More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0681 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0681  DNA-binding response regulator  100 
 
 		 246 aa  505  9.999999999999999e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.63003  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2483  two component transcriptional regulator  47.01 
 
 		 233 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2936  two component transcriptional regulator  46.15 
 
 		 233 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2315  two component transcriptional regulator  46.15 
 
 		 233 aa  215  4e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3454  winged helix family two component transcriptional regulator  46.15 
 
 		 279 aa  215  5e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.631289 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2892  two component transcriptional regulator  46.15 
 
 		 233 aa  214  7e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.440569  normal  0.202196 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2259  response regulator protein  45.76 
 
 		 288 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.625515  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1739  DNA-binding response regulator  45.76 
 
 		 240 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.203383  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3571  two component transcriptional regulator  46.38 
 
 		 232 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000262211  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0934  DNA-binding response regulator  45.76 
 
 		 240 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.273948  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1019  DNA-binding response regulator  45.76 
 
 		 240 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.79357  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0290  response regulator receiver domain-containing protein  45.22 
 
 		 236 aa  209  2e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.870097  hitchhiker  0.0000582863 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3172  DNA-binding response regulator  47.62 
 
 		 238 aa  207  1e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3064  response regulator transcription regulator protein  45.38 
 
 		 243 aa  205  5e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.631075  normal  0.38417 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1426  transcriptional regulatory protein RstA  44.67 
 
 		 248 aa  204  7e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.319576  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1144  DNA-binding response regulator  44.92 
 
 		 240 aa  203  2e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0096  DNA-binding response regulator  44.92 
 
 		 240 aa  203  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0972666  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1517  DNA-binding response regulator  44.92 
 
 		 240 aa  203  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.184346  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1261  two component transcriptional regulator  47.26 
 
 		 241 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.817763 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1236  two component transcriptional regulator  47.26 
 
 		 241 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.178062  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3146  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  45.26 
 
 		 234 aa  193  2e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.119762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4494  two component transcriptional regulator  45.57 
 
 		 241 aa  191  8e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.272926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1334  two component transcriptional regulator  45.99 
 
 		 241 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.588074  normal  0.126015 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0871  two component transcriptional regulator  45.99 
 
 		 241 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1352  two component transcriptional regulator  45.99 
 
 		 241 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4222  two-component response regulator  44.07 
 
 		 236 aa  188  5e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.560932  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41260  putative two-component response regulator  40.77 
 
 		 235 aa  188  7e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.923976 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0196  two component transcriptional regulator  44.35 
 
 		 238 aa  188  8e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000815382  hitchhiker  0.00535544 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2259  osmolarity response regulator  39.76 
 
 		 257 aa  187  1e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0634187  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3498  putative two-component response regulator  40.34 
 
 		 235 aa  187  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0401889  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3142  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.45 
 
 		 245 aa  186  3e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.237256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49440  two-component response regulator  44.02 
 
 		 236 aa  185  5e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000474992  normal  0.747521 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2022  two component transcriptional regulator  43.91 
 
 		 238 aa  185  6e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.730555 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3391  two component transcriptional regulator  41.3 
 
 		 235 aa  185  6e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1181  winged helix family two component transcriptional regulator  44.54 
 
 		 232 aa  184  9e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.037877  normal  0.73042 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1211  two component transcriptional regulator  44.54 
 
 		 232 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.676109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0550  two component transcriptional regulator  43.53 
 
 		 229 aa  184  1.0000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000958325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0938  DNA-binding response regulator  43.97 
 
 		 234 aa  184  1.0000000000000001e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000299191  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2325  two component transcriptional regulator  43.91 
 
 		 238 aa  184  1.0000000000000001e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0521181  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01694  two component response regulator transcription regulator protein  44.35 
 
 		 259 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4245  two component transcriptional regulator  42.24 
 
 		 240 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0492398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0557  response regulator receiver  44.3 
 
 		 234 aa  183  3e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2321  two component transcriptional regulator  42.19 
 
 		 244 aa  182  4.0000000000000006e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.483652  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0473  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.97 
 
 		 229 aa  182  4.0000000000000006e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.586818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1193  two component transcriptional regulator  44.1 
 
 		 232 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0519929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0844  two component transcriptional regulator  43.86 
 
 		 231 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000690184  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3978  two component transcriptional regulator  43.42 
 
 		 234 aa  182  6e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.832558 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3184  two component transcriptional regulator  39.48 
 
 		 237 aa  181  9.000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0220819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4235  two component transcriptional regulator  43.67 
 
 		 232 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.207223  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3594  transcriptional regulatory protein RstA, putative  39.06 
 
 		 237 aa  180  2e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0669  two component transcriptional regulator  42.17 
 
 		 239 aa  180  2e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.851863  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3006  two component transcriptional regulator  39.06 
 
 		 237 aa  180  2e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000324706  normal  0.0671955 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3087  two component transcriptional regulator  39.06 
 
 		 237 aa  180  2e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000126315  normal  0.467683 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3062  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  43.86 
 
 		 234 aa  179  2e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1672  DNA-binding response regulator  40.59 
 
 		 247 aa  178  7e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0749  two component transcriptional regulator  42.98 
 
 		 234 aa  178  8e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.326027  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3690  two component transcriptional regulator  42.98 
 
 		 234 aa  178  8e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.038332  normal  0.0151663 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3569  two component transcriptional regulator  42.98 
 
 		 234 aa  178  8e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.401849  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3501  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.98 
 
 		 234 aa  178  8e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03257  osmolarity response regulator  38.03 
 
 		 239 aa  178  9e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1010  two component transcriptional regulator  38.63 
 
 		 237 aa  178  9e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000199702  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03209  hypothetical protein  38.03 
 
 		 239 aa  178  9e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1071  two component transcriptional regulator  38.2 
 
 		 237 aa  177  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000676378  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1002  two component transcriptional regulator  38.2 
 
 		 237 aa  177  1e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000471824  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3287  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.2 
 
 		 237 aa  177  1e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000200523  normal  0.324308 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3392  two component transcriptional regulator  42.13 
 
 		 239 aa  177  1e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000345034  normal  0.431956 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1104  two component transcriptional regulator  38.2 
 
 		 237 aa  177  1e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00308001  normal  0.0226787 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0981  two component transcriptional regulator  39.48 
 
 		 237 aa  177  2e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0593139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0510  two component transcriptional regulator  40.27 
 
 		 234 aa  177  2e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0308  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.61 
 
 		 239 aa  176  4e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0308  osmolarity response regulator  37.61 
 
 		 239 aa  176  4e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0516186 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0896  two component transcriptional regulator  39.06 
 
 		 237 aa  176  4e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000189871  normal  0.423328 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3703  osmolarity response regulator  37.61 
 
 		 239 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3879  osmolarity response regulator  37.61 
 
 		 239 aa  176  4e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3871  osmolarity response regulator  37.61 
 
 		 239 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000579  putative DNA-binding response regulator  41.38 
 
 		 237 aa  176  4e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00151616  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3686  osmolarity response regulator  37.61 
 
 		 239 aa  176  4e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.550003 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3818  osmolarity response regulator  37.61 
 
 		 239 aa  176  4e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.339561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1783  DNA-binding response regulator  44.12 
 
 		 252 aa  176  4e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3602  osmolarity response regulator  37.61 
 
 		 239 aa  176  4e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3809  osmolarity response regulator  37.61 
 
 		 239 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3700  osmolarity response regulator  37.61 
 
 		 239 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4711  osmolarity response regulator  37.61 
 
 		 239 aa  176  4e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3784  osmolarity response regulator  37.61 
 
 		 239 aa  176  4e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3775  osmolarity response regulator  37.61 
 
 		 239 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3716  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  40.59 
 
 		 247 aa  175  7e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.422774  normal  0.0121745 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2191  DNA-binding response regulator  44.3 
 
 		 245 aa  174  9e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1592  DNA-binding response regulator  44.3 
 
 		 236 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0815  DNA-binding response regulator  44.3 
 
 		 236 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.576858  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0844  DNA-binding response regulator  44.3 
 
 		 236 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4075  osmolarity response regulator  37.61 
 
 		 239 aa  174  9.999999999999999e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0936  DNA-binding response regulator  44.3 
 
 		 236 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1030  two component transcriptional regulator  39.39 
 
 		 237 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000542446  normal  0.656047 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0031  DNA-binding response regulator  44.3 
 
 		 236 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.248418  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0244  osmolarity response regulator  37.61 
 
 		 239 aa  174  9.999999999999999e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3898  osmolarity response regulator  37.61 
 
 		 239 aa  174  9.999999999999999e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05293  hypothetical protein  41.74 
 
 		 237 aa  173  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3980  osmolarity response regulator  37.18 
 
 		 239 aa  174  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.75818  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3741  osmolarity response regulator  37.18 
 
 		 239 aa  173  1.9999999999999998e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0172  osmolarity response regulator  37.18 
 
 		 239 aa  173  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>