95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0196 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_0196  sulfur carrier protein ThiS  100 
 
 
65 aa  128  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0709  sulfur carrier protein ThiS  84.62 
 
 
65 aa  106  8.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.367637  normal  0.0347852 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0536  sulfur carrier protein ThiS  64.62 
 
 
65 aa  91.3  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.355428  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0558  sulfur carrier protein ThiS  63.08 
 
 
65 aa  90.5  7e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.577012 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0546  sulfur carrier protein ThiS  63.08 
 
 
65 aa  90.5  7e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.639054  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3747  thiamine biosynthesis protein ThiS  58.46 
 
 
65 aa  73.9  0.0000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0774  thiamine biosynthesis protein ThiS  55.88 
 
 
68 aa  63.2  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.176558 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0409  thiamine biosynthesis protein ThiS  47.69 
 
 
65 aa  60.5  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0838013  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0913  thiamine biosynthesis protein ThiS  46.15 
 
 
64 aa  57.8  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2396  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  47.76 
 
 
327 aa  57  0.00000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5331  sulfur carrier protein ThiS  43.94 
 
 
71 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.883696  normal  0.241111 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2782  putative thiamine biosynthesis protein ThiS  51.52 
 
 
66 aa  54.7  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.408989  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3034  thiamine biosynthesis protein ThiS  46.97 
 
 
66 aa  54.7  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00295138  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10421  sulfur carrier protein ThiS  50 
 
 
68 aa  52.8  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.117678  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6572  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.3 
 
 
69 aa  53.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922176  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0433  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.42 
 
 
66 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0479  sulfur carrier protein ThiS  40.91 
 
 
66 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.738565  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1153  thiamine biosynthesis protein ThiS  47.17 
 
 
68 aa  52.4  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2098  thiamine biosynthesis protein ThiS  50.72 
 
 
76 aa  52.8  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.219145  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3718  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 
66 aa  52.4  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.827217  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02970  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.91 
 
 
66 aa  52.8  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4278  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.42 
 
 
66 aa  51.6  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0658142  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4103  thiamine biosynthesis protein ThiS  48.44 
 
 
90 aa  51.2  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.189024  decreased coverage  0.00486776 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04970  sulfur carrier protein ThiS  39.39 
 
 
66 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2465  ThiS, thiamine-biosynthesis  43.94 
 
 
65 aa  50.8  0.000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.637315  normal  0.928732 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34640  sulfur carrier protein ThiS  48.39 
 
 
64 aa  50.8  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0439272  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0620  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.79 
 
 
67 aa  50.4  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3292  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 
65 aa  50.4  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.212717 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1268  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 
67 aa  50.4  0.000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0448831  hitchhiker  0.00213488 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1773  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 
72 aa  50.1  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0035  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 
66 aa  50.1  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.91579  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2458  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.42 
 
 
66 aa  50.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3873  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 
66 aa  49.3  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1285  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.18 
 
 
68 aa  48.9  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2465  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 
66 aa  49.3  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.408493  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4741  sulfur carrier protein ThiS  40.91 
 
 
66 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.243463 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4389  thiamine biosynthesis protein ThiS  50.77 
 
 
65 aa  48.9  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4978  sulfur carrier protein ThiS  39.39 
 
 
66 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1339  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.91 
 
 
66 aa  48.1  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0038066 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4168  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 
66 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.852753  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3887  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.91 
 
 
66 aa  48.1  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0360  sulfur carrier protein ThiS  39.39 
 
 
66 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.18682  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5105  sulfur carrier protein ThiS  39.39 
 
 
92 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.205609  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5155  sulfur carrier protein ThiS  39.39 
 
 
66 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.404683  normal  0.862246 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2567  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 
66 aa  47  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.823918  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0597  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 
66 aa  46.6  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3504  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.42 
 
 
66 aa  46.6  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.169395  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0146  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.94 
 
 
69 aa  45.4  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5998  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.85 
 
 
81 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.786244 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6223  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 
65 aa  45.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392752  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2501  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.31 
 
 
78 aa  45.4  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000495099 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2780  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.59 
 
 
78 aa  45.4  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0685562  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1262  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.28 
 
 
67 aa  45.4  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0988  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 
67 aa  44.7  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0800067  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4491  sulfur carrier protein ThiS  28.79 
 
 
66 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0124059 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002075  sulfur carrier protein ThiS  28.79 
 
 
84 aa  44.7  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2892  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 
65 aa  45.1  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.502448  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3147  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 
66 aa  44.7  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.054012  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0239  thiamine biosynthesis sulfur transfer protein  35.82 
 
 
67 aa  44.3  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.164539 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3474  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.91 
 
 
66 aa  44.3  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0252712  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3289  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 
66 aa  44.3  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.425824  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00363  sulfur carrier protein ThiS  28.79 
 
 
84 aa  43.9  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01730  thiamine biosynthesis protein ThiS  66.67 
 
 
80 aa  43.9  0.0007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2127  thiamine-biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 
67 aa  43.5  0.0009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2165  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 
65 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.433282  normal  0.219669 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0204  sulfur carrier protein ThiS  31.82 
 
 
66 aa  42.7  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0247781 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0667  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 
75 aa  42.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.20728e-26 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2390  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 
65 aa  42.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.233708  normal  0.952804 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0213  sulfur carrier protein ThiS  31.82 
 
 
66 aa  42.7  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0217  sulfur carrier protein ThiS  31.82 
 
 
66 aa  42.7  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4003  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.3 
 
 
66 aa  42.4  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2224  thiamine biosynthesis protein ThiS  50 
 
 
69 aa  42.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.179012 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0642  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 
66 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0792  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 
66 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.464856  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4034  sulfur carrier protein ThiS  30.3 
 
 
66 aa  42.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00848806 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4493  sulfur carrier protein ThiS  28.79 
 
 
66 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.439278  hitchhiker  0.00000334012 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0281  sulfur carrier protein ThiS  31.82 
 
 
66 aa  42  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00415569 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0494  thiamine biosynthesis protein ThiS  63.89 
 
 
108 aa  42  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00171819 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2907  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 
75 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4884  thiamine biosynthesis protein ThiS  46.97 
 
 
66 aa  41.6  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2400  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.82 
 
 
74 aa  41.2  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6770  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.67 
 
 
70 aa  41.2  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1345  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 
66 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4371  sulfur carrier protein ThiS  28.79 
 
 
66 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0654  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 
75 aa  40.8  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0130451  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4404  thiamine biosynthesis protein ThiS  28.79 
 
 
66 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2062  sulfur carrier protein ThiS  30.3 
 
 
98 aa  40.4  0.007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4482  sulfur carrier protein ThiS  28.79 
 
 
66 aa  40.4  0.008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1984  sulfur carrier protein ThiS  30.3 
 
 
93 aa  40.4  0.008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4225  sulfur carrier protein ThiS  28.79 
 
 
66 aa  40.4  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03868  sulfur carrier protein ThiS  28.79 
 
 
66 aa  40.4  0.008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03821  hypothetical protein  28.79 
 
 
66 aa  40.4  0.008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1043  ThiS, thiamine-biosynthesis  37.88 
 
 
66 aa  40.4  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4533  sulfur carrier protein ThiS  28.79 
 
 
66 aa  40.4  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0579  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.14 
 
 
70 aa  40  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.16999  hitchhiker  0.00610226 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>