More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1213 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_1213  glycosyl transferase family 51  100 
 
 		 985 aa  2015    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0498  glycosyl transferase family protein  29.07 
 
 		 910 aa  297  5e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000157387  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0324  penicillin-binding protein, 1A family  28.93 
 
 		 802 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0497  glycosyl transferase family protein  29.46 
 
 		 907 aa  285  2.0000000000000002e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2326  1A family penicillin-binding protein  29.28 
 
 		 807 aa  279  2e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.774073  unclonable  0.0000291309 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2676  1A family penicillin-binding protein  29.29 
 
 		 795 aa  279  2e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.21019 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1395  penicillin-binding protein, 1A family  29 
 
 		 809 aa  275  3e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.47778  normal  0.639288 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1304  penicillin-binding protein, 1A family  28.19 
 
 		 819 aa  273  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0651627 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2630  penicillin-binding protein, 1A family  28.72 
 
 		 807 aa  269  2e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2266  1A family penicillin-binding protein  28.9 
 
 		 819 aa  266  2e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1797  penicillin-binding protein 1a  28.97 
 
 		 818 aa  265  2e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0916  penicillin-binding protein 1A, putative  28.96 
 
 		 819 aa  264  8e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.274618  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0911  putative penicillin-binding protein 1A  28.85 
 
 		 819 aa  263  8.999999999999999e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.477143  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0867  penicillin-binding protein 1A  28.91 
 
 		 835 aa  260  1e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.371617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0201  peptidoglycan glycosyltransferase  27.28 
 
 		 793 aa  259  2e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.558494 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1824  penicillin-binding protein 1A  29.09 
 
 		 843 aa  252  3e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0792156  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1716  penicillin-binding protein 1A  28.6 
 
 		 831 aa  250  8e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0706575  normal  0.372111 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2444  penicillin-binding protein 1A  29.35 
 
 		 830 aa  249  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.257563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3603  penicillin-binding protein, 1A family  28.52 
 
 		 799 aa  247  6.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00689676  hitchhiker  0.000000108854 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0274  penicillin-binding protein, 1A family  28 
 
 		 790 aa  244  5e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.565405  normal  0.249222 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00034  penicillin-binding protein 1A  28.41 
 
 		 855 aa  244  7.999999999999999e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3374  penicillin-binding protein 1A  27.19 
 
 		 846 aa  241  5e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2852  penicillin-binding protein 1A  28.91 
 
 		 830 aa  241  5.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.456684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0934  1A family penicillin-binding protein  27.15 
 
 		 803 aa  240  8e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.305447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1918  penicillin-binding protein, 1A family  27.91 
 
 		 812 aa  240  8e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.176585  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5843  1A family penicillin-binding protein  27.95 
 
 		 808 aa  239  3e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.36925  normal  0.15552 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2212  penicillin-binding protein 1A  27.25 
 
 		 835 aa  237  8e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3124  penicillin-binding protein 1A  27.31 
 
 		 807 aa  235  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.31223  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0157  penicillin-binding protein, 1A family protein  27.98 
 
 		 851 aa  235  3e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3136  penicillin-binding protein 1A  27.86 
 
 		 791 aa  235  3e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0466  penicillin-binding protein  27.32 
 
 		 863 aa  234  6e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.539362  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0404  penicillin-binding protein 1A  25.49 
 
 		 815 aa  233  1e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0818527  normal  0.504343 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2730  penicillin-binding protein, 1A family  29.11 
 
 		 832 aa  233  1e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3007  penicillin-binding protein 1A  28.83 
 
 		 830 aa  232  3e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.160235 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0207  1A family penicillin-binding protein  26.72 
 
 		 861 aa  231  4e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0421791 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0209  penicillin-binding protein 1A  27.73 
 
 		 771 aa  231  6e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1936  penicillin-binding protein, 1A family  25.23 
 
 		 790 aa  229  1e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0334  1A family penicillin-binding protein  26.98 
 
 		 847 aa  227  8e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0541  1A family penicillin-binding protein  26.12 
 
 		 803 aa  227  1e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1016  penicillin-binding protein 1A  27.81 
 
 		 778 aa  227  1e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3705  1A family penicillin-binding protein  27.63 
 
 		 797 aa  226  2e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2752  1A family penicillin-binding protein  27.63 
 
 		 797 aa  226  2e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3734  1A family penicillin-binding protein  27.63 
 
 		 797 aa  226  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3201  1A family penicillin-binding protein  27.63 
 
 		 797 aa  226  2e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3274  penicillin-binding protein 1A  26.44 
 
 		 792 aa  226  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3763  1A family penicillin-binding protein  27.63 
 
 		 797 aa  225  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.763292  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3408  1A family penicillin-binding protein  26.96 
 
 		 766 aa  225  3e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000649652 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2802  1A family penicillin-binding protein  27.5 
 
 		 797 aa  224  6e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.437708  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3029  1A family penicillin-binding protein  27.38 
 
 		 797 aa  224  8e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1752  1A family penicillin-binding protein  28.43 
 
 		 770 aa  224  9e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2648  penicillin-binding protein, 1A family  37.86 
 
 		 814 aa  223  1.9999999999999999e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.213317  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0981  hypothetical protein  26.49 
 
 		 786 aa  221  5e-56  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.250374 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1108  penicillin-binding protein 1A  29.1 
 
 		 846 aa  220  8.999999999999998e-56  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1760  1A family penicillin-binding protein  37.08 
 
 		 824 aa  220  1e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590244  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  34.68 
 
 		 761 aa  211  5e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0242  1A family penicillin-binding protein  37.61 
 
 		 829 aa  211  6e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2218  1A family penicillin-binding protein  37.32 
 
 		 830 aa  209  2e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1930  membrane carboxypeptidase mrcB  37.68 
 
 		 820 aa  209  2e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.382512  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4764  glycosyl transferase family 51  27.56 
 
 		 850 aa  204  7e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193555  normal  0.0626376 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2876  glycosyl transferase family 51  36.56 
 
 		 861 aa  202  1.9999999999999998e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.186058  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3276  1A family penicillin-binding protein  27.16 
 
 		 908 aa  201  7e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.658356  normal  0.980736 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0074  penicillin-binding protein, 1A family  25.37 
 
 		 852 aa  199  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0057  penicillin-binding protein 1A  25.94 
 
 		 852 aa  200  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  34.12 
 
 		 765 aa  192  2.9999999999999997e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3195  1A family penicillin-binding protein  35.59 
 
 		 773 aa  187  6e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0062  penicillin-binding protein, 1A family  24.88 
 
 		 852 aa  186  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1646  1A family penicillin-binding protein  30.32 
 
 		 828 aa  186  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.651104  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0010  peptidoglycan synthetase; penicillin-binding protein 1A  34.93 
 
 		 797 aa  185  4.0000000000000006e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.00000000000000754529  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1710  penicillin-binding protein 1A  34.86 
 
 		 905 aa  184  5.0000000000000004e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000352248  normal  0.214747 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1877  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.3 
 
 		 829 aa  184  8.000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.907756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2223  penicillin-binding protein 1A, putative  26.3 
 
 		 829 aa  184  8.000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1812  penicillin-binding protein, 1A family  32.86 
 
 		 941 aa  183  1e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.022556  normal  0.0842954 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  31.41 
 
 		 806 aa  182  4e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  33.24 
 
 		 727 aa  181  4.999999999999999e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0754  twin-arginine translocation pathway signal  32.4 
 
 		 880 aa  181  5.999999999999999e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2389  penicillin-binding protein, 1A family  36.53 
 
 		 727 aa  179  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.390791  normal  0.221681 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1857  1A family penicillin-binding protein  38.08 
 
 		 849 aa  178  5e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.874221 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1624  1A family penicillin-binding protein  37.75 
 
 		 849 aa  176  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.521017  normal  0.641281 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2978  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a)  37.75 
 
 		 849 aa  176  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0235  penicillin-binding protein, 1A family  33.94 
 
 		 880 aa  174  7.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1109  peptidoglycan glycosyltransferase  30.4 
 
 		 795 aa  172  3e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000046818  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2728  glycosyl transferase family 51  32.08 
 
 		 918 aa  172  4e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2534  penicillin-binding protein 1A  35.52 
 
 		 854 aa  172  4e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.175244 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1578  penicillin-binding protein  33.12 
 
 		 680 aa  171  6e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00315585  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1336  penicillin-binding protein 2A  33.12 
 
 		 680 aa  171  7e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000691863  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1547  penicillin-binding protein  33.12 
 
 		 667 aa  171  7e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000544476 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1616  penicillin-binding protein  33.12 
 
 		 680 aa  171  7e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000866869  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1363  penicillin-binding protein  33.12 
 
 		 673 aa  171  8e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000333103  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1337  penicillin-binding protein 2A  33.12 
 
 		 680 aa  171  8e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1474  penicillin-binding protein  33.12 
 
 		 673 aa  171  8e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0083684  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0754  penicillin-binding protein, 1A family  31.7 
 
 		 796 aa  171  8e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1378  1A family penicillin-binding protein  32.58 
 
 		 679 aa  170  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000265206  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4406  1A family penicillin-binding protein  34.53 
 
 		 818 aa  170  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000928316  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1862  1A family penicillin-binding protein  32.36 
 
 		 839 aa  170  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  unclonable  0.000000145704  hitchhiker  0.0000925337 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1510  penicillin-binding protein  32.58 
 
 		 680 aa  170  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00148274  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1935  1A family penicillin-binding protein  32.36 
 
 		 839 aa  170  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000247834  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2107  penicillin-binding protein, 1A family  32.95 
 
 		 912 aa  170  1e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2321  1A family penicillin-binding protein  36.13 
 
 		 862 aa  169  2e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.10527  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3022  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.36 
 
 		 817 aa  169  2e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.369948  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3835  penicillin-binding protein 1F (PBP-1F)  32.79 
 
 		 680 aa  169  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.288255  hitchhiker  0.000000000138665 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>