72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0207 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A0207  sulfur carrier protein ThiS  100 
 
 
65 aa  123  8.000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.672002  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0164  sulfur carrier protein ThiS  81.54 
 
 
65 aa  74.7  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2397  thiamine biosynthesis protein ThiS  52.31 
 
 
67 aa  73.9  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0384  sulfur carrier protein ThiS  55.38 
 
 
91 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2779  sulfur carrier protein ThiS  56.92 
 
 
65 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3738  sulfur carrier protein ThiS  56.92 
 
 
65 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2729  sulfur carrier protein ThiS  56.92 
 
 
65 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3680  sulfur carrier protein ThiS  56.92 
 
 
65 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1774  sulfur carrier protein ThiS  56.92 
 
 
65 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3709  sulfur carrier protein ThiS  56.92 
 
 
65 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3225  sulfur carrier protein ThiS  56.92 
 
 
65 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2773  sulfur carrier protein ThiS  55.38 
 
 
65 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.374712  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0314  sulfur carrier protein ThiS  55.38 
 
 
65 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.388373  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3574  sulfur carrier protein ThiS  53.85 
 
 
65 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000430861 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0390  sulfur carrier protein ThiS  53.85 
 
 
65 aa  69.3  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2696  sulfur carrier protein ThiS  53.85 
 
 
65 aa  69.3  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0411  sulfur carrier protein ThiS  53.85 
 
 
65 aa  69.3  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3007  sulfur carrier protein ThiS  55.38 
 
 
65 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3509  sulfur carrier protein ThiS  52.31 
 
 
65 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.20038  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0338  sulfur carrier protein ThiS  52.31 
 
 
65 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.518448  normal  0.375148 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0329  sulfur carrier protein ThiS  50.77 
 
 
65 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3320  sulfur carrier protein ThiS  53.62 
 
 
71 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3644  sulfur carrier protein ThiS  53.62 
 
 
71 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0111  sulfur carrier protein ThiS  47.95 
 
 
75 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0761015  normal  0.947366 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2465  thiamine biosynthesis protein ThiS  46.15 
 
 
65 aa  61.2  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.279126  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1937  thiamine biosynthesis protein ThiS  49.23 
 
 
65 aa  61.2  0.000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.841225  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1785  thiamine biosynthesis protein ThiS  49.23 
 
 
65 aa  61.2  0.000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.226514  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3292  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.62 
 
 
65 aa  59.3  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.212717 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3069  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.62 
 
 
65 aa  56.2  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0208668  normal  0.582479 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02970  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.42 
 
 
66 aa  53.5  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2465  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.12 
 
 
68 aa  52.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5998  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.07 
 
 
81 aa  51.2  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.786244 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04970  sulfur carrier protein ThiS  39.39 
 
 
66 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0894  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.85 
 
 
65 aa  50.4  0.000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0249295  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1455  hypothetical protein  45.45 
 
 
75 aa  50.4  0.000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.282408  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0479  sulfur carrier protein ThiS  37.88 
 
 
66 aa  48.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.738565  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3189  sulfur carrier protein ThiS  37.88 
 
 
66 aa  47  0.00009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.580772  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4741  sulfur carrier protein ThiS  37.88 
 
 
66 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.243463 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4168  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 
66 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.852753  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3235  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 
66 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.320513  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0642  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.13 
 
 
66 aa  45.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0792  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.13 
 
 
66 aa  45.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.464856  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0913  thiamine biosynthesis protein ThiS  40 
 
 
64 aa  45.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.133934  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0021  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.3 
 
 
69 aa  46.2  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.71048  normal  0.598538 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3404  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.54 
 
 
62 aa  45.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.376587  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1608  sulfur transfer protein  45.16 
 
 
77 aa  44.7  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.156932  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3887  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 
66 aa  44.3  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2062  sulfur carrier protein ThiS  31.82 
 
 
98 aa  43.9  0.0007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1339  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 
66 aa  43.9  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0038066 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1984  sulfur carrier protein ThiS  31.82 
 
 
93 aa  43.5  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0146  thiamine biosynthesis protein ThiS  48.57 
 
 
69 aa  43.5  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4065  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 
67 aa  43.5  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.58887  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3474  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 
66 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0252712  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1933  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.92 
 
 
65 aa  42.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2098  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.31 
 
 
76 aa  42.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.219145  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0093  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 
66 aa  42  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.704796  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3117  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.58 
 
 
68 aa  42  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.295456  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0207  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 
65 aa  42  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.549071  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2780  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.46 
 
 
78 aa  41.6  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0685562  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2563  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.3 
 
 
65 aa  42  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.183271  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0035  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 
66 aa  41.2  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.91579  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0252  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.43 
 
 
70 aa  41.6  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3651  thiamine biosynthesis protein ThiS  40 
 
 
64 aa  41.2  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3147  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 
66 aa  41.2  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.054012  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0433  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 
66 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0913  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 
64 aa  40.8  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0610  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 
67 aa  40.4  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00214937  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2127  thiamine-biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 
67 aa  40.8  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1524  hypothetical protein  48.57 
 
 
67 aa  40.4  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5331  sulfur carrier protein ThiS  34.85 
 
 
71 aa  40.4  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.883696  normal  0.241111 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2567  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 
66 aa  40  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.823918  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1749  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.94 
 
 
65 aa  40  0.01  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000555242  normal  0.0141169 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>