101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A4493 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A4493  sulfur carrier protein ThiS  100 
 
 		 66 aa  127  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.439278  hitchhiker  0.00000334012 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4567  sulfur carrier protein ThiS  95.45 
 
 		 66 aa  123  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000396469 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4491  sulfur carrier protein ThiS  95.45 
 
 		 66 aa  122  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0124059 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4404  thiamine biosynthesis protein ThiS  93.94 
 
 		 66 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4371  sulfur carrier protein ThiS  84.85 
 
 		 66 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0204  sulfur carrier protein ThiS  78.79 
 
 		 66 aa  100  9e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0247781 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03868  sulfur carrier protein ThiS  75.76 
 
 		 66 aa  98.6  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4225  sulfur carrier protein ThiS  75.76 
 
 		 66 aa  98.6  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4482  sulfur carrier protein ThiS  75.76 
 
 		 66 aa  98.6  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03821  hypothetical protein  75.76 
 
 		 66 aa  98.6  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4533  sulfur carrier protein ThiS  75.76 
 
 		 66 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5459  sulfur carrier protein ThiS  75.76 
 
 		 66 aa  96.7  9e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.179752 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4003  thiamine biosynthesis protein ThiS  74.24 
 
 		 66 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4034  sulfur carrier protein ThiS  74.24 
 
 		 66 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00848806 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4439  sulfur carrier protein ThiS  72.73 
 
 		 66 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000189024 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0217  sulfur carrier protein ThiS  57.58 
 
 		 66 aa  82  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0213  sulfur carrier protein ThiS  57.58 
 
 		 66 aa  80.5  0.000000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3873  thiamine biosynthesis protein ThiS  56.06 
 
 		 66 aa  77.8  0.00000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0281  sulfur carrier protein ThiS  53.03 
 
 		 66 aa  76.6  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00415569 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3718  thiamine biosynthesis protein ThiS  51.52 
 
 		 66 aa  74.3  0.0000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.827217  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0452  sulfur carrier protein ThiS  51.56 
 
 		 71 aa  66.6  0.00000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000134216 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0344  sulfur carrier protein ThiS  51.56 
 
 		 71 aa  66.6  0.00000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0044  thiamine biosynthesis protein ThiS  50 
 
 		 66 aa  61.6  0.000000003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.107556  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2390  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.91 
 
 		 65 aa  58.2  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.233708  normal  0.952804 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4741  sulfur carrier protein ThiS  40.91 
 
 		 66 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.243463 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02970  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 		 66 aa  55.1  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0433  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 		 66 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2589  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 		 69 aa  53.5  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.851507  normal  0.0105127 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5155  sulfur carrier protein ThiS  37.88 
 
 		 66 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.404683  normal  0.862246 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5998  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.8 
 
 		 81 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.786244 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4168  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 		 66 aa  52  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.852753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4978  sulfur carrier protein ThiS  36.36 
 
 		 66 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5331  sulfur carrier protein ThiS  36.36 
 
 		 71 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.883696  normal  0.241111 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0913  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 		 64 aa  51.6  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5105  sulfur carrier protein ThiS  36.36 
 
 		 92 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.205609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1043  ThiS, thiamine-biosynthesis  30.3 
 
 		 66 aa  50.4  0.000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0239  thiamine biosynthesis sulfur transfer protein  31.34 
 
 		 67 aa  50.4  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.164539 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0360  sulfur carrier protein ThiS  37.88 
 
 		 66 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.18682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04970  sulfur carrier protein ThiS  37.88 
 
 		 66 aa  50.1  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2111  thiS protein  35.71 
 
 		 66 aa  48.9  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.719096 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1773  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.82 
 
 		 72 aa  48.5  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002075  sulfur carrier protein ThiS  33.33 
 
 		 84 aa  48.1  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3504  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 		 66 aa  47.8  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.169395  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2986  thiamine biosynthesis protein ThiS  58.33 
 
 		 70 aa  47.8  0.00005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0479  sulfur carrier protein ThiS  36.36 
 
 		 66 aa  47  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.738565  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0035  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 		 66 aa  47  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.91579  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0363  thiamine biosynthesis protein ThiS  55.56 
 
 		 66 aa  46.2  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00363  sulfur carrier protein ThiS  31.82 
 
 		 84 aa  46.2  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2027  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.25 
 
 		 67 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161484 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0620  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.29 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0988  thiamine biosynthesis protein ThiS  28.79 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0800067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2380  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.86 
 
 		 77 aa  45.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1915  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.3 
 
 		 66 aa  46.2  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2501  thiamine biosynthesis protein ThiS  26.92 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000495099 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3034  thiamine biosynthesis protein ThiS  27.27 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00295138  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3574  sulfur carrier protein ThiS  34.85 
 
 		 65 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000430861 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2465  ThiS, thiamine-biosynthesis  34.85 
 
 		 65 aa  45.1  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.637315  normal  0.928732 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0384  sulfur carrier protein ThiS  34.85 
 
 		 91 aa  44.7  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2396  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  31.34 
 
 		 327 aa  44.7  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0670  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  34.85 
 
 		 326 aa  44.7  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2025  thiamine biosynthesis protein ThiS  29.69 
 
 		 67 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1925  thiamine biosynthesis protein ThiS  29.69 
 
 		 67 aa  44.7  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2320  thiamine biosynthesis protein ThiS  29.69 
 
 		 67 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.608129  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2016  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.82 
 
 		 81 aa  45.1  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.509039 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2436  thiamine biosynthesis protein ThiS  29.69 
 
 		 67 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0745874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2907  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 		 75 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0093  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 		 66 aa  44.7  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.704796  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2773  sulfur carrier protein ThiS  34.85 
 
 		 65 aa  44.3  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.374712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2892  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 		 65 aa  44.3  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.502448  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1857  thiamine biosynthesis protein ThiS  27.27 
 
 		 67 aa  44.3  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0709  sulfur carrier protein ThiS  28.79 
 
 		 65 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.367637  normal  0.0347852 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2780  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.05 
 
 		 78 aa  43.9  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0685562  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2465  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.3 
 
 		 66 aa  43.9  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.408493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1345  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.82 
 
 		 66 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2397  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.3 
 
 		 67 aa  43.5  0.0009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0035  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 		 73 aa  43.5  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2098  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.88 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.219145  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1339  thiamine biosynthesis protein ThiS  24.24 
 
 		 66 aa  43.5  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038066 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0196  sulfur carrier protein ThiS  28.79 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3292  thiamine biosynthesis protein ThiS  28.79 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.212717 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6572  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.88 
 
 		 69 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922176  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2442  thiS protein, putative  32.81 
 
 		 67 aa  41.6  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2198  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.89 
 
 		 75 aa  41.6  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.259042  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1608  sulfur transfer protein  31.82 
 
 		 77 aa  41.6  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.156932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0597  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.34 
 
 		 66 aa  42  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1830  thiamine biosynthesis protein ThiS  28.17 
 
 		 73 aa  42  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.6474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2782  putative thiamine biosynthesis protein ThiS  25.76 
 
 		 66 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.408989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1285  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.35 
 
 		 68 aa  42  0.003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0774  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.35 
 
 		 68 aa  42  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.176558 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3147  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 		 66 aa  41.2  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.054012  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1268  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.82 
 
 		 67 aa  41.6  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0448831  hitchhiker  0.00213488 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2432  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  28.79 
 
 		 329 aa  41.2  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.129281  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1317  thiamine biosynthesis protein ThiS  27.27 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4278  thiamine biosynthesis protein ThiS  25.76 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0658142  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0578  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.14 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3235  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.82 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.320513  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1153  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 		 68 aa  41.2  0.005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1939  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.25 
 
 		 67 aa  40.4  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1604  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.88 
 
 		 68 aa  40.4  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.36595  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0777  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.84 
 
 		 66 aa  40  0.009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>