51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0073 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0073  thiamine biosynthesis protein ThiS  100 
 
 		 66 aa  128  2.0000000000000002e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1275  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 		 67 aa  54.7  0.0000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.106306  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1865  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 		 67 aa  54.7  0.0000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0959115  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1179  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.91 
 
 		 67 aa  52.4  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0726  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 		 66 aa  52.8  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00139474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01842  sulfur carrier protein ThiS  37.88 
 
 		 66 aa  51.6  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2165  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.82 
 
 		 66 aa  52  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0808  thiamine biosynthesis sulfur transfer protein  32.81 
 
 		 64 aa  50.4  0.000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.408006  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0776  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.38 
 
 		 65 aa  49.7  0.00001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.19393 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1984  sulfur carrier protein ThiS  34.85 
 
 		 93 aa  48.5  0.00003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2062  sulfur carrier protein ThiS  34.85 
 
 		 98 aa  48.5  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0792  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 		 66 aa  48.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.464856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0642  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 		 66 aa  48.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0667  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 		 75 aa  48.1  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.20728e-26 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1191  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.32 
 
 		 63 aa  47.8  0.00005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0654  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 		 75 aa  47.4  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0130451  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1749  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.75 
 
 		 65 aa  47  0.00009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000555242  normal  0.0141169 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0072  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.25 
 
 		 78 aa  47  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2907  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.94 
 
 		 75 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2072  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 		 66 aa  46.2  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.113816  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1068  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.94 
 
 		 63 aa  46.2  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.60648  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0597  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.3 
 
 		 66 aa  45.4  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0734  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.94 
 
 		 63 aa  45.4  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19401  hypothetical protein  36.23 
 
 		 70 aa  45.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.952724 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1554  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 		 211 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.636206  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3189  sulfur carrier protein ThiS  34.85 
 
 		 66 aa  44.7  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.580772  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3313  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.82 
 
 		 70 aa  43.5  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3289  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.425824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1634  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.81 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2683  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.809629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0071  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.74 
 
 		 162 aa  43.5  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.290426  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2432  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  31.82 
 
 		 329 aa  42.7  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.129281  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3433  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 		 75 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3862  ThiS, thiamine-biosynthesis  37.88 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0818304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2522  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.38 
 
 		 77 aa  42  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1317  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1142  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.88 
 
 		 68 aa  42.4  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0035  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.82 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.91579  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0044  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.81 
 
 		 72 aa  42  0.003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.164239  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1150  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.1 
 
 		 63 aa  42  0.003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000104387  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0670  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  27.27 
 
 		 326 aa  42  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3474  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.82 
 
 		 66 aa  42  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0252712  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2111  thiS protein  30.3 
 
 		 66 aa  42  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.719096 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0409  thiamine biosynthesis protein ThiS  24.24 
 
 		 65 aa  41.6  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0838013  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1679  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000223825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5046  hypothetical protein  27.27 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.461936  normal  0.383391 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1345  thiamine biosynthesis protein ThiS  27.27 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4065  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 		 67 aa  40.8  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.58887  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0354  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.94 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000370905  hitchhiker  0.000392774 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2482  thiamine biosynthesis protein ThiS  24.24 
 
 		 66 aa  40.4  0.008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.116747  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2638  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.31 
 
 		 68 aa  40.4  0.009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>