59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5919 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5919  sulfur carrier protein ThiS  100 
 
 		 65 aa  134  5e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168418  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6397  sulfur carrier protein ThiS  64.62 
 
 		 65 aa  88.6  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4172  sulfur carrier protein ThiS  55.38 
 
 		 65 aa  79  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.455905 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2563  thiamine biosynthesis protein ThiS  53.85 
 
 		 65 aa  75.9  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.183271  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0444  sulfur carrier protein ThiS  53.85 
 
 		 65 aa  74.3  0.0000000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0010  thiamine biosynthesis protein ThiS  52.31 
 
 		 65 aa  73.2  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.209764 
 
 
-
 
NC_004310  BR0216  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.08 
 
 		 65 aa  67.4  0.00000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0207  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.08 
 
 		 65 aa  65.5  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.549071  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1415  thiamine biosynthesis protein ThiS  47.69 
 
 		 65 aa  64.7  0.0000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3651  thiamine biosynthesis protein ThiS  49.23 
 
 		 64 aa  64.3  0.0000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2165  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.62 
 
 		 65 aa  63.2  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.153528  normal  0.819045 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6223  thiamine biosynthesis protein ThiS  46.15 
 
 		 65 aa  60.8  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0913  thiamine biosynthesis protein ThiS  50.77 
 
 		 64 aa  60.1  0.000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.133934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2165  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.62 
 
 		 65 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.433282  normal  0.219669 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2465  ThiS, thiamine-biosynthesis  44.62 
 
 		 65 aa  58.9  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.637315  normal  0.928732 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7517  thiamine biosynthesis protein ThiS  47.14 
 
 		 70 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12799  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6770  thiamine biosynthesis protein ThiS  47.14 
 
 		 70 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0283  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.08 
 
 		 65 aa  55.1  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2892  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.54 
 
 		 65 aa  54.3  0.0000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.502448  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0578  thiamine biosynthesis protein ThiS  40 
 
 		 70 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0040  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.92 
 
 		 65 aa  51.2  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.12194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0615  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.43 
 
 		 70 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.920589  normal  0.197497 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3429  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.86 
 
 		 63 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0877  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.46 
 
 		 65 aa  48.9  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0304024  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3504  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 		 66 aa  48.5  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.169395  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1524  hypothetical protein  44 
 
 		 67 aa  48.1  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0913  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.46 
 
 		 64 aa  47.4  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2136  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 		 73 aa  47.4  0.00008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1957  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.68 
 
 		 63 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.27356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4093  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.92 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00467775  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1459  hypothetical protein  45.28 
 
 		 67 aa  46.2  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02970  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4741  sulfur carrier protein ThiS  34.85 
 
 		 66 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.243463 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2933  ThiS, thiamine-biosynthesis  35.38 
 
 		 98 aa  44.7  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0004662  hitchhiker  3.85019e-16 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2224  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.79 
 
 		 69 aa  44.3  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.179012 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2907  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.32 
 
 		 75 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5046  hypothetical protein  34.85 
 
 		 70 aa  43.9  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.461936  normal  0.383391 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0360  sulfur carrier protein ThiS  33.33 
 
 		 66 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.18682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5155  sulfur carrier protein ThiS  33.33 
 
 		 66 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.404683  normal  0.862246 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0146  thiamine biosynthesis protein ThiS  42 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2522  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.62 
 
 		 77 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04970  sulfur carrier protein ThiS  34.85 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5105  sulfur carrier protein ThiS  33.33 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.205609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4978  sulfur carrier protein ThiS  33.33 
 
 		 66 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5331  sulfur carrier protein ThiS  33.33 
 
 		 71 aa  42.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.883696  normal  0.241111 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0579  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.86 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.16999  hitchhiker  0.00610226 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0433  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1933  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.77 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1153  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 		 68 aa  42  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0610  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 		 67 aa  41.2  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00214937  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3862  ThiS, thiamine-biosynthesis  34.85 
 
 		 67 aa  41.6  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0818304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2098  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.88 
 
 		 76 aa  41.2  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.219145  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3313  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 		 70 aa  40.8  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2127  thiamine-biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 		 67 aa  40.8  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3887  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0666  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.1 
 
 		 70 aa  40.8  0.007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3658  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.77 
 
 		 67 aa  40.4  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4168  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.82 
 
 		 66 aa  40.4  0.009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.852753  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1339  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.3 
 
 		 66 aa  40  0.01  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038066 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>