44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3320 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_3320  sulfur carrier protein ThiS  100 
 
 		 71 aa  140  7e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3644  sulfur carrier protein ThiS  100 
 
 		 71 aa  140  7e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0111  sulfur carrier protein ThiS  86.67 
 
 		 75 aa  125  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0761015  normal  0.947366 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2397  thiamine biosynthesis protein ThiS  47.89 
 
 		 67 aa  68.9  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1785  thiamine biosynthesis protein ThiS  49.28 
 
 		 65 aa  68.6  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.226514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1937  thiamine biosynthesis protein ThiS  49.28 
 
 		 65 aa  68.6  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.841225  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3292  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.93 
 
 		 65 aa  65.5  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.212717 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3069  thiamine biosynthesis protein ThiS  50.72 
 
 		 65 aa  65.1  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0208668  normal  0.582479 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0384  sulfur carrier protein ThiS  46.38 
 
 		 91 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3574  sulfur carrier protein ThiS  44.93 
 
 		 65 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000430861 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2773  sulfur carrier protein ThiS  44.93 
 
 		 65 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.374712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3007  sulfur carrier protein ThiS  44.93 
 
 		 65 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2465  thiamine biosynthesis protein ThiS  47.83 
 
 		 65 aa  60.5  0.000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.279126  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0329  sulfur carrier protein ThiS  42.03 
 
 		 65 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0314  sulfur carrier protein ThiS  42.03 
 
 		 65 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.388373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0411  sulfur carrier protein ThiS  42.03 
 
 		 65 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0390  sulfur carrier protein ThiS  42.03 
 
 		 65 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2696  sulfur carrier protein ThiS  42.03 
 
 		 65 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2779  sulfur carrier protein ThiS  42.03 
 
 		 65 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3738  sulfur carrier protein ThiS  42.03 
 
 		 65 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3680  sulfur carrier protein ThiS  42.03 
 
 		 65 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1774  sulfur carrier protein ThiS  42.03 
 
 		 65 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2729  sulfur carrier protein ThiS  42.03 
 
 		 65 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3225  sulfur carrier protein ThiS  42.03 
 
 		 65 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3709  sulfur carrier protein ThiS  42.03 
 
 		 65 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0338  sulfur carrier protein ThiS  42.03 
 
 		 65 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.518448  normal  0.375148 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0207  sulfur carrier protein ThiS  53.62 
 
 		 65 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.672002  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3509  sulfur carrier protein ThiS  40.58 
 
 		 65 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.20038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0894  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.78 
 
 		 65 aa  52.8  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0249295  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4278  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.68 
 
 		 66 aa  46.6  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0658142  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1608  sulfur transfer protein  42.86 
 
 		 77 aa  44.7  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.156932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2432  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.8 
 
 		 83 aa  43.9  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.660547 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0035  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.39 
 
 		 73 aa  43.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0164  sulfur carrier protein ThiS  63.64 
 
 		 65 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3189  sulfur carrier protein ThiS  36.23 
 
 		 66 aa  43.5  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.580772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0146  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.86 
 
 		 69 aa  42.4  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3474  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.65 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0252712  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0035  thiamine biosynthesis protein ThiS  40 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.91579  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3235  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.86 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.320513  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3504  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.76 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.169395  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0479  sulfur carrier protein ThiS  32.86 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.738565  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2062  sulfur carrier protein ThiS  30.43 
 
 		 98 aa  40.8  0.007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2400  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.14 
 
 		 74 aa  40.8  0.007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1984  sulfur carrier protein ThiS  30.43 
 
 		 93 aa  40.4  0.008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>