99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1785 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1937  thiamine biosynthesis protein ThiS  100 
 
 		 65 aa  128  2.0000000000000002e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.841225  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1785  thiamine biosynthesis protein ThiS  100 
 
 		 65 aa  128  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.226514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3292  thiamine biosynthesis protein ThiS  67.69 
 
 		 65 aa  95.1  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.212717 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3069  thiamine biosynthesis protein ThiS  72.31 
 
 		 65 aa  87  7e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0208668  normal  0.582479 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2465  thiamine biosynthesis protein ThiS  61.54 
 
 		 65 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.279126  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2397  thiamine biosynthesis protein ThiS  63.08 
 
 		 67 aa  80.5  0.000000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2773  sulfur carrier protein ThiS  52.31 
 
 		 65 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.374712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0384  sulfur carrier protein ThiS  50.77 
 
 		 91 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3574  sulfur carrier protein ThiS  50.77 
 
 		 65 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000430861 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3225  sulfur carrier protein ThiS  53.85 
 
 		 65 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2729  sulfur carrier protein ThiS  53.85 
 
 		 65 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3709  sulfur carrier protein ThiS  53.85 
 
 		 65 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2779  sulfur carrier protein ThiS  53.85 
 
 		 65 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3738  sulfur carrier protein ThiS  53.85 
 
 		 65 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3680  sulfur carrier protein ThiS  53.85 
 
 		 65 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1774  sulfur carrier protein ThiS  53.85 
 
 		 65 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0329  sulfur carrier protein ThiS  50.77 
 
 		 65 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0894  thiamine biosynthesis protein ThiS  49.23 
 
 		 65 aa  70.5  0.000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0249295  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2696  sulfur carrier protein ThiS  50.77 
 
 		 65 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0411  sulfur carrier protein ThiS  50.77 
 
 		 65 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0390  sulfur carrier protein ThiS  50.77 
 
 		 65 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0314  sulfur carrier protein ThiS  50.77 
 
 		 65 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.388373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3007  sulfur carrier protein ThiS  50.77 
 
 		 65 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3509  sulfur carrier protein ThiS  50.77 
 
 		 65 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.20038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0338  sulfur carrier protein ThiS  49.23 
 
 		 65 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.518448  normal  0.375148 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0111  sulfur carrier protein ThiS  50.68 
 
 		 75 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0761015  normal  0.947366 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3644  sulfur carrier protein ThiS  49.28 
 
 		 71 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3320  sulfur carrier protein ThiS  49.28 
 
 		 71 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4313  thiamine biosynthesis protein ThiS  66.15 
 
 		 69 aa  60.5  0.000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.383978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0035  thiamine biosynthesis protein ThiS  48.48 
 
 		 66 aa  58.5  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.91579  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0207  sulfur carrier protein ThiS  49.23 
 
 		 65 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.672002  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1339  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 		 66 aa  52  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038066 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0479  sulfur carrier protein ThiS  39.39 
 
 		 66 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.738565  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0164  sulfur carrier protein ThiS  53.85 
 
 		 65 aa  51.2  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02970  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 		 66 aa  48.9  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3235  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 		 66 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.320513  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0913  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.54 
 
 		 64 aa  48.5  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.133934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3034  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 		 66 aa  48.1  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00295138  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3474  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 		 66 aa  48.5  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0252712  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04970  sulfur carrier protein ThiS  37.88 
 
 		 66 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1455  hypothetical protein  43.94 
 
 		 75 aa  48.1  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.282408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2782  putative thiamine biosynthesis protein ThiS  40.91 
 
 		 66 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.408989  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0612  sulfur carrier protein ThiS  37.31 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0433  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 		 66 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4741  sulfur carrier protein ThiS  36.36 
 
 		 66 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.243463 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1345  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 		 66 aa  45.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1317  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1633  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  33.33 
 
 		 347 aa  45.4  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5331  sulfur carrier protein ThiS  34.85 
 
 		 71 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.883696  normal  0.241111 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0146  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 		 69 aa  46.2  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2519  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 		 66 aa  45.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2400  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.33 
 
 		 74 aa  45.4  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34640  sulfur carrier protein ThiS  35.94 
 
 		 64 aa  45.4  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0439272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4034  sulfur carrier protein ThiS  36.36 
 
 		 66 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00848806 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4003  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 		 66 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3718  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 		 66 aa  45.1  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.827217  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4278  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 		 66 aa  45.1  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0658142  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0239  thiamine biosynthesis sulfur transfer protein  32.84 
 
 		 67 aa  44.7  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.164539 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1608  sulfur transfer protein  36.36 
 
 		 77 aa  44.7  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.156932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4168  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 		 66 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.852753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3887  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 		 66 aa  44.3  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1416  sulfur carrier protein ThiS  37.31 
 
 		 67 aa  44.3  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2465  ThiS, thiamine-biosynthesis  55.88 
 
 		 65 aa  44.7  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.637315  normal  0.928732 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1432  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 		 66 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0567426  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1334  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 		 66 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0203428  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5998  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.03 
 
 		 81 aa  43.9  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.786244 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1077  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  33.33 
 
 		 326 aa  43.9  0.0008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129832  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2482  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 		 66 aa  43.9  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.116747  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3504  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 		 66 aa  43.5  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.169395  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0913  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.4 
 
 		 64 aa  43.5  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4533  sulfur carrier protein ThiS  34.85 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2098  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.88 
 
 		 76 aa  42.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.219145  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0409  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.94 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0838013  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0363  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.3 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0021  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.71 
 
 		 69 aa  42.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.71048  normal  0.598538 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6223  thiamine biosynthesis protein ThiS  48.57 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0093  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.704796  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01842  sulfur carrier protein ThiS  34.85 
 
 		 66 aa  42  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0204  sulfur carrier protein ThiS  31.82 
 
 		 66 aa  42  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0247781 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4439  sulfur carrier protein ThiS  34.85 
 
 		 66 aa  42  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000189024 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0035  thiamine biosynthesis protein ThiS  28.79 
 
 		 73 aa  41.6  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2892  thiamine biosynthesis protein ThiS  52.94 
 
 		 65 aa  41.6  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.502448  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0642  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5105  sulfur carrier protein ThiS  33.33 
 
 		 92 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.205609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2165  thiamine biosynthesis protein ThiS  55.88 
 
 		 65 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.433282  normal  0.219669 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3651  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.68 
 
 		 64 aa  41.6  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0792  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.464856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1262  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.84 
 
 		 67 aa  41.2  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4978  sulfur carrier protein ThiS  33.33 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03821  hypothetical protein  33.33 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0667  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 		 75 aa  41.2  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.20728e-26 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0709  sulfur carrier protein ThiS  34.85 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.367637  normal  0.0347852 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5459  sulfur carrier protein ThiS  33.33 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.179752 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3189  sulfur carrier protein ThiS  36.36 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.580772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4482  sulfur carrier protein ThiS  33.33 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4225  sulfur carrier protein ThiS  33.33 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03868  sulfur carrier protein ThiS  33.33 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0654  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 		 75 aa  40.4  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0130451  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2567  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 		 66 aa  40  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.823918  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>