More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0765 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0765  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 669 aa  1379    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000586014  normal  0.102674 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3271  UvrD/REP helicase  22.3 
 
 		 607 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2573  hypothetical protein  34.07 
 
 		 260 aa  118  3.9999999999999997e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000474072  normal  0.0702383 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2665  UvrD/REP helicase  22.53 
 
 		 573 aa  110  8.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.997646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3223  UvrD/REP helicase  21.37 
 
 		 591 aa  92  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2289  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  21.7 
 
 		 542 aa  83.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.121386  normal  0.561686 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1719  UvrD/REP helicase  21.74 
 
 		 646 aa  82.4  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.571128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0502  UvrD/REP helicase  20.97 
 
 		 620 aa  82  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0047  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.62 
 
 		 849 aa  80.1  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.760315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1397  UvrD/REP helicase  24.6 
 
 		 625 aa  79.7  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.477297  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2355  UvrD/REP helicase  22.93 
 
 		 724 aa  79.3  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000607129  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1021  UvrD/REP helicase  26.63 
 
 		 783 aa  79.7  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.751613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5487  putative ATP-dependent DNA helicase Rep  20.6 
 
 		 591 aa  79  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0864  ATP-dependent DNA helicase UvrD  24.48 
 
 		 786 aa  78.2  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3376  UvrD/REP helicase  22.84 
 
 		 659 aa  78.2  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3145  hypothetical protein  24.1 
 
 		 640 aa  77.4  0.0000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0675  UvrD/REP helicase  27.12 
 
 		 599 aa  76.6  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.771705 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2560  putative ATP-dependent DNA helicase, Rep  20.75 
 
 		 520 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.742452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1222  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.94 
 
 		 758 aa  76.3  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0577  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.03 
 
 		 743 aa  75.5  0.000000000003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.893036  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0222  UvrD/REP helicase  22.4 
 
 		 666 aa  75.5  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000045018  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1306  ATP-dependent DNA helicase  20.71 
 
 		 702 aa  74.3  0.000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0100895  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0963  helicase II - UvrD/PcrA  21.98 
 
 		 638 aa  73.9  0.000000000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1873  UvrD/REP helicase  21.98 
 
 		 786 aa  73.9  0.000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.340872  normal  0.0203553 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0039  UvrD/REP helicase  23.31 
 
 		 599 aa  73.9  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.830062  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0717  ATP-dependent DNA helicase pcrA  25.94 
 
 		 722 aa  73.9  0.000000000008  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0979617  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2335  ATP-dependent DNA helicase UvrD  23.18 
 
 		 745 aa  73.6  0.00000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000479464  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.77 
 
 		 742 aa  73.2  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0413312  decreased coverage  0.000000100763 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1363  UvrD/REP helicase  21.75 
 
 		 787 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.485952 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0994  superfamily I DNA/RNA helicase  22.93 
 
 		 770 aa  73.6  0.00000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1806  DNA-dependent helicase II  24.25 
 
 		 721 aa  72.8  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1807  DNA-dependent helicase II  24.25 
 
 		 721 aa  72.8  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1847  DNA helicase II  22.02 
 
 		 787 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.478149  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1692  DNA helicase II  22.02 
 
 		 787 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1670  DNA helicase II  22.02 
 
 		 787 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0563  UvrD/REP helicase  22.85 
 
 		 743 aa  72.8  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0641932  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2632  DNA helicase II  22.28 
 
 		 787 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0964  UvrD/REP helicase  23.52 
 
 		 735 aa  72.4  0.00000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1322  UvrD/REP helicase  21.75 
 
 		 840 aa  73.2  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1420  UvrD/REP helicase  21.07 
 
 		 787 aa  72  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0732039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2224  UvrD/REP helicase  23.86 
 
 		 659 aa  72  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0928  DNA helicase II  22.02 
 
 		 787 aa  72  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4586  ATP-dependent DNA helicase UvrD  21.07 
 
 		 787 aa  72.4  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.721141 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0421  DNA helicase II  22.02 
 
 		 787 aa  72  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1461  DNA helicase II  22.02 
 
 		 787 aa  72  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.564541  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0742  DNA helicase II  22.02 
 
 		 787 aa  72  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1442  UvrD/REP helicase  21.07 
 
 		 787 aa  72  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1142  ATP-dependent DNA helicase PcrA  22.25 
 
 		 759 aa  71.6  0.00000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00645373  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1581  UvrD/REP helicase  26.76 
 
 		 648 aa  72  0.00000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2822  UvrD/REP helicase  22.24 
 
 		 826 aa  71.6  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.467404 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2629  ATP-dependent DNA helicase UvrD  22.82 
 
 		 787 aa  71.6  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0417333  normal  0.559326 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1532  UvrD/REP helicase  26.76 
 
 		 648 aa  72  0.00000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0217049  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0080  DNA-dependent helicase II  23.55 
 
 		 724 aa  71.6  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2424  UvrD/REP helicase  22.15 
 
 		 725 aa  71.6  0.00000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0960  UvrD/REP helicase  21.07 
 
 		 846 aa  71.2  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2812  UvrD/REP helicase  23.43 
 
 		 719 aa  71.2  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1590  UvrD/REP helicase  22.83 
 
 		 790 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3483  ATP-dependent DNA helicase Rep  23.55 
 
 		 673 aa  70.1  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2797  UvrD/REP helicase  22.83 
 
 		 783 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265943  normal  0.311866 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2555  ATP-dependent DNA helicase Rep  22.59 
 
 		 671 aa  69.7  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000614472  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2449  ATP-dependent DNA helicase UvrD  20.26 
 
 		 726 aa  69.7  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.170877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4600  UvrD/REP helicase  22.61 
 
 		 758 aa  69.7  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000134986  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1410  UvrD/REP helicase  25.08 
 
 		 676 aa  68.9  0.0000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0222  DNA-dependent helicase II  23.33 
 
 		 734 aa  68.6  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.211627  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1937  UvrD/REP helicase  23.49 
 
 		 726 aa  68.9  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1337  ATP-dependent DNA helicase UvrD  22.83 
 
 		 783 aa  68.9  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl566  repair endonuclease ATP-dependent DNA helicase  24.1 
 
 		 723 aa  68.2  0.0000000004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000546872  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1443  superfamily I DNA/RNA helicase  25.15 
 
 		 920 aa  68.6  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  unclonable  0.000000114812  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5401  DNA-dependent helicase II  21.63 
 
 		 728 aa  68.6  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0541595 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2563  UvrD/REP helicase  21.78 
 
 		 825 aa  67.8  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.309285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3879  ATP-dependent DNA helicase Rep  23.08 
 
 		 663 aa  67.4  0.0000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3411  ATP-dependent DNA helicase PcrA, putative  23.27 
 
 		 739 aa  67.4  0.0000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5352  DNA-dependent helicase II  21.51 
 
 		 728 aa  67.4  0.0000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.138491 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5260  DNA-dependent helicase II  21.51 
 
 		 728 aa  67.4  0.0000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.658271 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2007  UvrD/REP helicase  23.34 
 
 		 714 aa  67  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0358603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2836  DNA helicase II  22.47 
 
 		 858 aa  67  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3589  UvrD/REP helicase  23.69 
 
 		 746 aa  67  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0116142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0484  DNA-dependent helicase II  24.11 
 
 		 722 aa  66.6  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0754  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.56 
 
 		 587 aa  66.6  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.643559  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1693  UvrD/REP helicase  22.51 
 
 		 683 aa  67  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.508868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3397  DNA-dependent helicase II  23.96 
 
 		 727 aa  66.6  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1437  UvrD/REP helicase  26.6 
 
 		 769 aa  65.9  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.618729  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1620  hypothetical protein  27.31 
 
 		 667 aa  66.2  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0398  UvrD/REP helicase  21.81 
 
 		 768 aa  66.2  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0595  UvrD/REP helicase  21.18 
 
 		 790 aa  66.2  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.77908 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3542  UvrD/REP helicase  23.18 
 
 		 672 aa  66.6  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.634729 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1202  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.83 
 
 		 690 aa  65.9  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.44 
 
 		 715 aa  66.2  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3642  DNA-dependent helicase II  21.09 
 
 		 726 aa  65.9  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1445  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.42 
 
 		 757 aa  65.5  0.000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.715662  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5176  UvrD/REP helicase  22.25 
 
 		 573 aa  65.5  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0142  UvrD/REP helicase  22.74 
 
 		 751 aa  65.9  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.750575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1511  UvrD/REP helicase  22.25 
 
 		 573 aa  65.5  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.487565 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2767  UvrD/REP helicase  22.73 
 
 		 848 aa  65.5  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.053662 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2571  DNA-dependent helicase II  22.26 
 
 		 723 aa  65.1  0.000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1514  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.17 
 
 		 755 aa  65.1  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0787  UvrD/REP helicase  21.73 
 
 		 800 aa  65.1  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.82156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3223  UvrD/REP helicase  20.27 
 
 		 1075 aa  65.1  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.124845 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0721  UvrD/REP helicase  24.92 
 
 		 656 aa  65.1  0.000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0029  DNA-dependent helicase II  22.1 
 
 		 720 aa  65.1  0.000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>