61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0021 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0021  thiamine biosynthesis protein ThiS  100 
 
 		 69 aa  143  8.000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.71048  normal  0.598538 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2465  ThiS, thiamine-biosynthesis  36.36 
 
 		 65 aa  52  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.637315  normal  0.928732 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0146  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.43 
 
 		 69 aa  52  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3651  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 		 64 aa  51.2  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6223  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 		 65 aa  48.9  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2165  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 		 65 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.433282  normal  0.219669 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2563  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.91 
 
 		 65 aa  49.3  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.183271  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0913  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 		 64 aa  49.3  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.133934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6770  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.14 
 
 		 70 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3292  thiamine biosynthesis protein ThiS  51.43 
 
 		 65 aa  47.8  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.212717 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1415  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 		 65 aa  47.4  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2165  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 		 65 aa  47.4  0.00006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.153528  normal  0.819045 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0384  sulfur carrier protein ThiS  50 
 
 		 91 aa  47  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2773  sulfur carrier protein ThiS  47.62 
 
 		 65 aa  47  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.374712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2892  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.502448  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0207  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.62 
 
 		 65 aa  46.2  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.549071  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0216  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.06 
 
 		 65 aa  45.8  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4093  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.94 
 
 		 65 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00467775  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1455  hypothetical protein  39.13 
 
 		 75 aa  45.1  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.282408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0314  sulfur carrier protein ThiS  45.24 
 
 		 65 aa  45.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.388373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3007  sulfur carrier protein ThiS  35.82 
 
 		 65 aa  45.4  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3069  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.11 
 
 		 65 aa  45.1  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0208668  normal  0.582479 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7517  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.71 
 
 		 70 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12799  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3574  sulfur carrier protein ThiS  45.24 
 
 		 65 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000430861 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0390  sulfur carrier protein ThiS  45.24 
 
 		 65 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2098  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.78 
 
 		 76 aa  44.7  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.219145  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2729  sulfur carrier protein ThiS  43.9 
 
 		 65 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2779  sulfur carrier protein ThiS  43.9 
 
 		 65 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3738  sulfur carrier protein ThiS  43.9 
 
 		 65 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3680  sulfur carrier protein ThiS  43.9 
 
 		 65 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1774  sulfur carrier protein ThiS  43.9 
 
 		 65 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3709  sulfur carrier protein ThiS  43.9 
 
 		 65 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3225  sulfur carrier protein ThiS  43.9 
 
 		 65 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2465  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.74 
 
 		 65 aa  44.7  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.279126  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0411  sulfur carrier protein ThiS  45.24 
 
 		 65 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2696  sulfur carrier protein ThiS  45.24 
 
 		 65 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0615  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.29 
 
 		 70 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.920589  normal  0.197497 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2224  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.33 
 
 		 69 aa  44.3  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.179012 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2458  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 		 66 aa  43.9  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2397  thiamine biosynthesis protein ThiS  47.62 
 
 		 67 aa  43.9  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3509  sulfur carrier protein ThiS  43.9 
 
 		 65 aa  43.9  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.20038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1957  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.94 
 
 		 63 aa  43.5  0.0009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.27356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0093  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.68 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.704796  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3429  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.94 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4172  sulfur carrier protein ThiS  34.85 
 
 		 65 aa  42.7  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.455905 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0040  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.12194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1785  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.71 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.226514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0963  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.78 
 
 		 68 aa  42.4  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1937  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.71 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.841225  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0207  sulfur carrier protein ThiS  40.3 
 
 		 65 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.672002  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4313  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.42 
 
 		 69 aa  41.6  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.383978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0329  sulfur carrier protein ThiS  48.57 
 
 		 65 aa  41.2  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2589  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.39 
 
 		 69 aa  41.2  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.851507  normal  0.0105127 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0338  sulfur carrier protein ThiS  48.57 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.518448  normal  0.375148 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0894  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.5 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0249295  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3504  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.81 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.169395  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0620  thiamine biosynthesis protein ThiS  28.36 
 
 		 67 aa  40.8  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1524  hypothetical protein  35.29 
 
 		 67 aa  40.8  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3887  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 		 66 aa  40.4  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3873  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 		 66 aa  40.4  0.009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2400  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.88 
 
 		 74 aa  40  0.01  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>