28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_01730 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_01730  thiamine biosynthesis protein ThiS  100 
 
 
80 aa  158  2e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2501  thiamine biosynthesis protein ThiS  47.37 
 
 
78 aa  61.6  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000495099 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2780  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.74 
 
 
78 aa  59.3  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0685562  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07970  thiamine biosynthesis protein ThiS  53.16 
 
 
80 aa  53.5  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00847854  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5998  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.77 
 
 
81 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.786244 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0988  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.59 
 
 
67 aa  51.6  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0800067  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0536  sulfur carrier protein ThiS  47.5 
 
 
65 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.355428  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0546  sulfur carrier protein ThiS  47.5 
 
 
65 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.639054  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0558  sulfur carrier protein ThiS  47.5 
 
 
65 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.577012 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0494  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.12 
 
 
108 aa  48.9  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00171819 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1043  ThiS, thiamine-biosynthesis  39.19 
 
 
66 aa  47  0.00009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0709  sulfur carrier protein ThiS  47.37 
 
 
65 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.367637  normal  0.0347852 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1285  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.5 
 
 
68 aa  46.6  0.0001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0774  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.74 
 
 
68 aa  45.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.176558 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1339  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.53 
 
 
66 aa  45.4  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0038066 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34640  sulfur carrier protein ThiS  40.79 
 
 
64 aa  44.3  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0439272  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3117  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.84 
 
 
68 aa  43.9  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.295456  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0146  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.65 
 
 
69 aa  44.3  0.0006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0196  sulfur carrier protein ThiS  66.67 
 
 
65 aa  43.9  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3887  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.79 
 
 
66 aa  43.9  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3034  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.16 
 
 
66 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00295138  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0409  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.67 
 
 
65 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0838013  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2782  putative thiamine biosynthesis protein ThiS  42.11 
 
 
66 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.408989  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2098  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.5 
 
 
76 aa  41.2  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.219145  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0239  thiamine biosynthesis sulfur transfer protein  32.89 
 
 
67 aa  41.6  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.164539 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2458  thiamine biosynthesis protein ThiS  47.22 
 
 
66 aa  41.2  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6572  thiamine biosynthesis protein ThiS  26.25 
 
 
69 aa  40.8  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922176  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0093  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.79 
 
 
66 aa  40.4  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.704796  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>