72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6397 on replicon NC_011371
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011371  Rleg2_6397  sulfur carrier protein ThiS  100 
 
 		 65 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5919  sulfur carrier protein ThiS  64.62 
 
 		 65 aa  88.6  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168418  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4172  sulfur carrier protein ThiS  60 
 
 		 65 aa  85.1  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.455905 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2563  thiamine biosynthesis protein ThiS  50.77 
 
 		 65 aa  72  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.183271  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0444  sulfur carrier protein ThiS  49.23 
 
 		 65 aa  66.2  0.0000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0216  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.54 
 
 		 65 aa  61.2  0.000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0913  thiamine biosynthesis protein ThiS  53.85 
 
 		 64 aa  61.2  0.000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.133934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2165  thiamine biosynthesis protein ThiS  47.69 
 
 		 65 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.433282  normal  0.219669 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6223  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.62 
 
 		 65 aa  59.3  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0207  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.54 
 
 		 65 aa  58.9  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.549071  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3651  thiamine biosynthesis protein ThiS  47.69 
 
 		 64 aa  57.8  0.00000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2465  ThiS, thiamine-biosynthesis  46.15 
 
 		 65 aa  57.4  0.00000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.637315  normal  0.928732 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0010  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.08 
 
 		 65 aa  55.8  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.209764 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1415  thiamine biosynthesis protein ThiS  40 
 
 		 65 aa  54.7  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3429  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.44 
 
 		 63 aa  54.3  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2892  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.08 
 
 		 65 aa  53.9  0.0000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.502448  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2165  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.08 
 
 		 65 aa  53.1  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.153528  normal  0.819045 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1957  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.27 
 
 		 63 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.27356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4093  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.54 
 
 		 65 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00467775  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2127  thiamine-biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 		 67 aa  49.7  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2136  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.91 
 
 		 73 aa  50.1  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1153  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.86 
 
 		 68 aa  50.1  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2458  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 		 66 aa  49.7  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3887  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.91 
 
 		 66 aa  48.9  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0283  thiamine biosynthesis protein ThiS  46.15 
 
 		 65 aa  49.3  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7517  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.29 
 
 		 70 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12799  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0040  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.38 
 
 		 65 aa  48.5  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.12194  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6770  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.29 
 
 		 70 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2522  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.75 
 
 		 77 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4278  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 		 66 aa  47.8  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0658142  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3313  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 		 70 aa  47.8  0.00006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0838  ThiS, thiamine-biosynthesis  42.42 
 
 		 67 aa  47.8  0.00006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1077  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  37.88 
 
 		 326 aa  47.4  0.00007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129832  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3034  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 		 66 aa  47  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00295138  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1043  ThiS, thiamine-biosynthesis  36.36 
 
 		 66 aa  45.4  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2782  putative thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 		 66 aa  45.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.408989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0146  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.32 
 
 		 69 aa  45.1  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0071  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.38 
 
 		 162 aa  44.3  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.290426  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0877  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.92 
 
 		 65 aa  43.9  0.0007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0304024  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2907  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.71 
 
 		 75 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3189  sulfur carrier protein ThiS  39.39 
 
 		 66 aa  43.9  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.580772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5998  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.85 
 
 		 81 aa  43.5  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.786244 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0615  thiamine biosynthesis protein ThiS  40 
 
 		 70 aa  43.5  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.920589  normal  0.197497 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0913  thiamine biosynthesis protein ThiS  40 
 
 		 64 aa  43.5  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34640  sulfur carrier protein ThiS  35.94 
 
 		 64 aa  43.5  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0439272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1633  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  33.33 
 
 		 347 aa  43.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0204  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.1 
 
 		 72 aa  43.5  0.001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2933  ThiS, thiamine-biosynthesis  32.31 
 
 		 98 aa  43.5  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0004662  hitchhiker  3.85019e-16 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0731  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.1 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2584  hypothetical protein  33.33 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0093  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.704796  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0578  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.29 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0666  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.48 
 
 		 70 aa  42.7  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0035  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.91 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.91579  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1268  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0448831  hitchhiker  0.00213488 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1266  ThiS, thiamine-biosynthesis  35.48 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3235  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.320513  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1564  ThiS, thiamine-biosynthesis  35.48 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0619282 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1608  sulfur transfer protein  42.31 
 
 		 77 aa  41.2  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.156932  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1524  hypothetical protein  36.54 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2098  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.23 
 
 		 76 aa  41.2  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.219145  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2465  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.24 
 
 		 68 aa  40.8  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1459  hypothetical protein  37.74 
 
 		 67 aa  40.8  0.006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2567  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.823918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0776  thiamine biosynthesis protein ThiS  38 
 
 		 65 aa  40.8  0.007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.19393 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2397  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 		 67 aa  40.4  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2683  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.5 
 
 		 75 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.809629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4439  sulfur carrier protein ThiS  33.33 
 
 		 66 aa  40  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000189024 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1933  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.75 
 
 		 65 aa  40.4  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3433  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.5 
 
 		 75 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5046  hypothetical protein  32.81 
 
 		 70 aa  40  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.461936  normal  0.383391 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1567  ThiS, thiamine-biosynthesis  31.88 
 
 		 70 aa  40  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0927969  normal  0.455632 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>