69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2589 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2589  thiamine biosynthesis protein ThiS  100 
 
 		 69 aa  140  5e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.851507  normal  0.0105127 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2016  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.48 
 
 		 81 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.509039 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2442  thiS protein, putative  43.75 
 
 		 67 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1925  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.75 
 
 		 67 aa  63.2  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2027  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.19 
 
 		 67 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161484 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1773  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.42 
 
 		 72 aa  62.8  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2436  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.19 
 
 		 67 aa  61.6  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0745874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2320  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.19 
 
 		 67 aa  61.6  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.608129  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2025  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.19 
 
 		 67 aa  61.6  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1884  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.19 
 
 		 67 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2094  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.19 
 
 		 67 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.900553 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1939  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.62 
 
 		 67 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2380  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.89 
 
 		 77 aa  54.7  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4491  sulfur carrier protein ThiS  36.36 
 
 		 66 aa  54.3  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0124059 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4404  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 		 66 aa  53.5  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2093  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 		 69 aa  53.1  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4493  sulfur carrier protein ThiS  36.36 
 
 		 66 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.439278  hitchhiker  0.00000334012 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4371  sulfur carrier protein ThiS  33.33 
 
 		 66 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03868  sulfur carrier protein ThiS  31.82 
 
 		 66 aa  51.6  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1747  ThiS  31.82 
 
 		 67 aa  52  0.000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4225  sulfur carrier protein ThiS  31.82 
 
 		 66 aa  51.6  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4482  sulfur carrier protein ThiS  31.82 
 
 		 66 aa  51.6  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2907  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.84 
 
 		 75 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03821  hypothetical protein  31.82 
 
 		 66 aa  51.6  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4533  sulfur carrier protein ThiS  31.82 
 
 		 66 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0281  sulfur carrier protein ThiS  31.82 
 
 		 66 aa  51.2  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00415569 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3718  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.82 
 
 		 66 aa  51.2  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.827217  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0344  sulfur carrier protein ThiS  33.33 
 
 		 71 aa  50.8  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0452  sulfur carrier protein ThiS  33.33 
 
 		 71 aa  50.8  0.000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000134216 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5459  sulfur carrier protein ThiS  31.82 
 
 		 66 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.179752 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4567  sulfur carrier protein ThiS  33.33 
 
 		 66 aa  50.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000396469 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2501  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 		 78 aa  48.5  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000495099 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4034  sulfur carrier protein ThiS  30.3 
 
 		 66 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00848806 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4003  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.3 
 
 		 66 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2432  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  36.36 
 
 		 329 aa  47.8  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.129281  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2111  thiS protein  30.3 
 
 		 66 aa  47.4  0.00006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.719096 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1857  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 		 67 aa  47.4  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0213  sulfur carrier protein ThiS  30.3 
 
 		 66 aa  47  0.00009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4439  sulfur carrier protein ThiS  30.3 
 
 		 66 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000189024 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0204  sulfur carrier protein ThiS  33.33 
 
 		 66 aa  46.2  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0247781 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2198  thiamine biosynthesis protein ThiS  28.99 
 
 		 75 aa  46.2  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.259042  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00143  sulfur carrier protein ThiS  26.09 
 
 		 69 aa  45.1  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01842  sulfur carrier protein ThiS  33.33 
 
 		 66 aa  44.7  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3189  sulfur carrier protein ThiS  31.82 
 
 		 66 aa  44.7  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.580772  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3873  thiamine biosynthesis protein ThiS  28.79 
 
 		 66 aa  44.7  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1554  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.34 
 
 		 211 aa  44.7  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.636206  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0146  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.43 
 
 		 69 aa  44.3  0.0006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0217  sulfur carrier protein ThiS  29.69 
 
 		 66 aa  43.9  0.0008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0044  thiamine biosynthesis protein ThiS  27.27 
 
 		 66 aa  43.9  0.0008  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.107556  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0363  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.3 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1150  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.48 
 
 		 63 aa  42.4  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000104387  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0734  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.48 
 
 		 63 aa  42.7  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2165  thiamine biosynthesis protein ThiS  28.79 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0963  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.11 
 
 		 68 aa  42.4  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2465  thiamine biosynthesis protein ThiS  27.94 
 
 		 68 aa  41.6  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4065  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.82 
 
 		 67 aa  42  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.58887  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1068  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.87 
 
 		 63 aa  42  0.003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.60648  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1317  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.82 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1191  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.48 
 
 		 63 aa  41.6  0.004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2396  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  29.85 
 
 		 327 aa  41.2  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0021  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.39 
 
 		 69 aa  41.2  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.71048  normal  0.598538 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1268  thiamine biosynthesis protein ThiS  28.79 
 
 		 67 aa  40.8  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0448831  hitchhiker  0.00213488 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04970  sulfur carrier protein ThiS  30.3 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0709  sulfur carrier protein ThiS  27.27 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.367637  normal  0.0347852 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002075  sulfur carrier protein ThiS  24.64 
 
 		 84 aa  40.4  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02970  thiamine biosynthesis protein ThiS  27.27 
 
 		 66 aa  40.4  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2397  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.43 
 
 		 67 aa  40.4  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2986  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.61 
 
 		 70 aa  40  0.01  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0988  thiamine biosynthesis protein ThiS  27.27 
 
 		 67 aa  40  0.01  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0800067  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>