129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0709 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_0709  sulfur carrier protein ThiS  100 
 
 
65 aa  126  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.367637  normal  0.0347852 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0196  sulfur carrier protein ThiS  84.62 
 
 
65 aa  106  8.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0536  sulfur carrier protein ThiS  67.69 
 
 
65 aa  95.1  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.355428  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0546  sulfur carrier protein ThiS  66.15 
 
 
65 aa  94.4  5e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.639054  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0558  sulfur carrier protein ThiS  66.15 
 
 
65 aa  94.4  5e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.577012 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3747  thiamine biosynthesis protein ThiS  56.92 
 
 
65 aa  71.6  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10421  sulfur carrier protein ThiS  55.36 
 
 
68 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.117678  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0409  thiamine biosynthesis protein ThiS  47.69 
 
 
65 aa  59.7  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0838013  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3718  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.45 
 
 
66 aa  59.7  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.827217  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5331  sulfur carrier protein ThiS  46.97 
 
 
71 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.883696  normal  0.241111 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0913  thiamine biosynthesis protein ThiS  46.15 
 
 
64 aa  57.4  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2465  ThiS, thiamine-biosynthesis  46.97 
 
 
65 aa  55.8  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.637315  normal  0.928732 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0774  thiamine biosynthesis protein ThiS  52.94 
 
 
68 aa  55.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.176558 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1773  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 
72 aa  55.5  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0620  thiamine biosynthesis protein ThiS  46.27 
 
 
67 aa  54.7  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04970  sulfur carrier protein ThiS  43.94 
 
 
66 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0479  sulfur carrier protein ThiS  43.94 
 
 
66 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.738565  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4389  thiamine biosynthesis protein ThiS  53.85 
 
 
65 aa  54.3  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0360  sulfur carrier protein ThiS  43.94 
 
 
66 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.18682  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5155  sulfur carrier protein ThiS  43.94 
 
 
66 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.404683  normal  0.862246 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6572  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.3 
 
 
69 aa  53.9  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922176  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2396  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  44.78 
 
 
327 aa  53.5  0.0000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4978  sulfur carrier protein ThiS  43.94 
 
 
66 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5105  sulfur carrier protein ThiS  43.94 
 
 
92 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.205609  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0433  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.42 
 
 
66 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4741  sulfur carrier protein ThiS  43.94 
 
 
66 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.243463 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0146  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 
69 aa  53.1  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1285  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.59 
 
 
68 aa  53.5  0.000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3034  thiamine biosynthesis protein ThiS  48.48 
 
 
66 aa  53.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00295138  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1268  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.94 
 
 
67 aa  52.4  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0448831  hitchhiker  0.00213488 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4168  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.42 
 
 
66 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.852753  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1153  thiamine biosynthesis protein ThiS  49.06 
 
 
68 aa  52.8  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3651  thiamine biosynthesis protein ThiS  46.97 
 
 
64 aa  51.6  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2098  thiamine biosynthesis protein ThiS  50.72 
 
 
76 aa  51.6  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.219145  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3289  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.42 
 
 
66 aa  51.2  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.425824  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3873  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 
66 aa  51.2  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2892  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.42 
 
 
65 aa  50.8  0.000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.502448  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3504  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.94 
 
 
66 aa  50.4  0.000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.169395  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0035  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 
66 aa  50.4  0.000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.91579  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3862  ThiS, thiamine-biosynthesis  40.91 
 
 
67 aa  50.1  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0818304  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2782  putative thiamine biosynthesis protein ThiS  45.45 
 
 
66 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.408989  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6223  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 
65 aa  49.7  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392752  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02970  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.91 
 
 
66 aa  49.7  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2165  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.42 
 
 
65 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.433282  normal  0.219669 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3147  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.91 
 
 
66 aa  48.9  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.054012  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34640  sulfur carrier protein ThiS  48.39 
 
 
64 aa  49.7  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0439272  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0239  thiamine biosynthesis sulfur transfer protein  38.81 
 
 
67 aa  48.5  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.164539 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4278  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.42 
 
 
66 aa  48.5  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0658142  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0204  sulfur carrier protein ThiS  34.85 
 
 
66 aa  48.1  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0247781 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1262  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.28 
 
 
67 aa  48.1  0.00004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2458  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.79 
 
 
66 aa  47.8  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0010  thiamine biosynthesis protein ThiS  46.27 
 
 
65 aa  47.8  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.209764 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0988  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 
67 aa  47.8  0.00006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0800067  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3292  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 
65 aa  47.8  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.212717 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1339  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 
66 aa  47.4  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0038066 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4103  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.75 
 
 
90 aa  47.4  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.189024  decreased coverage  0.00486776 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0597  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 
66 aa  47.4  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0217  sulfur carrier protein ThiS  33.33 
 
 
66 aa  47.4  0.00007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0213  sulfur carrier protein ThiS  34.85 
 
 
66 aa  47.4  0.00007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2465  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 
66 aa  47  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.408493  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0281  sulfur carrier protein ThiS  33.33 
 
 
66 aa  47  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00415569 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4093  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.42 
 
 
65 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00467775  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2062  sulfur carrier protein ThiS  31.82 
 
 
98 aa  46.6  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0792  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.91 
 
 
66 aa  47  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.464856  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01730  thiamine biosynthesis protein ThiS  47.37 
 
 
80 aa  46.6  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0615  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.85 
 
 
70 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.920589  normal  0.197497 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0642  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.91 
 
 
66 aa  47  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1957  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.62 
 
 
63 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.27356  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2400  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.3 
 
 
74 aa  45.4  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3887  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.42 
 
 
66 aa  45.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1984  sulfur carrier protein ThiS  31.82 
 
 
93 aa  45.8  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0838  ThiS, thiamine-biosynthesis  34.85 
 
 
67 aa  45.4  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0444  sulfur carrier protein ThiS  36.76 
 
 
65 aa  44.7  0.0004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2501  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.74 
 
 
78 aa  44.7  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000495099 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2224  thiamine biosynthesis protein ThiS  53.45 
 
 
69 aa  44.7  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.179012 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2567  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 
66 aa  44.7  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.823918  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002075  sulfur carrier protein ThiS  27.27 
 
 
84 aa  44.7  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2127  thiamine-biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 
67 aa  44.3  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5998  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.85 
 
 
81 aa  44.3  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.786244 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4493  sulfur carrier protein ThiS  28.79 
 
 
66 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.439278  hitchhiker  0.00000334012 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1415  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 
65 aa  44.3  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00363  sulfur carrier protein ThiS  27.27 
 
 
84 aa  43.9  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0963  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.18 
 
 
68 aa  43.9  0.0008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1345  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 
66 aa  43.5  0.0009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4491  sulfur carrier protein ThiS  28.79 
 
 
66 aa  43.5  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0124059 
 
 
-
 
NC_004310  BR0216  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 
65 aa  42.4  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3429  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.06 
 
 
63 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4884  thiamine biosynthesis protein ThiS  46.97 
 
 
66 aa  42.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0452  sulfur carrier protein ThiS  31.25 
 
 
71 aa  42.4  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000134216 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0344  sulfur carrier protein ThiS  31.25 
 
 
71 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6770  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.44 
 
 
70 aa  42.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1179  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.82 
 
 
67 aa  42  0.003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1865  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.82 
 
 
67 aa  42  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0959115  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01842  sulfur carrier protein ThiS  33.33 
 
 
66 aa  42  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4404  thiamine biosynthesis protein ThiS  28.79 
 
 
66 aa  41.6  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03868  sulfur carrier protein ThiS  28.79 
 
 
66 aa  41.6  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4225  sulfur carrier protein ThiS  28.79 
 
 
66 aa  41.6  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4034  sulfur carrier protein ThiS  28.79 
 
 
66 aa  41.6  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00848806 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4482  sulfur carrier protein ThiS  28.79 
 
 
66 aa  41.6  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03821  hypothetical protein  28.79 
 
 
66 aa  41.6  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>