100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0963 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0963  thiamine biosynthesis protein ThiS  100 
 
 		 68 aa  133  9.999999999999999e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2224  thiamine biosynthesis protein ThiS  52.31 
 
 		 69 aa  55.8  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.179012 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0615  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.59 
 
 		 70 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.920589  normal  0.197497 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0035  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.08 
 
 		 73 aa  50.1  0.000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0620  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.31 
 
 		 67 aa  50.1  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1455  hypothetical protein  41.18 
 
 		 75 aa  49.7  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.282408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2400  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 		 74 aa  50.1  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2465  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.71 
 
 		 68 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2165  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.08 
 
 		 66 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5998  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.71 
 
 		 81 aa  48.9  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.786244 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2458  thiamine biosynthesis protein ThiS  40 
 
 		 66 aa  49.3  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1773  thiamine biosynthesis protein ThiS  40 
 
 		 72 aa  49.3  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0093  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.78 
 
 		 66 aa  48.9  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.704796  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0604  thiamine biosynthesis protein ThiS  51.16 
 
 		 70 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.050819  normal  0.048745 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2465  ThiS, thiamine-biosynthesis  40.62 
 
 		 65 aa  48.1  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.637315  normal  0.928732 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1317  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.42 
 
 		 66 aa  47.8  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0479  sulfur carrier protein ThiS  48.48 
 
 		 66 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.738565  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6223  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.68 
 
 		 65 aa  47.8  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5331  sulfur carrier protein ThiS  44.12 
 
 		 71 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.883696  normal  0.241111 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1749  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.31 
 
 		 65 aa  47.4  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000555242  normal  0.0141169 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4065  thiamine biosynthesis protein ThiS  46.97 
 
 		 67 aa  47.4  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.58887  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0579  thiamine biosynthesis protein ThiS  48.84 
 
 		 70 aa  47  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.16999  hitchhiker  0.00610226 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3147  thiamine biosynthesis protein ThiS  40 
 
 		 66 aa  47  0.00008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.054012  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4168  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.62 
 
 		 66 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.852753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3504  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.62 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.169395  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4278  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.94 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0658142  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04970  sulfur carrier protein ThiS  46.97 
 
 		 66 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2111  thiS protein  50 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.719096 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0360  sulfur carrier protein ThiS  43.08 
 
 		 66 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.18682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1604  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.33 
 
 		 68 aa  45.4  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.36595  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1179  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 		 67 aa  44.7  0.0004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1554  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.08 
 
 		 211 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.636206  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3235  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.91 
 
 		 66 aa  44.7  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.320513  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7517  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.93 
 
 		 70 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12799  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2062  sulfur carrier protein ThiS  41.54 
 
 		 98 aa  44.7  0.0004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3887  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.42 
 
 		 66 aa  44.7  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1984  sulfur carrier protein ThiS  41.54 
 
 		 93 aa  44.3  0.0005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6770  thiamine biosynthesis protein ThiS  46.38 
 
 		 70 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2396  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  38.24 
 
 		 327 aa  44.3  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0913  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.71 
 
 		 64 aa  43.9  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1915  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.92 
 
 		 66 aa  43.9  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4093  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.28 
 
 		 65 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00467775  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0709  sulfur carrier protein ThiS  41.18 
 
 		 65 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.367637  normal  0.0347852 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0988  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.75 
 
 		 67 aa  43.9  0.0008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0800067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3429  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.78 
 
 		 63 aa  43.5  0.0009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1142  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.24 
 
 		 68 aa  43.5  0.0009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2501  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.86 
 
 		 78 aa  42.7  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000495099 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0578  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.66 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0344  sulfur carrier protein ThiS  42.5 
 
 		 71 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5155  sulfur carrier protein ThiS  43.08 
 
 		 66 aa  42.7  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.404683  normal  0.862246 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5105  sulfur carrier protein ThiS  42.65 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.205609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0774  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 		 68 aa  43.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.176558 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0452  sulfur carrier protein ThiS  42.5 
 
 		 71 aa  43.1  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000134216 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0433  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.54 
 
 		 66 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4978  sulfur carrier protein ThiS  43.08 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4741  sulfur carrier protein ThiS  42.42 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.243463 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2892  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.5 
 
 		 65 aa  43.5  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.502448  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0281  sulfur carrier protein ThiS  37.88 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00415569 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1043  ThiS, thiamine-biosynthesis  48.65 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0726  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.71 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00139474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0217  sulfur carrier protein ThiS  34.43 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1957  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.25 
 
 		 63 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.27356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2165  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.62 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.433282  normal  0.219669 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2522  thiamine biosynthesis protein ThiS  40 
 
 		 77 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0239  thiamine biosynthesis sulfur transfer protein  36.36 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.164539 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1268  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.91 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0448831  hitchhiker  0.00213488 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0877  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.29 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0304024  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0035  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.91579  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6572  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.62 
 
 		 69 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0021  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.78 
 
 		 69 aa  42.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.71048  normal  0.598538 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01842  sulfur carrier protein ThiS  40 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14741  hypothetical protein  35.29 
 
 		 69 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.214043  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2589  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.11 
 
 		 69 aa  42.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.851507  normal  0.0105127 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4701  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  43.94 
 
 		 374 aa  42.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468322  normal  0.837099 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2780  thiamine biosynthesis protein ThiS  55.56 
 
 		 78 aa  42  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0685562  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0597  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.85 
 
 		 66 aa  42  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0044  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 		 72 aa  41.6  0.003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.164239  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2567  thiamine biosynthesis protein ThiS  46.03 
 
 		 66 aa  42  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.823918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1345  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 		 66 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34640  sulfur carrier protein ThiS  40 
 
 		 64 aa  41.6  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0439272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002075  sulfur carrier protein ThiS  47.22 
 
 		 84 aa  41.6  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3862  ThiS, thiamine-biosynthesis  37.88 
 
 		 67 aa  41.2  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0818304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00363  sulfur carrier protein ThiS  47.22 
 
 		 84 aa  41.6  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0071  thiamine biosynthesis protein ThiS  47.06 
 
 		 162 aa  41.6  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.290426  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3433  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.72 
 
 		 75 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2683  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.62 
 
 		 75 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.809629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0363  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.24 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1633  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  36.23 
 
 		 347 aa  41.2  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2098  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.86 
 
 		 76 aa  40.8  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.219145  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3313  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.39 
 
 		 70 aa  40.8  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0589  hypothetical protein  40.3 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.519327  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1857  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.38 
 
 		 67 aa  40.8  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3718  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 		 66 aa  40.8  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.827217  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3658  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.92 
 
 		 67 aa  40.4  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10421  sulfur carrier protein ThiS  46.3 
 
 		 68 aa  40.4  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.117678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1153  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.07 
 
 		 68 aa  40.8  0.007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0247  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.82 
 
 		 78 aa  40.4  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0975224  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14601  hypothetical protein  33.82 
 
 		 69 aa  40.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2933  ThiS, thiamine-biosynthesis  42.03 
 
 		 98 aa  40.4  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0004662  hitchhiker  3.85019e-16 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2136  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.08 
 
 		 73 aa  40.4  0.009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>