70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3117 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3117  thiamine biosynthesis protein ThiS  100 
 
 		 68 aa  132  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.295456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1043  ThiS, thiamine-biosynthesis  64.71 
 
 		 66 aa  74.7  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1339  thiamine biosynthesis protein ThiS  52.94 
 
 		 66 aa  72.4  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038066 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0578  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.07 
 
 		 70 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3887  thiamine biosynthesis protein ThiS  52.94 
 
 		 66 aa  62.8  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2782  putative thiamine biosynthesis protein ThiS  52.94 
 
 		 66 aa  62.4  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.408989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5998  thiamine biosynthesis protein ThiS  47.89 
 
 		 81 aa  60.1  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.786244 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0494  thiamine biosynthesis protein ThiS  47.44 
 
 		 108 aa  59.3  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00171819 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3034  thiamine biosynthesis protein ThiS  52.94 
 
 		 66 aa  59.3  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00295138  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0615  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.86 
 
 		 70 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.920589  normal  0.197497 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2098  thiamine biosynthesis protein ThiS  47.83 
 
 		 76 aa  57.8  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.219145  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6770  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.07 
 
 		 70 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0579  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.43 
 
 		 70 aa  57  0.00000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.16999  hitchhiker  0.00610226 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0988  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.59 
 
 		 67 aa  55.5  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0800067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7517  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.07 
 
 		 70 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12799  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2165  thiamine biosynthesis protein ThiS  47.06 
 
 		 65 aa  54.3  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.433282  normal  0.219669 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1285  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.29 
 
 		 68 aa  53.9  0.0000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34640  sulfur carrier protein ThiS  42.86 
 
 		 64 aa  53.1  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0439272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0604  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.29 
 
 		 70 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.050819  normal  0.048745 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4278  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.59 
 
 		 66 aa  50.4  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0658142  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1153  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.78 
 
 		 68 aa  50.1  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0838  ThiS, thiamine-biosynthesis  38.24 
 
 		 67 aa  49.7  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3147  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.43 
 
 		 66 aa  49.3  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.054012  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0774  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.75 
 
 		 68 aa  49.3  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.176558 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2465  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.43 
 
 		 68 aa  48.9  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2780  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.03 
 
 		 78 aa  48.9  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0685562  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0913  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.59 
 
 		 64 aa  48.9  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3747  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.59 
 
 		 65 aa  48.1  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2501  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.46 
 
 		 78 aa  47.8  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000495099 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2465  ThiS, thiamine-biosynthesis  39.71 
 
 		 65 aa  47.4  0.00007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.637315  normal  0.928732 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0792  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.71 
 
 		 66 aa  47.4  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.464856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0642  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.71 
 
 		 66 aa  47.4  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0643  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.24 
 
 		 73 aa  47  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.85301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2465  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.78 
 
 		 66 aa  46.6  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.408493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0620  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.82 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002075  sulfur carrier protein ThiS  28.79 
 
 		 84 aa  45.1  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1957  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.71 
 
 		 63 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.27356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2432  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  36.76 
 
 		 329 aa  45.1  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.129281  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3289  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.76 
 
 		 66 aa  45.1  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.425824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0877  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.82 
 
 		 65 aa  45.1  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0304024  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0093  thiamine biosynthesis protein ThiS  40 
 
 		 66 aa  45.1  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.704796  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3429  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.18 
 
 		 63 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0536  sulfur carrier protein ThiS  41.18 
 
 		 65 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.355428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1317  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.76 
 
 		 66 aa  44.3  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2458  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.76 
 
 		 66 aa  44.3  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4093  thiamine biosynthesis protein ThiS  40 
 
 		 65 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00467775  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0239  thiamine biosynthesis sulfur transfer protein  30.88 
 
 		 67 aa  44.3  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.164539 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2892  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.76 
 
 		 65 aa  44.7  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.502448  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1604  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.78 
 
 		 68 aa  44.3  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.36595  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01730  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.84 
 
 		 80 aa  43.9  0.0006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0546  sulfur carrier protein ThiS  41.18 
 
 		 65 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.639054  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0035  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.68 
 
 		 66 aa  43.9  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.91579  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0558  sulfur carrier protein ThiS  41.18 
 
 		 65 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.577012 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0409  thiamine biosynthesis protein ThiS  47.06 
 
 		 65 aa  43.5  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0838013  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1455  hypothetical protein  35.71 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.282408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1633  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  30 
 
 		 347 aa  43.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6572  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.82 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00363  sulfur carrier protein ThiS  27.27 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1915  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.35 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3862  ThiS, thiamine-biosynthesis  35.71 
 
 		 67 aa  42.7  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0818304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0363  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.9 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0913  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.03 
 
 		 64 aa  42.4  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.133934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6223  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.35 
 
 		 65 aa  41.6  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2390  thiamine biosynthesis protein ThiS  27.94 
 
 		 65 aa  41.6  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.233708  normal  0.952804 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02970  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.57 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3313  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.88 
 
 		 70 aa  41.2  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3504  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.76 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.169395  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5331  sulfur carrier protein ThiS  40 
 
 		 71 aa  41.2  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.883696  normal  0.241111 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0369  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 		 68 aa  40  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.232233 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2127  thiamine-biosynthesis protein ThiS  37.14 
 
 		 67 aa  40  0.01  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>