94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0239 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0239  thiamine biosynthesis sulfur transfer protein  100 
 
 		 67 aa  133  9e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.164539 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6572  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.79 
 
 		 69 aa  66.2  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0620  thiamine biosynthesis protein ThiS  46.27 
 
 		 67 aa  65.1  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0213  sulfur carrier protein ThiS  35.82 
 
 		 66 aa  55.1  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3718  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.3 
 
 		 66 aa  54.3  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.827217  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2458  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.28 
 
 		 66 aa  53.9  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0217  sulfur carrier protein ThiS  37.31 
 
 		 66 aa  53.9  0.0000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1339  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.12 
 
 		 66 aa  53.5  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038066 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2465  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.82 
 
 		 66 aa  51.6  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.408493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0615  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.85 
 
 		 70 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.920589  normal  0.197497 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4493  sulfur carrier protein ThiS  31.34 
 
 		 66 aa  50.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.439278  hitchhiker  0.00000334012 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6770  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.03 
 
 		 70 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0281  sulfur carrier protein ThiS  35.82 
 
 		 66 aa  49.7  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00415569 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4491  sulfur carrier protein ThiS  31.34 
 
 		 66 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0124059 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0204  sulfur carrier protein ThiS  31.34 
 
 		 66 aa  48.9  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0247781 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2397  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.82 
 
 		 67 aa  48.5  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0546  sulfur carrier protein ThiS  35.82 
 
 		 65 aa  48.1  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.639054  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2465  ThiS, thiamine-biosynthesis  38.81 
 
 		 65 aa  48.5  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.637315  normal  0.928732 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2098  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 		 76 aa  48.5  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.219145  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0558  sulfur carrier protein ThiS  35.82 
 
 		 65 aa  48.1  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.577012 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0709  sulfur carrier protein ThiS  38.81 
 
 		 65 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.367637  normal  0.0347852 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3504  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.31 
 
 		 66 aa  48.5  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.169395  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4567  sulfur carrier protein ThiS  32.84 
 
 		 66 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000396469 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0536  sulfur carrier protein ThiS  35.82 
 
 		 65 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.355428  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3873  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.33 
 
 		 66 aa  47.8  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1524  hypothetical protein  35.82 
 
 		 67 aa  47.8  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0479  sulfur carrier protein ThiS  34.33 
 
 		 66 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.738565  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4371  sulfur carrier protein ThiS  32.84 
 
 		 66 aa  47.4  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2892  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.3 
 
 		 65 aa  47.4  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.502448  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1459  hypothetical protein  34.33 
 
 		 67 aa  47  0.00008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1153  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.33 
 
 		 68 aa  47  0.00009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04970  sulfur carrier protein ThiS  34.33 
 
 		 66 aa  47  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5331  sulfur carrier protein ThiS  32.84 
 
 		 71 aa  47  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.883696  normal  0.241111 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3034  thiamine biosynthesis protein ThiS  29.85 
 
 		 66 aa  46.2  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00295138  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0433  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.34 
 
 		 66 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2165  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.82 
 
 		 65 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.433282  normal  0.219669 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7517  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.03 
 
 		 70 aa  47  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12799  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2782  putative thiamine biosynthesis protein ThiS  34.33 
 
 		 66 aa  45.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.408989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4404  thiamine biosynthesis protein ThiS  29.85 
 
 		 66 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2390  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.3 
 
 		 65 aa  46.2  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.233708  normal  0.952804 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0774  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.29 
 
 		 68 aa  45.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.176558 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1285  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.82 
 
 		 68 aa  46.2  0.0002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4003  thiamine biosynthesis protein ThiS  28.36 
 
 		 66 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4034  sulfur carrier protein ThiS  28.36 
 
 		 66 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00848806 
 
 
-
 
NC_002950  PG2111  thiS protein  35.82 
 
 		 66 aa  45.4  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.719096 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4168  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.84 
 
 		 66 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.852753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1937  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.84 
 
 		 65 aa  44.7  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.841225  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4978  sulfur carrier protein ThiS  32.84 
 
 		 66 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1785  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.84 
 
 		 65 aa  44.7  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.226514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5459  sulfur carrier protein ThiS  28.36 
 
 		 66 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.179752 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03821  hypothetical protein  28.36 
 
 		 66 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03868  sulfur carrier protein ThiS  28.36 
 
 		 66 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4482  sulfur carrier protein ThiS  28.36 
 
 		 66 aa  44.7  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3117  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.88 
 
 		 68 aa  44.3  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.295456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4225  sulfur carrier protein ThiS  28.36 
 
 		 66 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4533  sulfur carrier protein ThiS  28.36 
 
 		 66 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5105  sulfur carrier protein ThiS  32.84 
 
 		 92 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.205609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0196  sulfur carrier protein ThiS  35.82 
 
 		 65 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0604  thiamine biosynthesis protein ThiS  48.78 
 
 		 70 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.050819  normal  0.048745 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0578  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.21 
 
 		 70 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2501  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.05 
 
 		 78 aa  43.9  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000495099 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0360  sulfur carrier protein ThiS  31.34 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.18682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4439  sulfur carrier protein ThiS  28.36 
 
 		 66 aa  43.5  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000189024 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1142  thiamine biosynthesis protein ThiS  29.41 
 
 		 68 aa  42.7  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0963  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 		 68 aa  42.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3944  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.43 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000530679  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0597  thiamine biosynthesis protein ThiS  29.85 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1857  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.34 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0044  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.33 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.107556  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0838  ThiS, thiamine-biosynthesis  32.84 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1043  ThiS, thiamine-biosynthesis  32.35 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4741  sulfur carrier protein ThiS  29.85 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.243463 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6223  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.82 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1185  thiamine biosynthesis protein ThiS  28.36 
 
 		 69 aa  42.7  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.029771  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0579  thiamine biosynthesis protein ThiS  46.34 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.16999  hitchhiker  0.00610226 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0344  sulfur carrier protein ThiS  32.31 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0452  sulfur carrier protein ThiS  32.31 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000134216 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4278  thiamine biosynthesis protein ThiS  29.85 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0658142  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1604  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.23 
 
 		 68 aa  42  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.36595  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3887  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.84 
 
 		 66 aa  42  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002075  sulfur carrier protein ThiS  27.94 
 
 		 84 aa  42  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2400  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.34 
 
 		 74 aa  41.6  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01730  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.89 
 
 		 80 aa  41.6  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2538  thiamine biosynthesis protein ThiS  28.36 
 
 		 69 aa  41.6  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.694439  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3747  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.82 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00363  sulfur carrier protein ThiS  27.94 
 
 		 84 aa  41.2  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3292  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.33 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.212717 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2780  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.77 
 
 		 78 aa  40.8  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0685562  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5155  sulfur carrier protein ThiS  29.85 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.404683  normal  0.862246 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0072  thiamine biosynthesis protein ThiS  29.85 
 
 		 78 aa  40.4  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1262  thiamine biosynthesis protein ThiS  36 
 
 		 67 aa  40.8  0.007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0589  hypothetical protein  28.36 
 
 		 65 aa  40.8  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.519327  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0612  sulfur carrier protein ThiS  29.41 
 
 		 67 aa  40.4  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34640  sulfur carrier protein ThiS  30.77 
 
 		 64 aa  40  0.01  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0439272  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>