47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1981 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1981  thiamine biosynthesis protein ThiS  100 
 
 		 70 aa  141  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00036905  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2239  thiamine biosynthesis protein ThiS  95.71 
 
 		 70 aa  135  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.423585 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1567  ThiS, thiamine-biosynthesis  61.43 
 
 		 70 aa  91.3  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0927969  normal  0.455632 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3944  thiamine biosynthesis protein ThiS  62.86 
 
 		 71 aa  87.4  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000530679  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2538  thiamine biosynthesis protein ThiS  56.52 
 
 		 69 aa  76.3  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.694439  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1185  thiamine biosynthesis protein ThiS  49.28 
 
 		 69 aa  70.1  0.000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.029771  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1143  thiamine biosynthesis protein ThiS  50 
 
 		 70 aa  62  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0193117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0643  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.93 
 
 		 73 aa  60.1  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.85301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4110  thiamine biosynthesis protein ThiS  46.38 
 
 		 85 aa  59.7  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1823  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.03 
 
 		 66 aa  53.9  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.100624 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0589  hypothetical protein  42.03 
 
 		 65 aa  53.5  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.519327  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0252  thiamine biosynthesis protein ThiS  40 
 
 		 70 aa  53.5  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3433  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.58 
 
 		 75 aa  50.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2683  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.58 
 
 		 75 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.809629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2933  ThiS, thiamine-biosynthesis  36.23 
 
 		 98 aa  47.8  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0004662  hitchhiker  3.85019e-16 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0085  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.12 
 
 		 85 aa  47.8  0.00005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.171422  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0641  sulfur carrier protein ThiS  40.58 
 
 		 67 aa  47.8  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3658  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.68 
 
 		 67 aa  47  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1095  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.14 
 
 		 68 aa  47  0.00009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.364292  normal  0.0606209 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3474  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.23 
 
 		 66 aa  46.2  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0252712  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0610  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.58 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00214937  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0667  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.13 
 
 		 75 aa  46.2  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.20728e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0885  sulfur carrier protein ThiS  39.13 
 
 		 67 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000164722  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0788  sulfur carrier protein ThiS  39.73 
 
 		 67 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.450844  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0801  sulfur carrier protein ThiS  39.13 
 
 		 67 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4543  sulfur carrier protein ThiS  39.13 
 
 		 67 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.528402 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0808  sulfur carrier protein ThiS  39.13 
 
 		 67 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.47601e-48 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0697  sulfur carrier protein ThiS  39.13 
 
 		 67 aa  45.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0641  sulfur carrier protein ThiS  39.13 
 
 		 67 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0731  sulfur carrier protein ThiS  39.13 
 
 		 67 aa  45.1  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0647  sulfur carrier protein ThiS  39.13 
 
 		 67 aa  44.3  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0654  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.68 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0130451  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3290  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  35.71 
 
 		 331 aa  43.5  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5998  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.21 
 
 		 81 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.786244 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3189  sulfur carrier protein ThiS  36.11 
 
 		 66 aa  42  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.580772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5046  hypothetical protein  36.23 
 
 		 70 aa  41.6  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.461936  normal  0.383391 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0612  sulfur carrier protein ThiS  34.78 
 
 		 67 aa  41.6  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1633  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  33.33 
 
 		 347 aa  41.6  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3313  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.23 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13201  hypothetical protein  35.71 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.537163 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0618  sulfur carrier protein ThiS  34.78 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2165  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.21 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04970  sulfur carrier protein ThiS  36.23 
 
 		 66 aa  40.8  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5105  sulfur carrier protein ThiS  38.57 
 
 		 92 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.205609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2522  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.82 
 
 		 77 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2136  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.68 
 
 		 73 aa  40  0.01  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0578  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.57 
 
 		 70 aa  40  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>