135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0988 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0988  thiamine biosynthesis protein ThiS  100 
 
 
67 aa  129  1.0000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0800067  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5998  thiamine biosynthesis protein ThiS  53.52 
 
 
81 aa  73.6  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.786244 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1043  ThiS, thiamine-biosynthesis  56.45 
 
 
66 aa  66.6  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3034  thiamine biosynthesis protein ThiS  53.03 
 
 
66 aa  66.6  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00295138  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2782  putative thiamine biosynthesis protein ThiS  51.52 
 
 
66 aa  64.3  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.408989  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1339  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.94 
 
 
66 aa  62.4  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0038066 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1773  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.81 
 
 
72 aa  61.2  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3887  thiamine biosynthesis protein ThiS  46.97 
 
 
66 aa  60.8  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4278  thiamine biosynthesis protein ThiS  48.48 
 
 
66 aa  60.8  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0658142  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0409  thiamine biosynthesis protein ThiS  50 
 
 
65 aa  59.3  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0838013  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2465  ThiS, thiamine-biosynthesis  48.48 
 
 
65 aa  58.2  0.00000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.637315  normal  0.928732 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0146  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 
69 aa  57  0.00000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34640  sulfur carrier protein ThiS  46.77 
 
 
64 aa  55.8  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0439272  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6572  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.24 
 
 
69 aa  55.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922176  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3117  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.59 
 
 
68 aa  55.5  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.295456  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2165  thiamine biosynthesis protein ThiS  50 
 
 
65 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.433282  normal  0.219669 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1555  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.82 
 
 
67 aa  54.3  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.112904 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2892  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.45 
 
 
65 aa  53.9  0.0000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.502448  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002075  sulfur carrier protein ThiS  34.85 
 
 
84 aa  53.1  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0913  thiamine biosynthesis protein ThiS  46.97 
 
 
64 aa  52.8  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1268  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.79 
 
 
67 aa  52.4  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0448831  hitchhiker  0.00213488 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6223  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 
65 aa  52.4  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392752  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1153  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.3 
 
 
68 aa  52.4  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01730  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.59 
 
 
80 aa  51.6  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2780  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.74 
 
 
78 aa  51.6  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0685562  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0536  sulfur carrier protein ThiS  40.91 
 
 
65 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.355428  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00363  sulfur carrier protein ThiS  33.33 
 
 
84 aa  51.2  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2501  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.74 
 
 
78 aa  50.8  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000495099 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0546  sulfur carrier protein ThiS  40.91 
 
 
65 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.639054  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0558  sulfur carrier protein ThiS  40.91 
 
 
65 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.577012 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0620  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.31 
 
 
67 aa  50.4  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3429  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.31 
 
 
63 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1524  hypothetical protein  29.85 
 
 
67 aa  48.9  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0093  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.42 
 
 
66 aa  49.3  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.704796  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1455  hypothetical protein  43.94 
 
 
75 aa  49.3  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.282408  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2098  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.68 
 
 
76 aa  48.5  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.219145  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4003  thiamine biosynthesis protein ThiS  28.79 
 
 
66 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0610  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.31 
 
 
67 aa  48.1  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00214937  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1604  thiamine biosynthesis protein ThiS  40 
 
 
68 aa  48.1  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.36595  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4034  sulfur carrier protein ThiS  28.79 
 
 
66 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00848806 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4093  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.94 
 
 
65 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00467775  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1285  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.76 
 
 
68 aa  47.8  0.00005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3651  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.45 
 
 
64 aa  47.8  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0615  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.44 
 
 
70 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.920589  normal  0.197497 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0709  sulfur carrier protein ThiS  39.39 
 
 
65 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.367637  normal  0.0347852 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0044  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 
72 aa  47.4  0.00007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.164239  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1957  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.19 
 
 
63 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.27356  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4533  sulfur carrier protein ThiS  28.79 
 
 
66 aa  47  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2224  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.65 
 
 
69 aa  47  0.00009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.179012 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2198  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.31 
 
 
75 aa  46.6  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.259042  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0597  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.82 
 
 
66 aa  46.2  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2380  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.29 
 
 
77 aa  46.6  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3292  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 
65 aa  47  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.212717 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4491  sulfur carrier protein ThiS  28.79 
 
 
66 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0124059 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2458  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 
66 aa  47  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3747  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 
65 aa  45.8  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2136  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 
73 aa  45.4  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2390  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.77 
 
 
65 aa  45.8  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.233708  normal  0.952804 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0604  thiamine biosynthesis protein ThiS  54.05 
 
 
70 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.050819  normal  0.048745 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0666  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.33 
 
 
70 aa  45.8  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0035  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 
66 aa  45.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.91579  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4493  sulfur carrier protein ThiS  28.79 
 
 
66 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.439278  hitchhiker  0.00000334012 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4404  thiamine biosynthesis protein ThiS  28.79 
 
 
66 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5459  sulfur carrier protein ThiS  27.27 
 
 
66 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.179752 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1317  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 
66 aa  45.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0207  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 
65 aa  45.1  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.549071  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1747  ThiS  35.82 
 
 
67 aa  45.1  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4439  sulfur carrier protein ThiS  27.27 
 
 
66 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000189024 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02970  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.24 
 
 
66 aa  45.1  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03868  sulfur carrier protein ThiS  27.27 
 
 
66 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03821  hypothetical protein  27.27 
 
 
66 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0196  sulfur carrier protein ThiS  37.88 
 
 
65 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0777  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 
66 aa  44.7  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0479  sulfur carrier protein ThiS  33.33 
 
 
66 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.738565  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4225  sulfur carrier protein ThiS  27.27 
 
 
66 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4482  sulfur carrier protein ThiS  27.27 
 
 
66 aa  45.1  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3718  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.82 
 
 
66 aa  44.7  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.827217  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1857  thiamine biosynthesis protein ThiS  29.85 
 
 
67 aa  44.7  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0579  thiamine biosynthesis protein ThiS  52.78 
 
 
70 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.16999  hitchhiker  0.00610226 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4371  sulfur carrier protein ThiS  27.27 
 
 
66 aa  44.3  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04970  sulfur carrier protein ThiS  33.33 
 
 
66 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2567  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.94 
 
 
66 aa  43.9  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.823918  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0578  thiamine biosynthesis protein ThiS  51.35 
 
 
70 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0217  sulfur carrier protein ThiS  28.79 
 
 
66 aa  43.9  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4567  sulfur carrier protein ThiS  27.27 
 
 
66 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000396469 
 
 
-
 
NC_004310  BR0216  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 
65 aa  43.9  0.0008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0963  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.75 
 
 
68 aa  43.9  0.0008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2062  sulfur carrier protein ThiS  33.33 
 
 
98 aa  43.9  0.0008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3873  thiamine biosynthesis protein ThiS  28.79 
 
 
66 aa  43.5  0.0009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3404  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 
62 aa  43.5  0.0009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.376587  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2465  thiamine biosynthesis protein ThiS  28.79 
 
 
66 aa  43.5  0.0009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.408493  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6770  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.28 
 
 
70 aa  43.5  0.0009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3313  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.3 
 
 
70 aa  43.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0494  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.9 
 
 
108 aa  43.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00171819 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1865  thiamine biosynthesis protein ThiS  25.37 
 
 
67 aa  43.1  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0959115  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4884  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.42 
 
 
66 aa  43.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1984  sulfur carrier protein ThiS  33.33 
 
 
93 aa  43.1  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3147  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 
66 aa  42  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.054012  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10421  sulfur carrier protein ThiS  46.3 
 
 
68 aa  42.4  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.117678  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4172  sulfur carrier protein ThiS  33.33 
 
 
65 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.455905 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>