187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_3147 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_3147  thiamine biosynthesis protein ThiS  100 
 
 
66 aa  133  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.054012  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3504  thiamine biosynthesis protein ThiS  62.12 
 
 
66 aa  84.3  6e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.169395  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5331  sulfur carrier protein ThiS  63.64 
 
 
71 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.883696  normal  0.241111 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4168  thiamine biosynthesis protein ThiS  62.12 
 
 
66 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.852753  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3862  ThiS, thiamine-biosynthesis  57.58 
 
 
67 aa  80.9  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0818304  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0035  thiamine biosynthesis protein ThiS  57.58 
 
 
73 aa  80.1  0.000000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0479  sulfur carrier protein ThiS  62.12 
 
 
66 aa  80.1  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.738565  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0360  sulfur carrier protein ThiS  60.61 
 
 
66 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.18682  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4741  sulfur carrier protein ThiS  62.12 
 
 
66 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.243463 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04970  sulfur carrier protein ThiS  62.12 
 
 
66 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02970  thiamine biosynthesis protein ThiS  60.61 
 
 
66 aa  78.6  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5105  sulfur carrier protein ThiS  59.09 
 
 
92 aa  76.6  0.00000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.205609  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4978  sulfur carrier protein ThiS  59.09 
 
 
66 aa  77  0.00000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0433  thiamine biosynthesis protein ThiS  60.61 
 
 
66 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5155  sulfur carrier protein ThiS  59.09 
 
 
66 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.404683  normal  0.862246 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2465  thiamine biosynthesis protein ThiS  60.29 
 
 
68 aa  74.3  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01842  sulfur carrier protein ThiS  57.58 
 
 
66 aa  73.9  0.0000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2127  thiamine-biosynthesis protein ThiS  56.06 
 
 
67 aa  73.6  0.0000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3235  thiamine biosynthesis protein ThiS  57.58 
 
 
66 aa  73.6  0.0000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.320513  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3189  sulfur carrier protein ThiS  56.06 
 
 
66 aa  69.7  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.580772  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4103  thiamine biosynthesis protein ThiS  53.12 
 
 
90 aa  69.3  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.189024  decreased coverage  0.00486776 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2638  thiamine biosynthesis protein ThiS  52.24 
 
 
68 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0035  thiamine biosynthesis protein ThiS  48.48 
 
 
66 aa  67.8  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.91579  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1633  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  51.52 
 
 
347 aa  66.2  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1317  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.94 
 
 
66 aa  66.6  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2567  thiamine biosynthesis protein ThiS  48.48 
 
 
66 aa  65.9  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.823918  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1268  thiamine biosynthesis protein ThiS  51.52 
 
 
67 aa  66.2  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0448831  hitchhiker  0.00213488 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0792  thiamine biosynthesis protein ThiS  50 
 
 
66 aa  65.5  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.464856  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0642  thiamine biosynthesis protein ThiS  50 
 
 
66 aa  65.5  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4065  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.45 
 
 
67 aa  62.8  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.58887  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1077  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  46.97 
 
 
326 aa  62.4  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129832  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2062  sulfur carrier protein ThiS  50 
 
 
98 aa  62.4  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1984  sulfur carrier protein ThiS  50 
 
 
93 aa  62  0.000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1345  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.42 
 
 
66 aa  61.6  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1142  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.18 
 
 
68 aa  61.6  0.000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3289  thiamine biosynthesis protein ThiS  50 
 
 
66 aa  61.2  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.425824  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2432  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  45.45 
 
 
329 aa  60.1  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.129281  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1455  hypothetical protein  42.42 
 
 
75 aa  59.7  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.282408  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2136  thiamine biosynthesis protein ThiS  50 
 
 
73 aa  59.3  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0589  hypothetical protein  39.39 
 
 
65 aa  57.8  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.519327  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0247  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.5 
 
 
78 aa  57.8  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0975224  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1262  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.79 
 
 
67 aa  57.8  0.00000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2933  ThiS, thiamine-biosynthesis  43.94 
 
 
98 aa  57  0.00000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0004662  hitchhiker  3.85019e-16 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0093  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.91 
 
 
66 aa  56.2  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.704796  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3474  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.91 
 
 
66 aa  56.6  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0252712  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1554  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.94 
 
 
211 aa  55.5  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.636206  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0071  thiamine biosynthesis protein ThiS  50.94 
 
 
162 aa  55.5  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.290426  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0654  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.94 
 
 
75 aa  55.5  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0130451  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0667  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.45 
 
 
75 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.20728e-26 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2098  thiamine biosynthesis protein ThiS  52.17 
 
 
76 aa  55.8  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.219145  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2458  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 
66 aa  55.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4701  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  42.42 
 
 
374 aa  56.2  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468322  normal  0.837099 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2400  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.79 
 
 
74 aa  54.7  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1043  ThiS, thiamine-biosynthesis  37.88 
 
 
66 aa  54.3  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3290  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  43.94 
 
 
331 aa  52.4  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0044  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.75 
 
 
72 aa  52  0.000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.164239  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0612  sulfur carrier protein ThiS  43.28 
 
 
67 aa  52.8  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0610  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 
67 aa  52  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00214937  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2465  ThiS, thiamine-biosynthesis  40.91 
 
 
65 aa  51.6  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.637315  normal  0.928732 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0726  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.91 
 
 
66 aa  51.6  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00139474  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1915  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 
66 aa  51.6  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3313  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 
70 aa  51.2  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0788  sulfur carrier protein ThiS  40.3 
 
 
67 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.450844  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1185  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.33 
 
 
69 aa  50.4  0.000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.029771  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2522  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.75 
 
 
77 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1749  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.68 
 
 
65 aa  50.1  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000555242  normal  0.0141169 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0801  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 
66 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1179  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 
67 aa  50.1  0.00001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0801  sulfur carrier protein ThiS  37.31 
 
 
67 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0697  sulfur carrier protein ThiS  37.31 
 
 
67 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0641  sulfur carrier protein ThiS  37.31 
 
 
67 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2683  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.62 
 
 
75 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.809629  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1503  ThiS, thiamine-biosynthesis  42.03 
 
 
72 aa  49.3  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3433  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.62 
 
 
75 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0731  sulfur carrier protein ThiS  37.31 
 
 
67 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2396  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  43.28 
 
 
327 aa  49.7  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3117  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.43 
 
 
68 aa  49.3  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.295456  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1823  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 
66 aa  48.9  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.100624 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4543  sulfur carrier protein ThiS  37.31 
 
 
67 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.528402 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0709  sulfur carrier protein ThiS  40.91 
 
 
65 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.367637  normal  0.0347852 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0885  sulfur carrier protein ThiS  37.31 
 
 
67 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000164722  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0808  sulfur carrier protein ThiS  37.31 
 
 
67 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.47601e-48 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0641  sulfur carrier protein ThiS  37.31 
 
 
67 aa  48.9  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002075  sulfur carrier protein ThiS  34.38 
 
 
84 aa  48.1  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2907  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 
75 aa  48.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0146  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.38 
 
 
69 aa  48.5  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2165  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.42 
 
 
65 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.433282  normal  0.219669 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3658  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 
67 aa  48.5  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1095  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.82 
 
 
68 aa  48.5  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.364292  normal  0.0606209 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0618  sulfur carrier protein ThiS  37.31 
 
 
67 aa  48.5  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5046  hypothetical protein  37.5 
 
 
70 aa  48.1  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.461936  normal  0.383391 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2892  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 
65 aa  48.1  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.502448  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4093  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.91 
 
 
65 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00467775  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2501  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.03 
 
 
78 aa  48.1  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000495099 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1679  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 
66 aa  47.8  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000223825  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0774  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.12 
 
 
68 aa  47.4  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.176558 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6223  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 
65 aa  47.4  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392752  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5998  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.25 
 
 
81 aa  47.4  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.786244 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1058  hypothetical protein  39.39 
 
 
70 aa  47.4  0.00008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000643593  normal  0.078632 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2584  hypothetical protein  37.1 
 
 
80 aa  47.4  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>