77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7517 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_7517  thiamine biosynthesis protein ThiS  100 
 
 		 70 aa  138  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12799  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6770  thiamine biosynthesis protein ThiS  92.86 
 
 		 70 aa  125  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0578  thiamine biosynthesis protein ThiS  64.29 
 
 		 70 aa  91.7  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0615  thiamine biosynthesis protein ThiS  57.14 
 
 		 70 aa  77  0.00000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.920589  normal  0.197497 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0579  thiamine biosynthesis protein ThiS  55.71 
 
 		 70 aa  67  0.00000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.16999  hitchhiker  0.00610226 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0604  thiamine biosynthesis protein ThiS  58.57 
 
 		 70 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.050819  normal  0.048745 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5919  sulfur carrier protein ThiS  47.14 
 
 		 65 aa  56.2  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168418  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2892  thiamine biosynthesis protein ThiS  48.57 
 
 		 65 aa  56.2  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.502448  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2224  thiamine biosynthesis protein ThiS  47.14 
 
 		 69 aa  55.8  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.179012 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2465  ThiS, thiamine-biosynthesis  50 
 
 		 65 aa  55.5  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.637315  normal  0.928732 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6223  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.71 
 
 		 65 aa  54.7  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392752  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3117  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.07 
 
 		 68 aa  54.7  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.295456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2165  thiamine biosynthesis protein ThiS  47.14 
 
 		 65 aa  53.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.433282  normal  0.219669 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0494  thiamine biosynthesis protein ThiS  46.15 
 
 		 108 aa  52.8  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00171819 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1153  thiamine biosynthesis protein ThiS  47.06 
 
 		 68 aa  51.6  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4093  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.29 
 
 		 65 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00467775  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3429  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.12 
 
 		 63 aa  50.1  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2782  putative thiamine biosynthesis protein ThiS  43.84 
 
 		 66 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.408989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3887  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.29 
 
 		 66 aa  49.7  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6397  sulfur carrier protein ThiS  44.29 
 
 		 65 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3034  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.29 
 
 		 66 aa  48.9  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00295138  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0610  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.25 
 
 		 67 aa  48.5  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00214937  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0207  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.43 
 
 		 65 aa  48.5  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.549071  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2098  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.66 
 
 		 76 aa  47.8  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.219145  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2501  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.59 
 
 		 78 aa  47.4  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000495099 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1339  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.28 
 
 		 66 aa  47.8  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038066 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34640  sulfur carrier protein ThiS  42.03 
 
 		 64 aa  47.4  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0439272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2165  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.71 
 
 		 65 aa  47.4  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.153528  normal  0.819045 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2780  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.31 
 
 		 78 aa  47.4  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0685562  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2933  ThiS, thiamine-biosynthesis  35.71 
 
 		 98 aa  47  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0004662  hitchhiker  3.85019e-16 
 
 
-
 
NC_004310  BR0216  thiamine biosynthesis protein ThiS  40 
 
 		 65 aa  47  0.00009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0239  thiamine biosynthesis sulfur transfer protein  38.03 
 
 		 67 aa  47  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.164539 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1415  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.71 
 
 		 65 aa  47  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1957  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.18 
 
 		 63 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.27356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3290  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  40 
 
 		 331 aa  45.1  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0021  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.71 
 
 		 69 aa  45.4  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.71048  normal  0.598538 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4278  thiamine biosynthesis protein ThiS  40 
 
 		 66 aa  45.4  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0658142  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0963  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.93 
 
 		 68 aa  45.1  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2458  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.62 
 
 		 66 aa  45.1  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3651  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.89 
 
 		 64 aa  44.7  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3658  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.86 
 
 		 67 aa  44.7  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0479  sulfur carrier protein ThiS  43.06 
 
 		 66 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.738565  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0774  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.21 
 
 		 68 aa  44.3  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.176558 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3404  thiamine biosynthesis protein ThiS  52 
 
 		 62 aa  44.7  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.376587  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2522  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.58 
 
 		 77 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0643  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.94 
 
 		 73 aa  44.3  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.85301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1043  ThiS, thiamine-biosynthesis  36 
 
 		 66 aa  44.3  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0589  hypothetical protein  35.71 
 
 		 65 aa  44.3  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.519327  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4172  sulfur carrier protein ThiS  40 
 
 		 65 aa  43.9  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.455905 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2563  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.44 
 
 		 65 aa  43.9  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.183271  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13201  hypothetical protein  32.86 
 
 		 70 aa  42.7  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.537163 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5998  thiamine biosynthesis protein ThiS  58.33 
 
 		 81 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.786244 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0913  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.44 
 
 		 64 aa  42.7  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0204  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.82 
 
 		 72 aa  43.5  0.001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02970  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.71 
 
 		 66 aa  43.5  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2396  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  51.35 
 
 		 327 aa  43.5  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04970  sulfur carrier protein ThiS  41.67 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1604  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.39 
 
 		 68 aa  43.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.36595  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3289  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.43 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.425824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0988  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.44 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0800067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6572  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.21 
 
 		 69 aa  42.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0798  putative ThiS sulfur transfer protein  36.21 
 
 		 58 aa  42.7  0.002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0913  thiamine biosynthesis protein ThiS  40 
 
 		 64 aa  42  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.133934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1268  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.28 
 
 		 67 aa  41.6  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0448831  hitchhiker  0.00213488 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1915  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.21 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1058  hypothetical protein  36.62 
 
 		 70 aa  41.6  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000643593  normal  0.078632 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0877  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.72 
 
 		 65 aa  41.2  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0304024  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3313  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.39 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2907  thiamine biosynthesis protein ThiS  47.37 
 
 		 75 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0146  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.95 
 
 		 69 aa  41.2  0.005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0252  thiamine biosynthesis protein ThiS  28.57 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0709  sulfur carrier protein ThiS  41.33 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.367637  normal  0.0347852 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2432  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  36.62 
 
 		 329 aa  41.2  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.129281  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0010  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.71 
 
 		 65 aa  40.8  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.209764 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2127  thiamine-biosynthesis protein ThiS  42.86 
 
 		 67 aa  40.4  0.008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3862  ThiS, thiamine-biosynthesis  38.03 
 
 		 67 aa  40.4  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0818304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1457  thiamine biosynthesis protein ThiS  48.53 
 
 		 75 aa  40  0.01  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.650778  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>