More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3271 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_3271  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 607 aa  1223    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2573  hypothetical protein  42.75 
 
 		 260 aa  239  1e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000474072  normal  0.0702383 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0765  UvrD/REP helicase  23.54 
 
 		 669 aa  134  6e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000586014  normal  0.102674 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2665  UvrD/REP helicase  27.73 
 
 		 573 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.997646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3223  UvrD/REP helicase  30.92 
 
 		 591 aa  100  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3542  UvrD/REP helicase  27.03 
 
 		 672 aa  95.1  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.634729 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1620  hypothetical protein  25.96 
 
 		 667 aa  94  7e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0675  UvrD/REP helicase  23.27 
 
 		 599 aa  92.4  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.771705 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2289  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  25.98 
 
 		 542 aa  88.6  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.121386  normal  0.561686 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3145  hypothetical protein  27.63 
 
 		 640 aa  85.1  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0241  UvrD/REP helicase  26.67 
 
 		 706 aa  81.6  0.00000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf847  ATP-dependent DNA helicase  25.97 
 
 		 726 aa  80.1  0.0000000000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.710587  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1021  UvrD/REP helicase  25.63 
 
 		 783 aa  79  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.751613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1873  UvrD/REP helicase  26.23 
 
 		 591 aa  78.6  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.100548  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0222  UvrD/REP helicase  21.59 
 
 		 666 aa  78.6  0.0000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000045018  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0481  UvrD/REP helicase  28.62 
 
 		 736 aa  77.8  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3773  UvrD/REP helicase  26.97 
 
 		 787 aa  77.8  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0754  ATP-dependent DNA helicase Rep  21.69 
 
 		 587 aa  77  0.0000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.643559  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1807  UvrD/REP helicase  27.02 
 
 		 710 aa  77  0.0000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.388525  normal  0.14229 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4600  UvrD/REP helicase  26.9 
 
 		 758 aa  75.9  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000134986  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0661  UvrD/REP helicase  25.29 
 
 		 708 aa  73.2  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.612479  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00200  DNA helicase II  28.16 
 
 		 723 aa  72.4  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.105669  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5487  putative ATP-dependent DNA helicase Rep  27.3 
 
 		 591 aa  72.4  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2355  UvrD/REP helicase  26.93 
 
 		 724 aa  72  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000607129  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1007  UvrD/REP helicase  25.34 
 
 		 738 aa  71.6  0.00000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4154  UvrD/REP helicase  25.2 
 
 		 545 aa  71.2  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0874139 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1108  ATP-dependent DNA helicase PcrA  22.8 
 
 		 686 aa  71.2  0.00000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1771  UvrD/REP helicase  27.55 
 
 		 508 aa  71.2  0.00000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.734897  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3411  ATP-dependent DNA helicase PcrA, putative  29.66 
 
 		 739 aa  70.9  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1397  UvrD/REP helicase  26.75 
 
 		 625 aa  70.9  0.00000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.477297  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0497  DNA-dependent helicase II  27.96 
 
 		 726 aa  70.9  0.00000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.615928  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1681  ATP-dependent exoDNAse beta subunit  46.84 
 
 		 1217 aa  70.9  0.00000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0595  UvrD/REP helicase  29.96 
 
 		 790 aa  70.9  0.00000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.77908 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1845  UvrD/REP helicase  28.79 
 
 		 620 aa  70.9  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1196  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.07 
 
 		 738 aa  70.5  0.00000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1855  recombination helicase AddA  33.81 
 
 		 1282 aa  70.5  0.00000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0546193 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6513  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.17 
 
 		 781 aa  70.5  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0699  UvrD/Rep family helicase  24.73 
 
 		 689 aa  69.7  0.0000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2876  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.43 
 
 		 741 aa  69.7  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1171  UvrD/REP helicase  26.62 
 
 		 1132 aa  70.1  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_979  UvrD/REP helicase  25.07 
 
 		 738 aa  70.1  0.0000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0317  UvrD/REP helicase  28.4 
 
 		 1032 aa  69.3  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.907606  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1285  UvrD/REP helicase  21.6 
 
 		 714 aa  69.7  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000916129  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3743  UvrD/REP helicase  27.14 
 
 		 702 aa  68.9  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0471553  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0779  UvrD/REP helicase  25.27 
 
 		 630 aa  68.9  0.0000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2537  UvrD/REP helicase  28.46 
 
 		 672 aa  68.9  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.423083  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0381  UvrD/REP helicase  30.26 
 
 		 688 aa  68.2  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0971471 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0849  UvrD/REP helicase  30.04 
 
 		 845 aa  68.2  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.462782  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1831  UvrD/REP helicase  26.57 
 
 		 779 aa  68.6  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.04 
 
 		 742 aa  67.4  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0413312  decreased coverage  0.000000100763 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2560  putative ATP-dependent DNA helicase, Rep  25.81 
 
 		 520 aa  67.4  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.742452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0050  ATP-dependent DNA helicase Rep  28.91 
 
 		 658 aa  67  0.0000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0153579  normal  0.502615 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0670  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.49 
 
 		 833 aa  66.6  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.117887 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4326  UvrD/REP helicase  27.4 
 
 		 744 aa  66.6  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0144266  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0035  DNA-dependent helicase II  24.3 
 
 		 723 aa  66.2  0.000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.193678  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2059  ATP-dependent DNA helicase Rep  28.21 
 
 		 763 aa  66.6  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.439478  normal  0.531774 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0043  DNA-dependent helicase II  24.3 
 
 		 723 aa  67  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.779926  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0004  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  41.77 
 
 		 1203 aa  67  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0502  UvrD/REP helicase  24.03 
 
 		 620 aa  67  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5130  DNA-dependent helicase II  28.46 
 
 		 729 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.228367 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2475  UvrD/REP helicase  27.61 
 
 		 717 aa  65.9  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000259044 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl566  repair endonuclease ATP-dependent DNA helicase  26.67 
 
 		 723 aa  66.2  0.000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000546872  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0437  UvrD/REP helicase  24.71 
 
 		 682 aa  66.2  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0717  ATP-dependent DNA helicase pcrA  22.22 
 
 		 722 aa  65.9  0.000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0979617  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1426  UvrD/REP helicase  28.41 
 
 		 817 aa  65.9  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.854677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4079  DNA helicase II  27.5 
 
 		 724 aa  65.5  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2863  ATP-dependent DNA helicase UvrD  28.33 
 
 		 725 aa  66.2  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1460  UvrD/REP helicase  28.2 
 
 		 804 aa  65.9  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.373759  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0351  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.32 
 
 		 753 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4969  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.32 
 
 		 753 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1179  UvrD/REP helicase  26.12 
 
 		 701 aa  65.5  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0987227 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0064  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  24.34 
 
 		 689 aa  65.5  0.000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10008  putative helicase  25.44 
 
 		 773 aa  65.1  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1633  UvrD/REP helicase  22.71 
 
 		 681 aa  65.1  0.000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0903  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.47 
 
 		 662 aa  65.1  0.000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000149159  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0291  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.75 
 
 		 751 aa  64.7  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0209  DNA-dependent helicase II  27.34 
 
 		 720 aa  65.1  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0286  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.34 
 
 		 747 aa  65.1  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0305  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.75 
 
 		 747 aa  64.7  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0254  UvrD/REP helicase  29.5 
 
 		 1232 aa  65.1  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.764036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0959  UvrD/REP helicase  29.7 
 
 		 705 aa  65.1  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0545  DNA-dependent helicase II  27.34 
 
 		 720 aa  64.7  0.000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1222  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.1 
 
 		 758 aa  64.7  0.000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1050  UvrD/REP helicase  28.68 
 
 		 597 aa  65.1  0.000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4007  DNA-dependent helicase II  27.34 
 
 		 720 aa  65.1  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.984144  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1142  ATP-dependent DNA helicase UvrD  25 
 
 		 788 aa  65.1  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.140222 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0336  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.67 
 
 		 751 aa  64.7  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0334  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.67 
 
 		 747 aa  64.7  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0275  ATP-dependent DNA helicase  24.67 
 
 		 753 aa  64.7  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0278  ATP-dependent DNA helicase  24.67 
 
 		 751 aa  64.7  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0098  UvrD/REP helicase  28.83 
 
 		 779 aa  64.7  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.404442 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0377  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.67 
 
 		 751 aa  64.7  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4162  DNA-dependent helicase II  27.04 
 
 		 720 aa  64.3  0.000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0353617  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3655  UvrD/REP helicase  23.94 
 
 		 774 aa  64.3  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2424  UvrD/REP helicase  29.12 
 
 		 725 aa  64.3  0.000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4332  DNA-dependent helicase II  26.95 
 
 		 720 aa  64.3  0.000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3458  UvrD/REP helicase  47.14 
 
 		 762 aa  64.3  0.000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2348  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.35 
 
 		 730 aa  63.9  0.000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0164573  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1488  UvrD/REP helicase  24.16 
 
 		 659 aa  63.9  0.000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3362  UvrD family helicase  23.2 
 
 		 630 aa  63.5  0.000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.753608  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>