321  GntR domain-containing protein  46.67 
 
 		 240 aa  57  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.580884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2580  GntR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 258 aa  57  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.496201  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2450  GntR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 258 aa  57  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000263261 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34690  transcriptional regulator, GntR family  29.53 
 
 		 244 aa  56.6  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0368161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2416  GntR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 246 aa  56.6  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.47741  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1823  histidine utilization repressor  33.91 
 
 		 267 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.325999  normal  0.489419 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>