50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2465 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2465  thiamine biosynthesis protein ThiS  100 
 
 		 65 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.279126  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1937  thiamine biosynthesis protein ThiS  61.54 
 
 		 65 aa  81.3  0.000000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.841225  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1785  thiamine biosynthesis protein ThiS  61.54 
 
 		 65 aa  81.3  0.000000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.226514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0894  thiamine biosynthesis protein ThiS  49.23 
 
 		 65 aa  75.9  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0249295  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2397  thiamine biosynthesis protein ThiS  53.85 
 
 		 67 aa  73.6  0.0000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3069  thiamine biosynthesis protein ThiS  61.54 
 
 		 65 aa  73.6  0.0000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0208668  normal  0.582479 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3292  thiamine biosynthesis protein ThiS  50.77 
 
 		 65 aa  70.9  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.212717 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0384  sulfur carrier protein ThiS  49.23 
 
 		 91 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3574  sulfur carrier protein ThiS  47.69 
 
 		 65 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000430861 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2773  sulfur carrier protein ThiS  47.69 
 
 		 65 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.374712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3007  sulfur carrier protein ThiS  49.23 
 
 		 65 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4313  thiamine biosynthesis protein ThiS  66.15 
 
 		 69 aa  65.1  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.383978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0314  sulfur carrier protein ThiS  47.69 
 
 		 65 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.388373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3738  sulfur carrier protein ThiS  46.15 
 
 		 65 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2779  sulfur carrier protein ThiS  46.15 
 
 		 65 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3680  sulfur carrier protein ThiS  46.15 
 
 		 65 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3225  sulfur carrier protein ThiS  46.15 
 
 		 65 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1774  sulfur carrier protein ThiS  46.15 
 
 		 65 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3709  sulfur carrier protein ThiS  46.15 
 
 		 65 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2729  sulfur carrier protein ThiS  46.15 
 
 		 65 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2696  sulfur carrier protein ThiS  46.15 
 
 		 65 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0411  sulfur carrier protein ThiS  46.15 
 
 		 65 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0390  sulfur carrier protein ThiS  46.15 
 
 		 65 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0329  sulfur carrier protein ThiS  44.62 
 
 		 65 aa  62  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3509  sulfur carrier protein ThiS  44.62 
 
 		 65 aa  62  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.20038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0338  sulfur carrier protein ThiS  44.62 
 
 		 65 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.518448  normal  0.375148 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3644  sulfur carrier protein ThiS  47.83 
 
 		 71 aa  60.5  0.000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3320  sulfur carrier protein ThiS  47.83 
 
 		 71 aa  60.5  0.000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0111  sulfur carrier protein ThiS  45.21 
 
 		 75 aa  60.5  0.000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0761015  normal  0.947366 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0207  sulfur carrier protein ThiS  46.15 
 
 		 65 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.672002  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2782  putative thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 		 66 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.408989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0164  sulfur carrier protein ThiS  52.31 
 
 		 65 aa  49.3  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0146  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 		 69 aa  48.5  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1455  hypothetical protein  40.91 
 
 		 75 aa  48.5  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.282408  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1077  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  37.88 
 
 		 326 aa  48.1  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129832  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1043  ThiS, thiamine-biosynthesis  39.39 
 
 		 66 aa  47.8  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1339  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 		 66 aa  46.2  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038066 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0204  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.85 
 
 		 72 aa  45.4  0.0002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4278  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.82 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0658142  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0035  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.91 
 
 		 66 aa  46.2  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.91579  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0913  thiamine biosynthesis protein ThiS  50.75 
 
 		 64 aa  45.4  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.133934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0021  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.74 
 
 		 69 aa  44.7  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.71048  normal  0.598538 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1633  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  30.3 
 
 		 347 aa  43.9  0.0008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3887  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.33 
 
 		 66 aa  43.9  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1459  hypothetical protein  34.85 
 
 		 67 aa  43.5  0.0009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1524  hypothetical protein  36.36 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3034  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.82 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00295138  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3404  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.38 
 
 		 62 aa  41.2  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.376587  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2165  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.92 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.433282  normal  0.219669 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4172  sulfur carrier protein ThiS  33.33 
 
 		 65 aa  40.4  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.455905 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>