109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2501 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_2501  thiamine biosynthesis protein ThiS  100 
 
 
78 aa  151  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000495099 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2780  thiamine biosynthesis protein ThiS  76.92 
 
 
78 aa  116  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0685562  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5998  thiamine biosynthesis protein ThiS  47.44 
 
 
81 aa  68.6  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.786244 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07970  thiamine biosynthesis protein ThiS  56.41 
 
 
80 aa  63.5  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00847854  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01730  thiamine biosynthesis protein ThiS  47.37 
 
 
80 aa  61.6  0.000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1268  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.31 
 
 
67 aa  56.2  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0448831  hitchhiker  0.00213488 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0774  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.87 
 
 
68 aa  54.7  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.176558 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2782  putative thiamine biosynthesis protein ThiS  42.31 
 
 
66 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.408989  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1153  thiamine biosynthesis protein ThiS  46.97 
 
 
68 aa  52  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3034  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.59 
 
 
66 aa  52  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00295138  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4884  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.87 
 
 
66 aa  51.6  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2465  ThiS, thiamine-biosynthesis  39.74 
 
 
65 aa  51.2  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.637315  normal  0.928732 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0988  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.74 
 
 
67 aa  50.8  0.000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0800067  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0360  sulfur carrier protein ThiS  42.5 
 
 
66 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.18682  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4978  sulfur carrier protein ThiS  42.5 
 
 
66 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4741  sulfur carrier protein ThiS  43.59 
 
 
66 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.243463 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04970  sulfur carrier protein ThiS  42.31 
 
 
66 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5105  sulfur carrier protein ThiS  42.5 
 
 
92 aa  50.1  0.000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.205609  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4278  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.31 
 
 
66 aa  50.4  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0658142  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3887  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.31 
 
 
66 aa  49.7  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5155  sulfur carrier protein ThiS  44.87 
 
 
66 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.404683  normal  0.862246 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2098  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.31 
 
 
76 aa  49.3  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.219145  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4168  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.03 
 
 
66 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.852753  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2589  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 
69 aa  48.5  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.851507  normal  0.0105127 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3147  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.03 
 
 
66 aa  48.1  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.054012  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02970  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.31 
 
 
66 aa  48.1  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2458  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.74 
 
 
66 aa  48.1  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0433  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.59 
 
 
66 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5331  sulfur carrier protein ThiS  41.03 
 
 
71 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.883696  normal  0.241111 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3117  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.46 
 
 
68 aa  47.8  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.295456  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3404  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.18 
 
 
62 aa  47.4  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.376587  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6770  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.31 
 
 
70 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7517  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.59 
 
 
70 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12799  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1043  ThiS, thiamine-biosynthesis  38.46 
 
 
66 aa  47  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0494  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.31 
 
 
108 aa  46.6  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00171819 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3429  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.11 
 
 
63 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0479  sulfur carrier protein ThiS  41.03 
 
 
66 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.738565  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0281  sulfur carrier protein ThiS  32.05 
 
 
66 aa  46.2  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00415569 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03868  sulfur carrier protein ThiS  30.77 
 
 
66 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1503  ThiS, thiamine-biosynthesis  34.62 
 
 
72 aa  45.4  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2432  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  35.9 
 
 
329 aa  46.2  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.129281  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1773  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.9 
 
 
72 aa  45.8  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2892  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.62 
 
 
65 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.502448  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1339  thiamine biosynthesis protein ThiS  50 
 
 
66 aa  45.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0038066 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3747  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.87 
 
 
65 aa  45.8  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0196  sulfur carrier protein ThiS  42.31 
 
 
65 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4225  sulfur carrier protein ThiS  30.77 
 
 
66 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4533  sulfur carrier protein ThiS  30.77 
 
 
66 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2567  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.74 
 
 
66 aa  46.2  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.823918  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4482  sulfur carrier protein ThiS  30.77 
 
 
66 aa  45.8  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4493  sulfur carrier protein ThiS  26.92 
 
 
66 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.439278  hitchhiker  0.00000334012 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4491  sulfur carrier protein ThiS  26.92 
 
 
66 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0124059 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03821  hypothetical protein  30.77 
 
 
66 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6223  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.62 
 
 
65 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392752  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2224  thiamine biosynthesis protein ThiS  56.1 
 
 
69 aa  45.1  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.179012 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1285  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.05 
 
 
68 aa  45.4  0.0003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0709  sulfur carrier protein ThiS  39.74 
 
 
65 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.367637  normal  0.0347852 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6572  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 
69 aa  44.7  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922176  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3292  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.62 
 
 
65 aa  44.7  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.212717 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2062  sulfur carrier protein ThiS  37.18 
 
 
98 aa  44.3  0.0005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0213  sulfur carrier protein ThiS  29.49 
 
 
66 aa  44.3  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1957  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.47 
 
 
63 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.27356  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1984  sulfur carrier protein ThiS  35.9 
 
 
93 aa  43.9  0.0007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01842  sulfur carrier protein ThiS  39.74 
 
 
66 aa  43.9  0.0007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4404  thiamine biosynthesis protein ThiS  26.92 
 
 
66 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2127  thiamine-biosynthesis protein ThiS  37.18 
 
 
67 aa  43.9  0.0008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0239  thiamine biosynthesis sulfur transfer protein  32.05 
 
 
67 aa  43.9  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.164539 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4093  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.46 
 
 
65 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00467775  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5459  sulfur carrier protein ThiS  29.49 
 
 
66 aa  43.5  0.0009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.179752 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34640  sulfur carrier protein ThiS  36.84 
 
 
64 aa  43.5  0.0009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0439272  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0913  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.74 
 
 
64 aa  43.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2165  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.46 
 
 
65 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.433282  normal  0.219669 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3504  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.9 
 
 
66 aa  43.5  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.169395  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0204  sulfur carrier protein ThiS  28.21 
 
 
66 aa  43.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0247781 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0963  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.86 
 
 
68 aa  42.7  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0217  sulfur carrier protein ThiS  26.92 
 
 
66 aa  43.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3290  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  41.03 
 
 
331 aa  42.4  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2465  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.46 
 
 
68 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0035  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.9 
 
 
73 aa  42.7  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4439  sulfur carrier protein ThiS  28.21 
 
 
66 aa  42.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000189024 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4065  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 
67 aa  42.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.58887  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4003  thiamine biosynthesis protein ThiS  29.49 
 
 
66 aa  42  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2396  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  54.29 
 
 
327 aa  42  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0597  thiamine biosynthesis protein ThiS  28.21 
 
 
66 aa  41.6  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4034  sulfur carrier protein ThiS  29.49 
 
 
66 aa  42  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00848806 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1915  thiamine biosynthesis protein ThiS  28.21 
 
 
66 aa  42  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1142  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 
68 aa  41.6  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0615  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.25 
 
 
70 aa  42  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.920589  normal  0.197497 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3235  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.9 
 
 
66 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.320513  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0578  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.9 
 
 
70 aa  41.6  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0035  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.77 
 
 
66 aa  41.6  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.91579  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3189  sulfur carrier protein ThiS  37.18 
 
 
66 aa  41.6  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.580772  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0654  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.46 
 
 
75 aa  41.2  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0130451  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4567  sulfur carrier protein ThiS  25.64 
 
 
66 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000396469 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2907  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.77 
 
 
75 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4103  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.84 
 
 
90 aa  41.2  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.189024  decreased coverage  0.00486776 
 
 
-
 
NC_002950  PG2111  thiS protein  29.63 
 
 
66 aa  40.8  0.005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.719096 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1317  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.05 
 
 
66 aa  41.2  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00363  sulfur carrier protein ThiS  44.74 
 
 
84 aa  41.2  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002075  sulfur carrier protein ThiS  44.74 
 
 
84 aa  41.2  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>