294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_1152 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_1152  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  100 
 
 
230 aa  446  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.83381  normal  0.407323 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1113  tRNA/rRNA methyltransferase, SpoU  71.49 
 
 
269 aa  295  3e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.794332  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1173  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  71.49 
 
 
269 aa  272  3e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.141009  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1241  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  71.49 
 
 
269 aa  272  4.0000000000000004e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.488792  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1550  RNA methyltransferase  38.43 
 
 
244 aa  131  7.999999999999999e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0671761  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1234  RNA methyltransferase TrmH, group 1  38.39 
 
 
254 aa  122  5e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.600347  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0827  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  36.36 
 
 
245 aa  122  6e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.293121 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1578  RNA methyltransferase  36.32 
 
 
263 aa  119  4.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.373161  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0645  RNA methyltransferase  36.7 
 
 
251 aa  118  7.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0451004  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1635  tRNA/rRNA methyltransferase  36.32 
 
 
263 aa  118  9e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2949  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  41.33 
 
 
239 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.226864 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2624  RNA methyltransferase  34.21 
 
 
260 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1420  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  35.68 
 
 
257 aa  115  6e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1369  RNA methyltransferase TrmH, group 1  35.81 
 
 
248 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000282911  hitchhiker  0.0000077591 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40430  RNA methyltransferase TrmH, group 1  34.36 
 
 
258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.573027  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3514  RNA methyltransferase  35.56 
 
 
262 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2705  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  37.33 
 
 
253 aa  112  6e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.29092 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2030  RNA methyltransferase  34.88 
 
 
245 aa  111  8.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.433712  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1552  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  36.45 
 
 
245 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000140105 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4615  RNA methyltransferase TrmH, group 1  33.48 
 
 
264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00452302  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1711  hypothetical protein  31.47 
 
 
257 aa  109  3e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1297  RNA methyltransferase  31.84 
 
 
257 aa  109  4.0000000000000004e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69308  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2632  RNA methyltransferase  36.96 
 
 
250 aa  108  5e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.192345 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1711  hypothetical protein  31.03 
 
 
257 aa  108  6e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2687  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  34.26 
 
 
245 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.491891  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14690  putative methyltransferase  33.92 
 
 
257 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4339  RNA methyltransferase  34.38 
 
 
251 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000160755 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1396  RNA methyltransferase  34.53 
 
 
276 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.901296  hitchhiker  0.00503729 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2119  RNA methyltransferase  34.68 
 
 
273 aa  106  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0812  RNA methyltransferase TrmH, group 1  34.4 
 
 
251 aa  106  4e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000476063  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5993  RNA methyltransferase TrmH, group 1  35.43 
 
 
289 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2084  RNA methyltransferase  35.43 
 
 
289 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00462385  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1475  RNA methyltransferase  34.42 
 
 
255 aa  105  5e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5390  RNA methyltransferase TrmH, group 1  34.98 
 
 
289 aa  105  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1235  RNA methyltransferase  31.47 
 
 
241 aa  105  5e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.207917  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3629  RNA methyltransferase  30.29 
 
 
244 aa  105  6e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00284913  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01053  rRNA methylase  31.9 
 
 
239 aa  105  6e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1258  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  35.87 
 
 
245 aa  105  7e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00338281  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4813  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  36.09 
 
 
248 aa  105  9e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.695937  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1296  putative methyltransferase  33.48 
 
 
308 aa  104  9e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2281  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  34.65 
 
 
245 aa  104  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0794239  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004362  tRNA:Cm32/Um32 methyltransferase  31.9 
 
 
239 aa  104  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00237949  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1517  RNA methyltransferase  31.62 
 
 
276 aa  104  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.9954 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1989  RNA methyltransferase  36.04 
 
 
273 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.418465 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1161  RNA methyltransferase TrmH, group 1  35.65 
 
 
256 aa  103  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000875813  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1242  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  31.09 
 
 
241 aa  103  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.626014  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1620  RNA methyltransferase TrmH, group 1  33.06 
 
 
278 aa  103  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.298646 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1795  RNA methyltransferase  35.48 
 
 
249 aa  103  3e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.313918  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0941  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  34.32 
 
 
250 aa  103  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1116  RNA methyltransferase TrmH, group 1  37 
 
 
314 aa  102  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2103  RNA methyltransferase  35.43 
 
 
289 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.247201 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0869  RNA methyltransferase  32.48 
 
 
279 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.164985  normal  0.267349 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1166  RNA methyltransferase  32.47 
 
 
257 aa  101  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000032697  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0839  RNA methyltransferase  32.48 
 
 
251 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.742035  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1274  RNA methyltransferase  32.47 
 
 
257 aa  101  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000271019  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2517  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  34.05 
 
 
353 aa  101  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127237  hitchhiker  0.00000580733 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0441  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  31.28 
 
 
248 aa  101  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0437  RNA methyltransferase  32.47 
 
 
257 aa  101  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.293753  hitchhiker  0.0000675678 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1245  RNA methyltransferase  35.19 
 
 
260 aa  100  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1843  RNA methyltransferase TrmH family, group 1  35.65 
 
 
257 aa  100  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1682  RNA methyltransferase TrmH, group 1  30.49 
 
 
254 aa  100  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3033  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  30.25 
 
 
241 aa  100  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0996868  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3468  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  32.76 
 
 
245 aa  99.8  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.19102  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3506  RNA methyltransferase  30.21 
 
 
240 aa  100  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.899672 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4224  TrmA family RNA methyltransferase  31.62 
 
 
245 aa  99.8  3e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1411  RNA methyltransferase  28.09 
 
 
267 aa  100  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.993978  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3144  RNA methyltransferase  32.33 
 
 
245 aa  99.4  4e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.317738  normal  0.930486 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5766  RNA methyltransferase  34.5 
 
 
261 aa  99.4  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0275  RNA methyltransferase  29.91 
 
 
244 aa  98.6  7e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00988641  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11341  tRNA/rRNA methyltransferase  29.28 
 
 
246 aa  98.2  9e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.427943  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0819  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  33.91 
 
 
256 aa  97.8  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0412147  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0882  RNA methyltransferase  32.05 
 
 
251 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00955273 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0670  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  33.91 
 
 
256 aa  97.8  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.373785  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2552  RNA methyltransferase  37.27 
 
 
303 aa  97.8  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3150  RNA methyltransferase  37.27 
 
 
303 aa  97.1  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1663  RNA methyltransferase  37.27 
 
 
306 aa  97.1  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.165856  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2688  RNA methyltransferase  37.27 
 
 
346 aa  97.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.110135  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0974  RNA methyltransferase  31.88 
 
 
253 aa  96.7  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1935  RNA methyltransferase  37.17 
 
 
338 aa  97.4  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.136994  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1155  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  35.24 
 
 
266 aa  97.1  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.043355 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2062  tRNA/rRNA methyltransferase, TrmH family, group 1  35.19 
 
 
247 aa  97.1  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.260682  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1440  RNA methyltransferase  37.27 
 
 
303 aa  97.1  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.302799  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2427  RNA methyltransferase  29.87 
 
 
240 aa  97.4  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2167  RNA methyltransferase  37.27 
 
 
303 aa  97.1  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2604  RNA methyltransferase  37.27 
 
 
311 aa  97.1  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.574279  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1322  RNA methyltransferase  28.76 
 
 
254 aa  97.4  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000628419  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1577  RNA methyltransferase TrmH, group 1  29.96 
 
 
410 aa  95.9  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.68355  normal  0.0119734 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1197  RNA methyltransferase  34.73 
 
 
289 aa  95.9  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0280134 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2161  RNA methyltransferase TrmH, group 1  33.48 
 
 
246 aa  95.9  5e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00198375  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2753  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  33.33 
 
 
244 aa  95.1  7e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0620173  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1816  RNA methyltransferase  29.65 
 
 
241 aa  95.1  8e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00001341  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4570  RNA methyltransferase  35.09 
 
 
298 aa  95.1  9e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0223529  normal  0.0756262 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2846  RNA methyltransferase TrmH, group 1  31.69 
 
 
274 aa  94.7  9e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1079  RNA methyltransferase TrmH  36.65 
 
 
289 aa  94.7  9e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130635  normal  0.179328 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1148  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  33.78 
 
 
262 aa  94.7  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1736  RNA methyltransferase  29.33 
 
 
241 aa  95.1  9e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000887935  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2283  RNA methyltransferase  29.65 
 
 
241 aa  94.7  9e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000130955  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2261  RNA methyltransferase  28.89 
 
 
241 aa  94.4  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3341  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  33.19 
 
 
245 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01352  putative tRNA/rRNA methyltransferase (trmH family) protein  29.82 
 
 
261 aa  93.6  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0228097  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>