24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0354 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0354  thiamine biosynthesis protein ThiS  100 
 
 		 66 aa  130  6e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000370905  hitchhiker  0.000392774 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0225  thiamine biosynthesis protein ThiS  57.58 
 
 		 66 aa  75.1  0.0000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00707568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0205  thiamine biosynthesis sulfur transfer protein  57.58 
 
 		 66 aa  74.7  0.0000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000222136  decreased coverage  0.0000121699 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0589  hypothetical protein  40.62 
 
 		 65 aa  48.1  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.519327  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4741  sulfur carrier protein ThiS  39.06 
 
 		 66 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.243463 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0642  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.51 
 
 		 66 aa  44.3  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0792  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.51 
 
 		 66 aa  44.3  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.464856  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0433  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.5 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5105  sulfur carrier protein ThiS  39.06 
 
 		 92 aa  42  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.205609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2127  thiamine-biosynthesis protein ThiS  37.31 
 
 		 67 aa  41.6  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4978  sulfur carrier protein ThiS  39.06 
 
 		 66 aa  42  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5331  sulfur carrier protein ThiS  37.5 
 
 		 71 aa  41.6  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.883696  normal  0.241111 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0360  sulfur carrier protein ThiS  43.14 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.18682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3290  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  31.25 
 
 		 331 aa  40.8  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0073  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.94 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4168  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.94 
 
 		 66 aa  40.8  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.852753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3658  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.51 
 
 		 67 aa  40.8  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3147  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.78 
 
 		 66 aa  40.8  0.007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.054012  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3862  ThiS, thiamine-biosynthesis  37.31 
 
 		 67 aa  40.4  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0818304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5155  sulfur carrier protein ThiS  41.18 
 
 		 66 aa  40  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.404683  normal  0.862246 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0667  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.51 
 
 		 75 aa  40  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.20728e-26 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0654  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.51 
 
 		 75 aa  40  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0130451  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0726  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.94 
 
 		 66 aa  40  0.01  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00139474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2465  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 		 68 aa  40  0.01  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>