96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1679 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_1679  thiamine biosynthesis protein ThiS  100 
 
 
66 aa  128  3e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000223825  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0072  thiamine biosynthesis protein ThiS  47.54 
 
 
78 aa  70.1  0.000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1554  thiamine biosynthesis protein ThiS  53.03 
 
 
211 aa  68.9  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.636206  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0597  thiamine biosynthesis protein ThiS  51.52 
 
 
66 aa  68.2  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1823  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 
66 aa  58.2  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.100624 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1135  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.45 
 
 
66 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.477207  normal  0.0493363 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1317  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.91 
 
 
66 aa  56.2  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4701  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  39.39 
 
 
374 aa  53.1  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468322  normal  0.837099 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2165  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 
66 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2072  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 
66 aa  51.2  0.000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.113816  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2907  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 
75 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3862  ThiS, thiamine-biosynthesis  42.42 
 
 
67 aa  51.2  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0818304  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0610  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.82 
 
 
67 aa  50.8  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00214937  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0670  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  34.85 
 
 
326 aa  50.8  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2567  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 
66 aa  50.4  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.823918  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1662  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.45 
 
 
66 aa  49.7  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000426635  hitchhiker  0.000995096 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2432  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  36.36 
 
 
329 aa  50.1  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.129281  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0643  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.71 
 
 
73 aa  49.3  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.85301  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0801  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 
66 aa  49.7  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0726  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 
66 aa  48.1  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00139474  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3147  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 
66 aa  47.8  0.00005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.054012  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0777  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 
66 aa  47.8  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1143  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.82 
 
 
70 aa  47.8  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0193117  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4103  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.06 
 
 
90 aa  47.4  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.189024  decreased coverage  0.00486776 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0667  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.94 
 
 
75 aa  47.4  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.20728e-26 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2683  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 
75 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.809629  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3433  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 
75 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3034  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 
66 aa  47  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00295138  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0734  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.94 
 
 
63 aa  46.6  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3289  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 
66 aa  46.2  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.425824  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2482  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.82 
 
 
66 aa  46.6  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.116747  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1749  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.92 
 
 
65 aa  46.2  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000555242  normal  0.0141169 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2127  thiamine-biosynthesis protein ThiS  38.71 
 
 
67 aa  46.2  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0479  sulfur carrier protein ThiS  36.36 
 
 
66 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.738565  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04970  sulfur carrier protein ThiS  36.36 
 
 
66 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3290  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  42 
 
 
331 aa  45.4  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1564  ThiS, thiamine-biosynthesis  36.36 
 
 
67 aa  46.2  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0619282 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2522  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.38 
 
 
77 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2062  sulfur carrier protein ThiS  36.36 
 
 
98 aa  45.4  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2465  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.24 
 
 
68 aa  44.7  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0035  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 
66 aa  44.7  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.91579  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1068  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.32 
 
 
63 aa  44.7  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.60648  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1984  sulfur carrier protein ThiS  36.36 
 
 
93 aa  44.7  0.0004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0654  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.91 
 
 
75 aa  44.7  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0130451  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13201  hypothetical protein  36.23 
 
 
70 aa  44.3  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.537163 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0618  sulfur carrier protein ThiS  38.81 
 
 
67 aa  44.3  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2538  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.33 
 
 
69 aa  44.3  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.694439  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4065  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.32 
 
 
67 aa  44.3  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.58887  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0589  hypothetical protein  33.33 
 
 
65 aa  43.9  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.519327  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1555  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.82 
 
 
67 aa  43.9  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.112904 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02970  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 
66 aa  43.9  0.0008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1268  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.82 
 
 
67 aa  43.9  0.0008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0448831  hitchhiker  0.00213488 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1191  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.32 
 
 
63 aa  43.9  0.0008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1095  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.84 
 
 
68 aa  43.5  0.0009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.364292  normal  0.0606209 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1158  sulfur transfer protein for thiamine biosynthesis  33.87 
 
 
65 aa  43.1  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1262  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.33 
 
 
67 aa  43.1  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5046  hypothetical protein  30.3 
 
 
70 aa  42.7  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.461936  normal  0.383391 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14741  hypothetical protein  34.78 
 
 
69 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.214043  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4110  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.82 
 
 
85 aa  43.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0093  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.3 
 
 
66 aa  42.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.704796  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0697  sulfur carrier protein ThiS  37.31 
 
 
67 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3313  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.3 
 
 
70 aa  42.7  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0641  sulfur carrier protein ThiS  37.31 
 
 
67 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0801  sulfur carrier protein ThiS  37.31 
 
 
67 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0808  sulfur carrier protein ThiS  37.31 
 
 
67 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.47601e-48 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4543  sulfur carrier protein ThiS  37.31 
 
 
67 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.528402 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0731  sulfur carrier protein ThiS  37.31 
 
 
67 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14601  hypothetical protein  34.78 
 
 
69 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0642  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 
66 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1369  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.78 
 
 
69 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0915348  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0885  sulfur carrier protein ThiS  37.31 
 
 
67 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000164722  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0792  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 
66 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.464856  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3474  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 
66 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0252712  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0838  ThiS, thiamine-biosynthesis  33.33 
 
 
67 aa  42  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2933  ThiS, thiamine-biosynthesis  33.33 
 
 
98 aa  42  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0004662  hitchhiker  3.85019e-16 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4741  sulfur carrier protein ThiS  34.85 
 
 
66 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.243463 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2638  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.81 
 
 
68 aa  42  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1633  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  34.85 
 
 
347 aa  41.6  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1345  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 
66 aa  41.2  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14361  hypothetical protein  39.13 
 
 
69 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0073  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 
66 aa  41.6  0.004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0433  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 
66 aa  41.2  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01842  sulfur carrier protein ThiS  34.85 
 
 
66 aa  41.2  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0666  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.82 
 
 
70 aa  41.2  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1150  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.1 
 
 
63 aa  41.2  0.004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000104387  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3235  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 
66 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.320513  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1503  ThiS, thiamine-biosynthesis  33.33 
 
 
72 aa  41.2  0.005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0338  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.31 
 
 
67 aa  40.8  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2002  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.65 
 
 
86 aa  40.8  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.896977  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1058  hypothetical protein  33.33 
 
 
70 aa  40.8  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000643593  normal  0.078632 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5331  sulfur carrier protein ThiS  33.33 
 
 
71 aa  40.8  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.883696  normal  0.241111 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2136  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 
73 aa  40.8  0.007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0641  sulfur carrier protein ThiS  37.31 
 
 
67 aa  40.4  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0877  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 
65 aa  40.4  0.008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0304024  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0788  sulfur carrier protein ThiS  35.82 
 
 
67 aa  40  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.450844  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0044  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.81 
 
 
72 aa  40  0.01  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.164239  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>