106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1185 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_1185  thiamine biosynthesis protein ThiS  100 
 
 
69 aa  138  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.029771  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2538  thiamine biosynthesis protein ThiS  55.07 
 
 
69 aa  80.5  0.000000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.694439  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1567  ThiS, thiamine-biosynthesis  47.83 
 
 
70 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0927969  normal  0.455632 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1981  thiamine biosynthesis protein ThiS  49.28 
 
 
70 aa  70.1  0.000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00036905  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2239  thiamine biosynthesis protein ThiS  49.28 
 
 
70 aa  70.1  0.000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.423585 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4110  thiamine biosynthesis protein ThiS  52.24 
 
 
85 aa  69.3  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1143  thiamine biosynthesis protein ThiS  47.76 
 
 
70 aa  64.7  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0193117  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3944  thiamine biosynthesis protein ThiS  47.83 
 
 
71 aa  62  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000530679  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0643  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.86 
 
 
73 aa  60.8  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.85301  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1317  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.31 
 
 
66 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2933  ThiS, thiamine-biosynthesis  38.81 
 
 
98 aa  53.1  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0004662  hitchhiker  3.85019e-16 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1142  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.24 
 
 
68 aa  53.1  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3658  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.23 
 
 
67 aa  52.8  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5105  sulfur carrier protein ThiS  35.82 
 
 
92 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.205609  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5331  sulfur carrier protein ThiS  37.31 
 
 
71 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.883696  normal  0.241111 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4168  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.33 
 
 
66 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.852753  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4978  sulfur carrier protein ThiS  35.82 
 
 
66 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3147  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.33 
 
 
66 aa  50.4  0.000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.054012  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1262  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.18 
 
 
67 aa  50.4  0.000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04970  sulfur carrier protein ThiS  34.33 
 
 
66 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0479  sulfur carrier protein ThiS  34.33 
 
 
66 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.738565  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5155  sulfur carrier protein ThiS  34.33 
 
 
66 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.404683  normal  0.862246 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0360  sulfur carrier protein ThiS  34.33 
 
 
66 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.18682  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0589  hypothetical protein  35.82 
 
 
65 aa  48.9  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.519327  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2127  thiamine-biosynthesis protein ThiS  35.48 
 
 
67 aa  49.3  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02970  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.82 
 
 
66 aa  48.9  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1095  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.76 
 
 
68 aa  48.1  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.364292  normal  0.0606209 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0433  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.33 
 
 
66 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0801  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.82 
 
 
66 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0035  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.33 
 
 
66 aa  47.4  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.91579  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1554  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.31 
 
 
211 aa  47.4  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.636206  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3504  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.34 
 
 
66 aa  47  0.00008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.169395  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3289  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.33 
 
 
66 aa  47  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.425824  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1633  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  37.31 
 
 
347 aa  47  0.00009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4741  sulfur carrier protein ThiS  34.33 
 
 
66 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.243463 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2567  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.82 
 
 
66 aa  47  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.823918  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0792  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.33 
 
 
66 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.464856  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0642  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.33 
 
 
66 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2482  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.33 
 
 
66 aa  46.2  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.116747  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0044  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.92 
 
 
72 aa  45.4  0.0002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.164239  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1823  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.82 
 
 
66 aa  46.2  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.100624 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0667  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.23 
 
 
75 aa  45.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.20728e-26 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0726  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.33 
 
 
66 aa  45.8  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00139474  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1268  thiamine biosynthesis protein ThiS  28.36 
 
 
67 aa  45.1  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0448831  hitchhiker  0.00213488 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3474  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.84 
 
 
66 aa  45.4  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0252712  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4701  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  32.35 
 
 
374 aa  45.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468322  normal  0.837099 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3718  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.34 
 
 
66 aa  45.4  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.827217  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3189  sulfur carrier protein ThiS  31.34 
 
 
66 aa  45.1  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.580772  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0654  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.78 
 
 
75 aa  44.7  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0130451  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0612  sulfur carrier protein ThiS  33.82 
 
 
67 aa  44.3  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2400  thiamine biosynthesis protein ThiS  29.85 
 
 
74 aa  43.5  0.0009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03868  sulfur carrier protein ThiS  32.84 
 
 
66 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4003  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.84 
 
 
66 aa  43.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0801  sulfur carrier protein ThiS  35.29 
 
 
67 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0697  sulfur carrier protein ThiS  35.29 
 
 
67 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0641  sulfur carrier protein ThiS  35.29 
 
 
67 aa  43.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0641  sulfur carrier protein ThiS  35.29 
 
 
67 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0731  sulfur carrier protein ThiS  35.29 
 
 
67 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0035  thiamine biosynthesis protein ThiS  29.85 
 
 
73 aa  43.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1068  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.54 
 
 
63 aa  43.1  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.60648  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0618  sulfur carrier protein ThiS  35.29 
 
 
67 aa  43.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4225  sulfur carrier protein ThiS  32.84 
 
 
66 aa  43.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4533  sulfur carrier protein ThiS  32.84 
 
 
66 aa  42.7  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4034  sulfur carrier protein ThiS  32.84 
 
 
66 aa  43.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00848806 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4439  sulfur carrier protein ThiS  32.84 
 
 
66 aa  43.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000189024 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4482  sulfur carrier protein ThiS  32.84 
 
 
66 aa  43.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1915  thiamine biosynthesis protein ThiS  29.85 
 
 
66 aa  43.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0885  sulfur carrier protein ThiS  35.29 
 
 
67 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000164722  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0788  sulfur carrier protein ThiS  33.82 
 
 
67 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.450844  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4543  sulfur carrier protein ThiS  35.29 
 
 
67 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.528402 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0808  sulfur carrier protein ThiS  35.29 
 
 
67 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.47601e-48 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03821  hypothetical protein  32.84 
 
 
66 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3873  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.34 
 
 
66 aa  43.5  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0774  thiamine biosynthesis protein ThiS  27.94 
 
 
68 aa  42.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.176558 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1191  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.84 
 
 
63 aa  42  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0838  ThiS, thiamine-biosynthesis  32.84 
 
 
67 aa  42.4  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0093  thiamine biosynthesis protein ThiS  28.36 
 
 
66 aa  42.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.704796  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3290  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  48.57 
 
 
331 aa  42  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0239  thiamine biosynthesis sulfur transfer protein  28.36 
 
 
67 aa  42.7  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.164539 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0734  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.54 
 
 
63 aa  42.7  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0247  thiamine biosynthesis protein ThiS  29.23 
 
 
78 aa  42  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0975224  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2062  sulfur carrier protein ThiS  34.33 
 
 
98 aa  42.4  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4371  sulfur carrier protein ThiS  29.85 
 
 
66 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0777  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.84 
 
 
66 aa  42.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4103  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.85 
 
 
90 aa  42.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.189024  decreased coverage  0.00486776 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3034  thiamine biosynthesis protein ThiS  29.85 
 
 
66 aa  41.6  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00295138  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1773  thiamine biosynthesis protein ThiS  28.36 
 
 
72 aa  42  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2396  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  30.88 
 
 
327 aa  42  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0597  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.34 
 
 
66 aa  41.6  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1984  sulfur carrier protein ThiS  34.33 
 
 
93 aa  41.6  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01842  sulfur carrier protein ThiS  29.85 
 
 
66 aa  42  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5459  sulfur carrier protein ThiS  32.84 
 
 
66 aa  42  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.179752 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4065  thiamine biosynthesis protein ThiS  29.03 
 
 
67 aa  42  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.58887  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1150  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.84 
 
 
63 aa  41.6  0.003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000104387  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0647  sulfur carrier protein ThiS  32.35 
 
 
67 aa  41.6  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4491  sulfur carrier protein ThiS  29.85 
 
 
66 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0124059 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3862  ThiS, thiamine-biosynthesis  29.85 
 
 
67 aa  41.2  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0818304  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0204  sulfur carrier protein ThiS  32.84 
 
 
66 aa  41.2  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0247781 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4404  thiamine biosynthesis protein ThiS  28.36 
 
 
66 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2136  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.33 
 
 
73 aa  41.2  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>