More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_1487 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009675  Anae109_1487  response regulator receiver protein  100 
 
 		 499 aa  927    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.10241 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2380  response regulator receiver domain-containing protein  55.13 
 
 		 528 aa  253  8.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1579  response regulator receiver protein  53.97 
 
 		 527 aa  239  1e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1484  response regulator receiver protein  55.02 
 
 		 527 aa  228  1e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0535402  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0266  response regulator receiver protein  43.12 
 
 		 858 aa  90.9  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.159448  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0255  response regulator receiver protein  43.12 
 
 		 860 aa  90.9  5e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.845509  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0251  response regulator receiver protein  40 
 
 		 126 aa  85.1  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.102048 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3577  two component transcriptional regulator  37.9 
 
 		 232 aa  81.3  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.70324 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.6 
 
 		 231 aa  81.6  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3728  response regulator receiver protein  34.75 
 
 		 128 aa  79.7  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.445342 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1911  two component transcriptional regulator  35.94 
 
 		 229 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2387  two component transcriptional regulator  36.43 
 
 		 229 aa  79  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00115026  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0882  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.66 
 
 		 230 aa  79  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.148935 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4696  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.24 
 
 		 1917 aa  78.2  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0092  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 120 aa  77.4  0.0000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  35 
 
 		 228 aa  77.4  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 223 aa  76.6  0.0000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3452  two component transcriptional regulator  34.65 
 
 		 229 aa  76.6  0.0000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00686704  hitchhiker  0.000158375 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2281  two component transcriptional regulator  34.38 
 
 		 229 aa  76.6  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.331932  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0315  response regulator receiver protein  32.79 
 
 		 138 aa  76.6  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.198988 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0508  response regulator receiver domain-containing protein  32.5 
 
 		 121 aa  75.5  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.481314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0751  response regulator receiver protein  35.59 
 
 		 121 aa  75.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3303  two component transcriptional regulator  34.65 
 
 		 229 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000702519  hitchhiker  0.00000106408 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0722  response regulator receiver protein  35.59 
 
 		 121 aa  75.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2960  response regulator receiver  29.17 
 
 		 190 aa  75.1  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0852903  normal  0.915615 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0170  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.93 
 
 		 232 aa  75.1  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3000  response regulator receiver protein  31.97 
 
 		 124 aa  75.1  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 121 aa  75.1  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2145  DNA-binding response regulator  38.52 
 
 		 232 aa  74.7  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1501  response regulator receiver protein  36.52 
 
 		 132 aa  74.3  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.153095  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1005  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.51 
 
 		 227 aa  73.9  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000255449  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0734  response regulator receiver protein  34.15 
 
 		 127 aa  73.9  0.000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2768  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  33.07 
 
 		 229 aa  73.9  0.000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0176064  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1220  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.17 
 
 		 233 aa  73.9  0.000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00991602 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3742  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.53 
 
 		 263 aa  73.9  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1997  two component transcriptional regulator  32.03 
 
 		 234 aa  73.6  0.000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000742772  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2267  two component transcriptional regulator, AraC family  37.29 
 
 		 265 aa  73.6  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00808217 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  35.65 
 
 		 232 aa  73.6  0.000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1378  two component transcriptional regulator  33.86 
 
 		 229 aa  73.6  0.000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000291119  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1558  phosphate regulon response regulator PhoB  33.86 
 
 		 239 aa  73.6  0.000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1403  two component transcriptional regulator  33.86 
 
 		 229 aa  73.6  0.000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00109837  normal  0.0219543 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2981  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  33.86 
 
 		 229 aa  73.6  0.000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000220801  hitchhiker  0.00121997 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1364  two component transcriptional regulator  33.86 
 
 		 229 aa  73.6  0.000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000657343  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3105  DNA-binding response regulator PhoB  38.94 
 
 		 232 aa  72.8  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3061  two component transcriptional regulator  32.33 
 
 		 227 aa  73.2  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.799336  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1296  two component transcriptional regulator  33.86 
 
 		 229 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000460678  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3423  response regulator receiver protein  36.28 
 
 		 224 aa  72.8  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.699539  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2709  two component transcriptional regulator  33.86 
 
 		 229 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000407229  decreased coverage  0.000000263688 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2777  two component transcriptional regulator  33.86 
 
 		 229 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000628627  decreased coverage  0.000208697 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2892  two component transcriptional regulator  31.9 
 
 		 227 aa  73.2  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0239565 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2879  two component transcriptional regulator  33.86 
 
 		 229 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000143261  hitchhiker  0.00000615281 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4079  chemotaxis receiver protein  29.75 
 
 		 121 aa  72.4  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0681  DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 246 aa  72  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.63003  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0492  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  27.35 
 
 		 1992 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0297  response regulator receiver protein  30.58 
 
 		 121 aa  72.4  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.127858  normal  0.448356 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0154  two component transcriptional regulator  33.61 
 
 		 238 aa  72  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.644268  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3413  two component transcriptional regulator  38.32 
 
 		 252 aa  72.4  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.427436 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1133  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.14 
 
 		 217 aa  72  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3069  two component transcriptional regulator  37.5 
 
 		 230 aa  72  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000467461  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0329  response regulator receiver protein  30.58 
 
 		 121 aa  72.4  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2199  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  33.05 
 
 		 344 aa  72.4  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.425276 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2951  two component transcriptional regulator  34.23 
 
 		 236 aa  72.4  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4952  response regulator receiver protein  30.83 
 
 		 121 aa  72.4  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.699568  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2749  two component transcriptional regulator  33.07 
 
 		 241 aa  72  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000593879  unclonable  0.00000330773 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1892  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.5 
 
 		 228 aa  72  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000392  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1074  response regulator receiver protein  34.65 
 
 		 229 aa  72  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000246777  normal  0.491091 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2969  two component transcriptional regulator  33.07 
 
 		 229 aa  72  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000855765  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2219  response regulator  32.76 
 
 		 123 aa  71.6  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5030  sensor histidine kinase/response regulator  26.5 
 
 		 1987 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6002  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.03 
 
 		 243 aa  71.6  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.472724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0323  two component transcriptional regulator  31.86 
 
 		 227 aa  71.6  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37500  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  34.88 
 
 		 225 aa  72  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0213695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4351  two component transcriptional regulator  39.45 
 
 		 245 aa  71.6  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.110039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3155  two component transcriptional regulator  37.39 
 
 		 228 aa  71.6  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0408  CheA signal transduction histidine kinase  29.84 
 
 		 2423 aa  71.2  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3637  response regulator receiver  36.61 
 
 		 225 aa  71.2  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.135674  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0759  two component transcriptional regulator  32.77 
 
 		 223 aa  71.2  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128917  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1936  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.53 
 
 		 246 aa  71.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2296  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 		 394 aa  71.2  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5342  response regulator receiver  31.82 
 
 		 910 aa  71.2  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1963  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.53 
 
 		 246 aa  71.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.470012 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05390  ChpA  30.71 
 
 		 2476 aa  71.2  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.812783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0513  response regulator  30.65 
 
 		 2458 aa  71.2  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5261  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.65 
 
 		 237 aa  71.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.909356  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3772  CheA signal transduction histidine kinase  30.89 
 
 		 2539 aa  71.2  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3691  two component transcriptional regulator  34.43 
 
 		 230 aa  70.9  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2076  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.19 
 
 		 2107 aa  70.9  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1538  phosphate regulon transcriptional regulatory protein  33.12 
 
 		 228 aa  70.5  0.00000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.280381 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2599  phosphate regulon transcriptional regulator, PhoR  36.75 
 
 		 230 aa  70.5  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1257  two component transcriptional regulator  36.75 
 
 		 230 aa  70.5  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.621627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0624  two component transcriptional regulator  39.29 
 
 		 240 aa  70.9  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5515  response regulator receiver protein  37.93 
 
 		 134 aa  70.5  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26471  two-component response regulator  36.7 
 
 		 268 aa  70.5  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.889517 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2457  response regulator homolog PhoB (phosphate regulon transcriptional regulatory protein)  35.34 
 
 		 230 aa  70.5  0.00000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.45 
 
 		 236 aa  70.5  0.00000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1102  DNA-binding response regulator  36.44 
 
 		 225 aa  70.5  0.00000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2781  two component transcriptional regulator  35.14 
 
 		 241 aa  70.5  0.00000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1473  response regulator receiver protein  32.84 
 
 		 477 aa  70.1  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4734  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.77 
 
 		 798 aa  70.1  0.00000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00660973 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13275  two component system sensor transduction transcriptional regulatory protein mtrA  34.82 
 
 		 228 aa  70.1  0.00000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.656178 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>