79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1567 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1567  ThiS, thiamine-biosynthesis  100 
 
 		 70 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0927969  normal  0.455632 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3944  thiamine biosynthesis protein ThiS  67.14 
 
 		 71 aa  102  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000530679  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2239  thiamine biosynthesis protein ThiS  61.43 
 
 		 70 aa  92.8  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.423585 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1981  thiamine biosynthesis protein ThiS  61.43 
 
 		 70 aa  91.3  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00036905  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2538  thiamine biosynthesis protein ThiS  52.17 
 
 		 69 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.694439  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1185  thiamine biosynthesis protein ThiS  47.83 
 
 		 69 aa  71.6  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.029771  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0643  thiamine biosynthesis protein ThiS  50.72 
 
 		 73 aa  69.7  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.85301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4110  thiamine biosynthesis protein ThiS  50.72 
 
 		 85 aa  65.5  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1143  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.29 
 
 		 70 aa  58.5  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0193117  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0589  hypothetical protein  39.13 
 
 		 65 aa  56.2  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.519327  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1823  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.03 
 
 		 66 aa  55.8  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.100624 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1095  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.57 
 
 		 68 aa  50.8  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.364292  normal  0.0606209 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1317  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.68 
 
 		 66 aa  50.4  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1554  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.03 
 
 		 211 aa  50.4  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.636206  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3290  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  35.71 
 
 		 331 aa  50.1  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2165  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.68 
 
 		 66 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2482  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.88 
 
 		 66 aa  49.3  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.116747  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5155  sulfur carrier protein ThiS  39.13 
 
 		 66 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.404683  normal  0.862246 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3658  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.23 
 
 		 67 aa  48.5  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0667  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.13 
 
 		 75 aa  48.5  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.20728e-26 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3189  sulfur carrier protein ThiS  36.23 
 
 		 66 aa  48.5  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.580772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0610  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.58 
 
 		 67 aa  48.1  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00214937  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2683  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.68 
 
 		 75 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.809629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3433  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.68 
 
 		 75 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2907  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.78 
 
 		 75 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04970  sulfur carrier protein ThiS  37.68 
 
 		 66 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0360  sulfur carrier protein ThiS  37.68 
 
 		 66 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.18682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2933  ThiS, thiamine-biosynthesis  34.78 
 
 		 98 aa  47.4  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0004662  hitchhiker  3.85019e-16 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0597  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.58 
 
 		 66 aa  47  0.00009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5105  sulfur carrier protein ThiS  37.68 
 
 		 92 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.205609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4978  sulfur carrier protein ThiS  37.68 
 
 		 66 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0654  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.14 
 
 		 75 aa  45.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0130451  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3289  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.68 
 
 		 66 aa  45.4  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.425824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0071  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.75 
 
 		 162 aa  45.4  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.290426  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0247  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.34 
 
 		 78 aa  45.1  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0975224  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1633  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  34.78 
 
 		 347 aa  44.7  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0618  sulfur carrier protein ThiS  40 
 
 		 67 aa  44.7  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02970  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.78 
 
 		 66 aa  44.3  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0885  sulfur carrier protein ThiS  38.57 
 
 		 67 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000164722  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4103  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.79 
 
 		 90 aa  43.9  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.189024  decreased coverage  0.00486776 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0731  sulfur carrier protein ThiS  38.57 
 
 		 67 aa  43.9  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4543  sulfur carrier protein ThiS  38.57 
 
 		 67 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.528402 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0808  sulfur carrier protein ThiS  38.57 
 
 		 67 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.47601e-48 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0641  sulfur carrier protein ThiS  38.57 
 
 		 67 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0697  sulfur carrier protein ThiS  38.57 
 
 		 67 aa  43.9  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0801  sulfur carrier protein ThiS  38.57 
 
 		 67 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0788  sulfur carrier protein ThiS  39.13 
 
 		 67 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.450844  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2432  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  33.33 
 
 		 329 aa  43.5  0.0009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.129281  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0777  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01842  sulfur carrier protein ThiS  36.23 
 
 		 66 aa  43.5  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1058  hypothetical protein  34.78 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000643593  normal  0.078632 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0841  ThiS, thiamine-biosynthesis  31.88 
 
 		 72 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4168  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.78 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.852753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2136  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.23 
 
 		 73 aa  43.5  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0479  sulfur carrier protein ThiS  36.23 
 
 		 66 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.738565  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4741  sulfur carrier protein ThiS  36.23 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.243463 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0035  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.91579  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1262  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2567  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.23 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.823918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0647  sulfur carrier protein ThiS  37.14 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0093  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.23 
 
 		 66 aa  42  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.704796  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0641  sulfur carrier protein ThiS  38.57 
 
 		 67 aa  42  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3474  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.88 
 
 		 66 aa  42  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0252712  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2072  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 		 66 aa  41.6  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.113816  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1416  sulfur carrier protein ThiS  31.88 
 
 		 67 aa  41.6  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2638  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 		 68 aa  41.2  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4278  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.68 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0658142  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13201  hypothetical protein  32.86 
 
 		 70 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.537163 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1150  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.1 
 
 		 63 aa  40.8  0.006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000104387  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16951  hypothetical protein  34.78 
 
 		 71 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.277619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0338  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.31 
 
 		 67 aa  40.8  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5046  hypothetical protein  34.78 
 
 		 70 aa  40.8  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.461936  normal  0.383391 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3313  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.78 
 
 		 70 aa  40.4  0.008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6770  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.62 
 
 		 70 aa  40.4  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1158  sulfur transfer protein for thiamine biosynthesis  40 
 
 		 65 aa  40.4  0.009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2127  thiamine-biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 		 67 aa  40.4  0.009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2522  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.33 
 
 		 77 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6397  sulfur carrier protein ThiS  31.88 
 
 		 65 aa  40  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0578  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.19 
 
 		 70 aa  40  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>