132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0913 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0913  thiamine biosynthesis protein ThiS  100 
 
 		 64 aa  129  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0409  thiamine biosynthesis protein ThiS  55.38 
 
 		 65 aa  67.8  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0838013  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1043  ThiS, thiamine-biosynthesis  53.03 
 
 		 66 aa  65.5  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1339  thiamine biosynthesis protein ThiS  53.03 
 
 		 66 aa  65.1  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038066 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4278  thiamine biosynthesis protein ThiS  53.03 
 
 		 66 aa  63.2  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0658142  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3034  thiamine biosynthesis protein ThiS  53.03 
 
 		 66 aa  62  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00295138  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5998  thiamine biosynthesis protein ThiS  52.11 
 
 		 81 aa  61.6  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.786244 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3887  thiamine biosynthesis protein ThiS  51.52 
 
 		 66 aa  60.8  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2098  thiamine biosynthesis protein ThiS  52.17 
 
 		 76 aa  60.1  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.219145  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2390  thiamine biosynthesis protein ThiS  40 
 
 		 65 aa  59.7  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.233708  normal  0.952804 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02970  thiamine biosynthesis protein ThiS  48.48 
 
 		 66 aa  59.3  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0536  sulfur carrier protein ThiS  46.15 
 
 		 65 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.355428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0196  sulfur carrier protein ThiS  46.15 
 
 		 65 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0709  sulfur carrier protein ThiS  46.15 
 
 		 65 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.367637  normal  0.0347852 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0546  sulfur carrier protein ThiS  44.62 
 
 		 65 aa  57  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.639054  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0558  sulfur carrier protein ThiS  44.62 
 
 		 65 aa  57  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.577012 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2782  putative thiamine biosynthesis protein ThiS  51.52 
 
 		 66 aa  57  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.408989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0774  thiamine biosynthesis protein ThiS  51.47 
 
 		 68 aa  56.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.176558 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2458  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.45 
 
 		 66 aa  55.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4168  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.45 
 
 		 66 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.852753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04970  sulfur carrier protein ThiS  43.94 
 
 		 66 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4491  sulfur carrier protein ThiS  36.36 
 
 		 66 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0124059 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4741  sulfur carrier protein ThiS  46.97 
 
 		 66 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.243463 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0093  thiamine biosynthesis protein ThiS  48.48 
 
 		 66 aa  53.9  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.704796  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6223  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.54 
 
 		 65 aa  53.5  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2224  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.78 
 
 		 69 aa  53.5  0.0000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.179012 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2165  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.08 
 
 		 65 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.433282  normal  0.219669 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0988  thiamine biosynthesis protein ThiS  46.97 
 
 		 67 aa  52.8  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0800067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34640  sulfur carrier protein ThiS  46.77 
 
 		 64 aa  52  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0439272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1153  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.62 
 
 		 68 aa  51.6  0.000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2396  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  41.79 
 
 		 327 aa  51.6  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0479  sulfur carrier protein ThiS  42.42 
 
 		 66 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.738565  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5155  sulfur carrier protein ThiS  43.94 
 
 		 66 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.404683  normal  0.862246 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4493  sulfur carrier protein ThiS  34.85 
 
 		 66 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.439278  hitchhiker  0.00000334012 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3504  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.45 
 
 		 66 aa  51.2  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.169395  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2465  ThiS, thiamine-biosynthesis  41.54 
 
 		 65 aa  50.8  0.000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.637315  normal  0.928732 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0360  sulfur carrier protein ThiS  42.42 
 
 		 66 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.18682  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0433  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.94 
 
 		 66 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1773  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 		 72 aa  49.7  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3404  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.42 
 
 		 62 aa  50.1  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.376587  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4978  sulfur carrier protein ThiS  42.42 
 
 		 66 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4172  sulfur carrier protein ThiS  40 
 
 		 65 aa  49.7  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.455905 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2062  sulfur carrier protein ThiS  43.94 
 
 		 98 aa  50.1  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1984  sulfur carrier protein ThiS  43.94 
 
 		 93 aa  49.7  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5105  sulfur carrier protein ThiS  42.42 
 
 		 92 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.205609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2892  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.46 
 
 		 65 aa  48.9  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.502448  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2567  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.94 
 
 		 66 aa  48.9  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.823918  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3747  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.08 
 
 		 65 aa  49.3  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4567  sulfur carrier protein ThiS  34.85 
 
 		 66 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000396469 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2465  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.18 
 
 		 68 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0204  sulfur carrier protein ThiS  33.33 
 
 		 66 aa  48.1  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0247781 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4404  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 		 66 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3117  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.59 
 
 		 68 aa  48.9  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.295456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1957  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.27 
 
 		 63 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.27356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3429  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.86 
 
 		 63 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0615  thiamine biosynthesis protein ThiS  40 
 
 		 70 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.920589  normal  0.197497 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5331  sulfur carrier protein ThiS  42.42 
 
 		 71 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.883696  normal  0.241111 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0578  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.25 
 
 		 70 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0040  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.3 
 
 		 65 aa  47.4  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.12194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5919  sulfur carrier protein ThiS  38.46 
 
 		 65 aa  47.4  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168418  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10421  sulfur carrier protein ThiS  47.17 
 
 		 68 aa  47  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.117678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2907  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 		 75 aa  47.4  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3873  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 		 66 aa  47  0.00009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03868  sulfur carrier protein ThiS  33.33 
 
 		 66 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03821  hypothetical protein  33.33 
 
 		 66 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4225  sulfur carrier protein ThiS  33.33 
 
 		 66 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3292  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.212717 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4482  sulfur carrier protein ThiS  33.33 
 
 		 66 aa  46.6  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4371  sulfur carrier protein ThiS  34.85 
 
 		 66 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1564  ThiS, thiamine-biosynthesis  40.91 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0619282 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0146  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 		 69 aa  45.4  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3147  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.94 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.054012  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2780  thiamine biosynthesis protein ThiS  63.89 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0685562  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2397  thiamine biosynthesis protein ThiS  46.97 
 
 		 67 aa  46.2  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4439  sulfur carrier protein ThiS  31.82 
 
 		 66 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000189024 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4093  thiamine biosynthesis protein ThiS  40 
 
 		 65 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00467775  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5459  sulfur carrier protein ThiS  33.33 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.179752 
 
 
-
 
NC_002950  PG2111  thiS protein  44.29 
 
 		 66 aa  45.1  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.719096 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2563  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.92 
 
 		 65 aa  45.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.183271  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0604  thiamine biosynthesis protein ThiS  56.41 
 
 		 70 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.050819  normal  0.048745 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1285  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.18 
 
 		 68 aa  45.1  0.0003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0207  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.46 
 
 		 65 aa  44.7  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.549071  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4533  sulfur carrier protein ThiS  31.82 
 
 		 66 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2773  sulfur carrier protein ThiS  40.91 
 
 		 65 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.374712  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0620  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.74 
 
 		 67 aa  44.7  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3189  sulfur carrier protein ThiS  42.42 
 
 		 66 aa  44.7  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.580772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1317  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 		 66 aa  44.7  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0217  sulfur carrier protein ThiS  31.82 
 
 		 66 aa  44.3  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0035  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 		 73 aa  43.9  0.0007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0963  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.71 
 
 		 68 aa  43.9  0.0007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0792  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.42 
 
 		 66 aa  43.9  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.464856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0642  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.42 
 
 		 66 aa  43.9  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0579  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.43 
 
 		 70 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.16999  hitchhiker  0.00610226 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0667  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.38 
 
 		 75 aa  43.9  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.20728e-26 
 
 
-
 
NC_004310  BR0216  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.46 
 
 		 65 aa  43.5  0.0009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1604  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.29 
 
 		 68 aa  42.7  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.36595  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0281  sulfur carrier protein ThiS  31.82 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00415569 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1937  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.4 
 
 		 65 aa  43.5  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.841225  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2501  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.74 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000495099 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7517  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.44 
 
 		 70 aa  42.7  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12799  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>