48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2538 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2538  thiamine biosynthesis protein ThiS  100 
 
 		 69 aa  134  4e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.694439  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4110  thiamine biosynthesis protein ThiS  62.32 
 
 		 85 aa  92  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1185  thiamine biosynthesis protein ThiS  55.07 
 
 		 69 aa  80.5  0.000000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.029771  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2239  thiamine biosynthesis protein ThiS  57.97 
 
 		 70 aa  78.2  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.423585 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1981  thiamine biosynthesis protein ThiS  56.52 
 
 		 70 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00036905  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3944  thiamine biosynthesis protein ThiS  53.62 
 
 		 71 aa  73.9  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000530679  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1567  ThiS, thiamine-biosynthesis  52.17 
 
 		 70 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0927969  normal  0.455632 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1143  thiamine biosynthesis protein ThiS  47.06 
 
 		 70 aa  70.9  0.000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0193117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0643  thiamine biosynthesis protein ThiS  49.3 
 
 		 73 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.85301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2482  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.31 
 
 		 66 aa  53.1  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.116747  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3189  sulfur carrier protein ThiS  37.31 
 
 		 66 aa  50.8  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.580772  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0247  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.31 
 
 		 78 aa  49.7  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0975224  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1823  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.3 
 
 		 66 aa  48.9  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.100624 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3658  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.68 
 
 		 67 aa  48.5  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0667  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.13 
 
 		 75 aa  48.1  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.20728e-26 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0801  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.31 
 
 		 66 aa  47  0.00008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2683  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.82 
 
 		 75 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.809629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3433  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.82 
 
 		 75 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1135  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.3 
 
 		 66 aa  46.2  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.477207  normal  0.0493363 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0666  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.81 
 
 		 70 aa  45.8  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1317  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.33 
 
 		 66 aa  46.2  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1142  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.29 
 
 		 68 aa  45.8  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0654  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.68 
 
 		 75 aa  45.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0130451  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1679  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.33 
 
 		 66 aa  44.3  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000223825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0777  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.82 
 
 		 66 aa  44.3  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1554  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.31 
 
 		 211 aa  44.3  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.636206  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0610  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.33 
 
 		 67 aa  44.3  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00214937  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1095  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.24 
 
 		 68 aa  44.3  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.364292  normal  0.0606209 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3474  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.33 
 
 		 66 aa  43.9  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0252712  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01842  sulfur carrier protein ThiS  35.82 
 
 		 66 aa  43.9  0.0008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1416  sulfur carrier protein ThiS  36.76 
 
 		 67 aa  42.7  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0597  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.33 
 
 		 66 aa  43.5  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2165  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.84 
 
 		 66 aa  42.7  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0093  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.34 
 
 		 66 aa  42.7  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.704796  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3504  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.33 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.169395  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0035  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.33 
 
 		 73 aa  42.7  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2432  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  34.33 
 
 		 329 aa  41.6  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.129281  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0239  thiamine biosynthesis sulfur transfer protein  28.36 
 
 		 67 aa  41.6  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.164539 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3147  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.84 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.054012  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5046  hypothetical protein  34.33 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.461936  normal  0.383391 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1633  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  30.88 
 
 		 347 aa  40.8  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0589  hypothetical protein  31.34 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.519327  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2522  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.31 
 
 		 77 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2933  ThiS, thiamine-biosynthesis  32.84 
 
 		 98 aa  40.4  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0004662  hitchhiker  3.85019e-16 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0642  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.76 
 
 		 66 aa  40  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0792  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.76 
 
 		 66 aa  40  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.464856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0035  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.82 
 
 		 66 aa  40  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.91579  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0072  thiamine biosynthesis protein ThiS  29.85 
 
 		 78 aa  40  0.01  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>