106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3336 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_3336  hypothetical protein  100 
 
 		 280 aa  547  1e-155  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0967005  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3417  hypothetical protein  90.39 
 
 		 281 aa  487  1e-137  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.60033  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3481  hypothetical protein  90.39 
 
 		 281 aa  485  1e-136  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.895506  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3402  Tol-Pal system YbgF  59.55 
 
 		 291 aa  309  4e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.517203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3115  TPR repeat-containing protein  32.95 
 
 		 308 aa  122  6e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.479676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2094  tetratricopeptide TPR_2  32.04 
 
 		 259 aa  65.1  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127674  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2337  tetratricopeptide region  25 
 
 		 274 aa  64.3  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000123403  normal  0.0632651 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0826  tol-pal system protein YbgF  26.19 
 
 		 271 aa  61.2  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000523116  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2712  hypothetical protein  33.33 
 
 		 304 aa  60.1  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.228832  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0797  TPR repeat-containing protein  26.56 
 
 		 252 aa  59.3  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.146467  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1627  transmembrane protein  26.15 
 
 		 284 aa  59.3  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1986  tetratricopeptide TPR_2  26.18 
 
 		 253 aa  58.5  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.396777  normal  0.343263 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1013  TPR repeat-containing protein  26.5 
 
 		 265 aa  58.5  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0465  TPR repeat-containing protein  29.59 
 
 		 377 aa  57.4  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3692  tetratricopeptide domain-containing protein  31.91 
 
 		 239 aa  57.4  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000893452  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3396  tol-pal system protein YbgF  29.63 
 
 		 260 aa  57  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14649  normal  0.0107304 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2457  tol-pal system protein YbgF  25.11 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184119  normal  0.990213 
 
 
-
 
NC_004310  BR1693  hypothetical protein  28.69 
 
 		 488 aa  55.1  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1637  TPR repeat-containing molluscan rhodopsin  28.69 
 
 		 488 aa  55.1  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0780  tol-pal system protein YbgF  29.91 
 
 		 265 aa  55.5  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.295121  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2552  putative lipoprotein  26.79 
 
 		 242 aa  54.3  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1348  putative transmembrane protein  23.31 
 
 		 263 aa  54.3  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3198  tol-pal system protein YbgF  29.13 
 
 		 329 aa  54.7  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2694  tol-pal system protein YbgF  24.88 
 
 		 249 aa  54.7  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.799703  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2048  TPR repeat-containing protein  25.54 
 
 		 253 aa  53.5  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.400973  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3493  tol-pal system protein YbgF  28.16 
 
 		 328 aa  53.5  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.250731  normal  0.0902147 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0757  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 264 aa  53.1  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00702  hypothetical protein  25.41 
 
 		 263 aa  52.8  0.000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000422433  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0796  tol-pal system protein YbgF  25.41 
 
 		 263 aa  52.8  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  5.27837e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0771  tol-pal system protein YbgF  25.41 
 
 		 263 aa  52.8  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000973622  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2913  tol-pal system protein YbgF  25.41 
 
 		 263 aa  52.8  0.000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000329093  normal  0.329929 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0664  tol-pal system protein YbgF  25.41 
 
 		 263 aa  52.8  0.000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000123566  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0845  tol-pal system protein YbgF  25.41 
 
 		 263 aa  52.8  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000128041  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00691  hypothetical protein  25.41 
 
 		 263 aa  52.8  0.000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000612768  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2893  tol-pal system protein YbgF  25.66 
 
 		 263 aa  52.8  0.000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  7.77215e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0765  tol-pal system protein YbgF  25.41 
 
 		 263 aa  52.8  0.000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000135641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2673  TPR repeat-containing protein  26.09 
 
 		 252 aa  52.4  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00423772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1221  Tol-Pal system YbgF  27.05 
 
 		 505 aa  52.4  0.000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2937  tetratricopeptide TPR_2  23.04 
 
 		 251 aa  52  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0022329  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2866  tol-pal system protein YbgF  25.51 
 
 		 269 aa  51.6  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.8827e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1399  tol-pal system protein YbgF  25.51 
 
 		 269 aa  51.6  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000306098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2954  tol-pal system protein YbgF  25.51 
 
 		 269 aa  51.6  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000655346  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0813  tol-pal system protein YbgF  24.85 
 
 		 262 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0133975  normal  0.688577 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0877  tol-pal system protein YbgF  24.85 
 
 		 262 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000691126  normal  0.439363 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0016  hypothetical protein  26.3 
 
 		 293 aa  52  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.436683  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0023  TPR domain-containing protein  29.63 
 
 		 278 aa  51.2  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.165753  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3542  TPR repeat-containing protein  25.51 
 
 		 271 aa  51.6  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000161801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3922  putative transmembrane protein  23.08 
 
 		 249 aa  51.2  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.111011  hitchhiker  0.00736661 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0909  tol-pal system protein YbgF  25.41 
 
 		 262 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000119726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3515  tol-pal system protein YbgF  25.93 
 
 		 283 aa  51.2  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000012222  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0786  tol-pal system protein YbgF  25.66 
 
 		 262 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000180184  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0846  tol-pal system protein YbgF  25.66 
 
 		 262 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00125289  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1733  TPR domain-containing protein  21.88 
 
 		 263 aa  50.4  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.402225  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1725  TPR repeat-containing protein  25.86 
 
 		 261 aa  50.4  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.039074 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1240  tol-pal system protein YbgF  25.53 
 
 		 264 aa  50.8  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000229086  normal  0.061063 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1281  tol-pal system protein YbgF  27.84 
 
 		 266 aa  50.4  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000295525  decreased coverage  0.00000450337 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0484  tol-pal system protein YbgF  31.15 
 
 		 318 aa  50.4  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1979  tol-pal system protein YbgF  25.86 
 
 		 261 aa  50.4  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1158  tol-pal system protein YbgF  24.49 
 
 		 269 aa  50.1  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1912  TPR repeat-containing protein  23.13 
 
 		 287 aa  49.7  0.00005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2900  tol-pal system protein YbgF  23.4 
 
 		 272 aa  49.7  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000143705  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1209  hypothetical protein  39.13 
 
 		 286 aa  49.7  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3038  TPR domain-containing protein  22.91 
 
 		 272 aa  49.3  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2204  TPR repeat-containing protein  21.83 
 
 		 265 aa  48.5  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000773589 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1580  TPR domain-containing protein  29.81 
 
 		 263 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0635876  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1224  hypothetical protein  25.74 
 
 		 268 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.899362 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1158  TPR repeat-containing protein  26.53 
 
 		 257 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.188926  normal  0.17642 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2208  Tol-Pal system YbgF  25.51 
 
 		 275 aa  47.8  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00178877  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3584  tol-pal system protein YbgF  28.57 
 
 		 283 aa  47.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4051  hypothetical protein  23.98 
 
 		 243 aa  47  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1816  hypothetical protein  26.8 
 
 		 321 aa  47  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.18225  normal  0.591091 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1253  Tol-Pal system, YbgF  25.74 
 
 		 268 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0226612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4425  tol-pal system protein YbgF  28.43 
 
 		 283 aa  47.4  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.667598 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3991  tol-pal system protein YbgF  24.75 
 
 		 271 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.721689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0686  tol-pal system protein YbgF  25.77 
 
 		 261 aa  47  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.379534  normal  0.398306 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0590  TPR repeat-containing protein  28.91 
 
 		 294 aa  46.6  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0730  tol-pal system protein YbgF  24.37 
 
 		 261 aa  47  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.18828  normal  0.147951 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0729  TPR repeat-containing protein  24.19 
 
 		 255 aa  46.6  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.032974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0537  tol-pal system protein YbgF  30.97 
 
 		 321 aa  46.2  0.0006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0161881  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4194  tol-pal system protein YbgF  24.75 
 
 		 268 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.90283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0641  tol-pal system protein YbgF  24.07 
 
 		 232 aa  45.8  0.0007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000302592  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0772  tol-pal system protein YbgF  29.13 
 
 		 285 aa  46.2  0.0007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0818446 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5489  tol-pal system protein YbgF  33.33 
 
 		 304 aa  45.8  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39153  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0388  tol-pal system protein YbgF  28.87 
 
 		 325 aa  45.8  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0022084  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3508  TPR repeat-containing protein  27.84 
 
 		 336 aa  45.8  0.0009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.024508  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3970  hypothetical protein  24.75 
 
 		 272 aa  45.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.178755  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4143  hypothetical protein  25.77 
 
 		 345 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3404  TPR repeat-containing protein  25.55 
 
 		 268 aa  45.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535167 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6876  hypothetical protein  26 
 
 		 348 aa  45.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.617207  normal  0.0553562 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2625  Tol-Pal system YbgF  25.24 
 
 		 345 aa  45.4  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.610072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0281  tol-pal system protein YbgF  32.18 
 
 		 313 aa  45.4  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.433103  normal  0.0147653 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3624  tol-pal system protein YbgF  25.24 
 
 		 333 aa  45.4  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1251  tol-pal system protein YbgF  23.47 
 
 		 258 aa  45.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000656344  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1417  TPR repeat-containing protein  24.75 
 
 		 248 aa  44.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.210206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0500  tol-pal system protein YbgF  27.72 
 
 		 343 aa  44.3  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0273  TPR repeat-containing protein  27.84 
 
 		 243 aa  44.7  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0105531  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2196  Tol-Pal system YbgF  20.28 
 
 		 262 aa  44.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.114347  normal  0.506103 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3085  tol-pal system protein YbgF  23.47 
 
 		 258 aa  44.7  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00002995  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3081  Tol-Pal system YbgF  26.8 
 
 		 307 aa  44.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0737  hypothetical protein  23.38 
 
 		 274 aa  43.9  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.790435  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>