79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AnaeK_3417 on replicon NC_011145
Organism: Anaeromyxobacter sp. K



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_3417  hypothetical protein  100 
 
 
281 aa  550  1e-156  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.60033  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3481  hypothetical protein  98.58 
 
 
281 aa  543  1e-154  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.895506  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3336  hypothetical protein  93.59 
 
 
280 aa  471  1e-132  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0967005  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3402  Tol-Pal system YbgF  59.36 
 
 
291 aa  310  1e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.517203  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3115  TPR repeat-containing protein  32.43 
 
 
308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.479676  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2337  tetratricopeptide region  25.51 
 
 
274 aa  63.5  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000123403  normal  0.0632651 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2094  tetratricopeptide TPR_2  29.13 
 
 
259 aa  62.4  0.000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127674  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1348  putative transmembrane protein  24.89 
 
 
263 aa  60.1  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1013  TPR repeat-containing protein  26.41 
 
 
265 aa  58.5  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0826  tol-pal system protein YbgF  26.47 
 
 
271 aa  58.9  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000523116  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3692  tetratricopeptide domain-containing protein  30.77 
 
 
239 aa  56.2  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000893452  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3396  tol-pal system protein YbgF  23.91 
 
 
260 aa  55.8  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14649  normal  0.0107304 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2048  TPR repeat-containing protein  25.43 
 
 
253 aa  54.3  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.400973  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2694  tol-pal system protein YbgF  24.88 
 
 
249 aa  54.3  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.799703  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0465  TPR repeat-containing protein  27.55 
 
 
377 aa  53.9  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1979  tol-pal system protein YbgF  24.31 
 
 
261 aa  53.1  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2712  hypothetical protein  29.52 
 
 
304 aa  53.1  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.228832  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1725  TPR repeat-containing protein  24.31 
 
 
261 aa  53.1  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.039074 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0780  tol-pal system protein YbgF  28.97 
 
 
265 aa  52.8  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.295121  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1986  tetratricopeptide TPR_2  23.79 
 
 
253 aa  52.8  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.396777  normal  0.343263 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2457  tol-pal system protein YbgF  23.42 
 
 
249 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184119  normal  0.990213 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0797  TPR repeat-containing protein  24.6 
 
 
252 aa  51.2  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.146467  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2893  tol-pal system protein YbgF  24.78 
 
 
263 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  7.77215e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00691  hypothetical protein  24.78 
 
 
263 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000612768  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0796  tol-pal system protein YbgF  24.78 
 
 
263 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  5.27837e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0771  tol-pal system protein YbgF  24.78 
 
 
263 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000973622  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2913  tol-pal system protein YbgF  24.78 
 
 
263 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000329093  normal  0.329929 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0845  tol-pal system protein YbgF  24.78 
 
 
263 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000128041  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0765  tol-pal system protein YbgF  24.78 
 
 
263 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000135641  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0664  tol-pal system protein YbgF  24.78 
 
 
263 aa  50.4  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000123566  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00702  hypothetical protein  24.78 
 
 
263 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000422433  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1627  transmembrane protein  25.13 
 
 
284 aa  50.4  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0590  TPR repeat-containing protein  28.91 
 
 
294 aa  50.1  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3038  TPR domain-containing protein  24.26 
 
 
272 aa  50.1  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3198  tol-pal system protein YbgF  26.8 
 
 
329 aa  49.7  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0757  TPR repeat-containing protein  27.62 
 
 
264 aa  49.7  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0909  tol-pal system protein YbgF  24.78 
 
 
262 aa  49.7  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000119726  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1912  TPR repeat-containing protein  22.78 
 
 
287 aa  49.3  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0877  tol-pal system protein YbgF  23.64 
 
 
262 aa  49.3  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000691126  normal  0.439363 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0813  tol-pal system protein YbgF  23.64 
 
 
262 aa  49.3  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0133975  normal  0.688577 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0846  tol-pal system protein YbgF  24.78 
 
 
262 aa  49.3  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00125289  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0786  tol-pal system protein YbgF  24.78 
 
 
262 aa  49.3  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000180184  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1637  TPR repeat-containing molluscan rhodopsin  27.05 
 
 
488 aa  48.9  0.00009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1693  hypothetical protein  27.05 
 
 
488 aa  48.9  0.00009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1209  hypothetical protein  39.13 
 
 
286 aa  48.9  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116621  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1240  tol-pal system protein YbgF  24.47 
 
 
264 aa  48.5  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000229086  normal  0.061063 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3515  tol-pal system protein YbgF  24.72 
 
 
283 aa  48.9  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000012222  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1580  TPR domain-containing protein  30.77 
 
 
263 aa  48.1  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0635876  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2673  TPR repeat-containing protein  24.75 
 
 
252 aa  48.9  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00423772  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0484  tol-pal system protein YbgF  29.51 
 
 
318 aa  47.4  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0388  tol-pal system protein YbgF  28.87 
 
 
325 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0022084  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2866  tol-pal system protein YbgF  24.49 
 
 
269 aa  48.1  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.8827e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3493  tol-pal system protein YbgF  26.04 
 
 
328 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.250731  normal  0.0902147 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2937  tetratricopeptide TPR_2  23.56 
 
 
251 aa  48.1  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0022329  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1399  tol-pal system protein YbgF  24.49 
 
 
269 aa  48.1  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000306098  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2954  tol-pal system protein YbgF  24.49 
 
 
269 aa  48.1  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000655346  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2552  putative lipoprotein  26.22 
 
 
242 aa  47  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1158  tol-pal system protein YbgF  24.27 
 
 
269 aa  47  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3584  tol-pal system protein YbgF  28.43 
 
 
283 aa  46.6  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3922  putative transmembrane protein  23.83 
 
 
249 aa  47  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.111011  hitchhiker  0.00736661 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1221  Tol-Pal system YbgF  25.41 
 
 
505 aa  46.6  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1281  tol-pal system protein YbgF  25.77 
 
 
266 aa  46.2  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000295525  decreased coverage  0.00000450337 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2900  tol-pal system protein YbgF  22.34 
 
 
272 aa  45.8  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000143705  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1158  TPR repeat-containing protein  26.53 
 
 
257 aa  45.8  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.188926  normal  0.17642 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3404  TPR repeat-containing protein  21.56 
 
 
268 aa  45.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.535167 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0016  hypothetical protein  25.97 
 
 
293 aa  45.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.436683  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4051  hypothetical protein  24.62 
 
 
243 aa  45.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1733  TPR domain-containing protein  21.43 
 
 
263 aa  44.3  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.402225  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4425  tol-pal system protein YbgF  27.92 
 
 
283 aa  44.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.667598 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5489  tol-pal system protein YbgF  32.18 
 
 
304 aa  43.5  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39153  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2208  Tol-Pal system YbgF  29.31 
 
 
275 aa  43.9  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00178877  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0281  tol-pal system protein YbgF  31.03 
 
 
313 aa  43.5  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.433103  normal  0.0147653 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2204  TPR repeat-containing protein  20.89 
 
 
265 aa  43.1  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000773589 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0641  tol-pal system protein YbgF  22.22 
 
 
232 aa  42.7  0.006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000302592  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1224  hypothetical protein  22.77 
 
 
268 aa  42.7  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.899362 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0772  tol-pal system protein YbgF  28.16 
 
 
285 aa  42.4  0.008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0818446 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1251  tol-pal system protein YbgF  22.45 
 
 
258 aa  42.4  0.008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000656344  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1816  hypothetical protein  24.74 
 
 
321 aa  42.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.18225  normal  0.591091 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3085  tol-pal system protein YbgF  22.45 
 
 
258 aa  42.4  0.009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00002995  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>