90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6770 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6770  thiamine biosynthesis protein ThiS  100 
 
 		 70 aa  137  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7517  thiamine biosynthesis protein ThiS  92.86 
 
 		 70 aa  125  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12799  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0578  thiamine biosynthesis protein ThiS  62.86 
 
 		 70 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0615  thiamine biosynthesis protein ThiS  58.57 
 
 		 70 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.920589  normal  0.197497 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0579  thiamine biosynthesis protein ThiS  57.14 
 
 		 70 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.16999  hitchhiker  0.00610226 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0604  thiamine biosynthesis protein ThiS  60 
 
 		 70 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.050819  normal  0.048745 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3117  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.07 
 
 		 68 aa  57.4  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.295456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3034  thiamine biosynthesis protein ThiS  48.57 
 
 		 66 aa  55.5  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00295138  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2465  ThiS, thiamine-biosynthesis  50 
 
 		 65 aa  55.8  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.637315  normal  0.928732 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5919  sulfur carrier protein ThiS  47.14 
 
 		 65 aa  55.1  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168418  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6223  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.71 
 
 		 65 aa  55.1  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2892  thiamine biosynthesis protein ThiS  47.14 
 
 		 65 aa  55.1  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.502448  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2165  thiamine biosynthesis protein ThiS  47.14 
 
 		 65 aa  53.9  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.433282  normal  0.219669 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1153  thiamine biosynthesis protein ThiS  48.53 
 
 		 68 aa  53.1  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4093  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.29 
 
 		 65 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00467775  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2224  thiamine biosynthesis protein ThiS  47.22 
 
 		 69 aa  50.8  0.000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.179012 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3887  thiamine biosynthesis protein ThiS  47.89 
 
 		 66 aa  50.4  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0239  thiamine biosynthesis sulfur transfer protein  38.03 
 
 		 67 aa  49.7  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.164539 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0494  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.87 
 
 		 108 aa  48.9  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00171819 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2782  putative thiamine biosynthesis protein ThiS  43.84 
 
 		 66 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.408989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6397  sulfur carrier protein ThiS  44.29 
 
 		 65 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2165  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.71 
 
 		 65 aa  48.1  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.153528  normal  0.819045 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4278  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.33 
 
 		 66 aa  48.1  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0658142  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0021  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.14 
 
 		 69 aa  48.1  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.71048  normal  0.598538 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02970  thiamine biosynthesis protein ThiS  47.89 
 
 		 66 aa  48.1  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2501  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.31 
 
 		 78 aa  47.4  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000495099 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0610  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.25 
 
 		 67 aa  47.4  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00214937  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2098  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.44 
 
 		 76 aa  47  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.219145  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1339  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.06 
 
 		 66 aa  46.6  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038066 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3429  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.18 
 
 		 63 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34640  sulfur carrier protein ThiS  41.18 
 
 		 64 aa  46.6  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0439272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4172  sulfur carrier protein ThiS  40 
 
 		 65 aa  46.2  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.455905 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1957  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.18 
 
 		 63 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.27356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1415  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.71 
 
 		 65 aa  45.4  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2933  ThiS, thiamine-biosynthesis  35.71 
 
 		 98 aa  45.4  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0004662  hitchhiker  3.85019e-16 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0433  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.25 
 
 		 66 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2465  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.99 
 
 		 66 aa  45.1  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.408493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5998  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.25 
 
 		 81 aa  45.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.786244 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0643  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.94 
 
 		 73 aa  45.1  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.85301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0207  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.86 
 
 		 65 aa  44.7  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.549071  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0913  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.43 
 
 		 64 aa  44.7  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.133934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0963  thiamine biosynthesis protein ThiS  46.38 
 
 		 68 aa  44.7  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2127  thiamine-biosynthesis protein ThiS  45.07 
 
 		 67 aa  44.3  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2563  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.44 
 
 		 65 aa  44.3  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.183271  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6572  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.21 
 
 		 69 aa  44.3  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0479  sulfur carrier protein ThiS  43.66 
 
 		 66 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.738565  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0774  thiamine biosynthesis protein ThiS  46.58 
 
 		 68 aa  43.5  0.0009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.176558 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0988  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.28 
 
 		 67 aa  43.5  0.0009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0800067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3651  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.89 
 
 		 64 aa  43.5  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1262  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.72 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0913  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.25 
 
 		 64 aa  43.5  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3404  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.85 
 
 		 62 aa  42.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.376587  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0709  sulfur carrier protein ThiS  44.44 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.367637  normal  0.0347852 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1077  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  40 
 
 		 326 aa  42.7  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129832  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04970  sulfur carrier protein ThiS  42.25 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3289  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.43 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.425824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14741  hypothetical protein  33.33 
 
 		 69 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.214043  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3862  ThiS, thiamine-biosynthesis  41.1 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0818304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0877  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.72 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0304024  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3658  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.86 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14601  hypothetical protein  33.33 
 
 		 69 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1369  thiamine biosynthesis protein ThiS  30 
 
 		 69 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0915348  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4741  sulfur carrier protein ThiS  42.25 
 
 		 66 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.243463 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2458  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.03 
 
 		 66 aa  42  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0216  thiamine biosynthesis protein ThiS  40 
 
 		 65 aa  42  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1043  ThiS, thiamine-biosynthesis  34.67 
 
 		 66 aa  42  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2780  thiamine biosynthesis protein ThiS  40 
 
 		 78 aa  41.6  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0685562  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0589  hypothetical protein  34.29 
 
 		 65 aa  42  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.519327  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2522  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.13 
 
 		 77 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0146  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.95 
 
 		 69 aa  41.6  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3292  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.5 
 
 		 65 aa  41.6  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.212717 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2062  sulfur carrier protein ThiS  36.84 
 
 		 98 aa  41.6  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1095  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.29 
 
 		 68 aa  41.6  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.364292  normal  0.0606209 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1915  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.21 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1984  sulfur carrier protein ThiS  36.84 
 
 		 93 aa  41.2  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0620  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.53 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2396  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  51.35 
 
 		 327 aa  41.2  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0444  sulfur carrier protein ThiS  37.5 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0196  sulfur carrier protein ThiS  41.67 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1604  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.51 
 
 		 68 aa  40.8  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.36595  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1503  ThiS, thiamine-biosynthesis  38.57 
 
 		 72 aa  40.8  0.007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0010  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.71 
 
 		 65 aa  40.8  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.209764 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0670  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  38.03 
 
 		 326 aa  40.8  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0252  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.58 
 
 		 70 aa  40.4  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3235  thiamine biosynthesis protein ThiS  40 
 
 		 66 aa  40.4  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.320513  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1749  thiamine biosynthesis protein ThiS  46.27 
 
 		 65 aa  40.4  0.008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000555242  normal  0.0141169 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0093  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.33 
 
 		 66 aa  40.4  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.704796  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1567  ThiS, thiamine-biosynthesis  36.62 
 
 		 70 aa  40.4  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0927969  normal  0.455632 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3944  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.88 
 
 		 71 aa  40  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000530679  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13201  hypothetical protein  30 
 
 		 70 aa  40  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.537163 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>