128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6223 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6223  thiamine biosynthesis protein ThiS  100 
 
 		 65 aa  134  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4093  thiamine biosynthesis protein ThiS  67.69 
 
 		 65 aa  101  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00467775  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2465  ThiS, thiamine-biosynthesis  69.23 
 
 		 65 aa  100  5e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.637315  normal  0.928732 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3429  thiamine biosynthesis protein ThiS  66.67 
 
 		 63 aa  100  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2165  thiamine biosynthesis protein ThiS  66.15 
 
 		 65 aa  98.6  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.433282  normal  0.219669 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2892  thiamine biosynthesis protein ThiS  69.23 
 
 		 65 aa  99.4  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.502448  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1957  thiamine biosynthesis protein ThiS  65.08 
 
 		 63 aa  98.2  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.27356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1415  thiamine biosynthesis protein ThiS  47.69 
 
 		 65 aa  72.8  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0010  thiamine biosynthesis protein ThiS  47.69 
 
 		 65 aa  62.8  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.209764 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2563  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.08 
 
 		 65 aa  62  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.183271  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5919  sulfur carrier protein ThiS  46.15 
 
 		 65 aa  60.8  0.000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168418  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3651  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.62 
 
 		 64 aa  59.3  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6397  sulfur carrier protein ThiS  44.62 
 
 		 65 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0615  thiamine biosynthesis protein ThiS  48.57 
 
 		 70 aa  58.2  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.920589  normal  0.197497 
 
 
-
 
NC_004310  BR0216  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.46 
 
 		 65 aa  57  0.00000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0589  hypothetical protein  40 
 
 		 65 aa  56.2  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.519327  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5331  sulfur carrier protein ThiS  40.91 
 
 		 71 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.883696  normal  0.241111 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0146  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 		 69 aa  55.5  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0040  thiamine biosynthesis protein ThiS  40 
 
 		 65 aa  55.8  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.12194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0207  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.46 
 
 		 65 aa  55.1  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.549071  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4172  sulfur carrier protein ThiS  36.92 
 
 		 65 aa  55.1  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.455905 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6770  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.71 
 
 		 70 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2165  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.92 
 
 		 65 aa  55.1  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.153528  normal  0.819045 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7517  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.71 
 
 		 70 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12799  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0433  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 		 66 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1459  hypothetical protein  39.39 
 
 		 67 aa  53.9  0.0000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0360  sulfur carrier protein ThiS  39.39 
 
 		 66 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.18682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0913  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.54 
 
 		 64 aa  53.5  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4978  sulfur carrier protein ThiS  39.39 
 
 		 66 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0479  sulfur carrier protein ThiS  40.91 
 
 		 66 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.738565  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5155  sulfur carrier protein ThiS  39.39 
 
 		 66 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.404683  normal  0.862246 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2098  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.13 
 
 		 76 aa  52.8  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.219145  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5105  sulfur carrier protein ThiS  39.39 
 
 		 92 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.205609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0035  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 		 73 aa  52.8  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0988  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 		 67 aa  52.4  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0800067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4168  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 		 66 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.852753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0035  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 		 66 aa  52.8  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.91579  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02970  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 		 66 aa  52.4  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1153  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.1 
 
 		 68 aa  52.4  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4741  sulfur carrier protein ThiS  39.39 
 
 		 66 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.243463 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2224  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.28 
 
 		 69 aa  51.6  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.179012 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2458  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.91 
 
 		 66 aa  51.6  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2933  ThiS, thiamine-biosynthesis  40 
 
 		 98 aa  51.6  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0004662  hitchhiker  3.85019e-16 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0093  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.66 
 
 		 66 aa  51.2  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.704796  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04970  sulfur carrier protein ThiS  39.39 
 
 		 66 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3504  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 		 66 aa  50.8  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.169395  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0913  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.54 
 
 		 64 aa  50.8  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.133934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1268  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 		 67 aa  50.4  0.000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0448831  hitchhiker  0.00213488 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5998  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.85 
 
 		 81 aa  50.4  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.786244 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1524  hypothetical protein  40.38 
 
 		 67 aa  50.1  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1317  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 		 66 aa  49.7  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0709  sulfur carrier protein ThiS  39.39 
 
 		 65 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.367637  normal  0.0347852 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3887  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 		 66 aa  50.1  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0546  sulfur carrier protein ThiS  36.36 
 
 		 65 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.639054  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0558  sulfur carrier protein ThiS  36.36 
 
 		 65 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.577012 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2567  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 		 66 aa  49.3  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.823918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3034  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 		 66 aa  49.3  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00295138  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0021  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 		 69 aa  48.9  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.71048  normal  0.598538 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0444  sulfur carrier protein ThiS  40 
 
 		 65 aa  48.5  0.00003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1262  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.33 
 
 		 67 aa  48.5  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3862  ThiS, thiamine-biosynthesis  34.85 
 
 		 67 aa  48.1  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0818304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0536  sulfur carrier protein ThiS  34.85 
 
 		 65 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.355428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3658  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.92 
 
 		 67 aa  47.8  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0963  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.68 
 
 		 68 aa  47.8  0.00006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3292  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 		 65 aa  47.8  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.212717 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0792  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 		 66 aa  47.4  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.464856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0642  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 		 66 aa  47.4  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3147  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 		 66 aa  47.4  0.00007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.054012  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3474  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 		 66 aa  47.4  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0252712  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34640  sulfur carrier protein ThiS  41.94 
 
 		 64 aa  47.4  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0439272  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1339  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 		 66 aa  47  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038066 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1915  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 		 66 aa  47  0.00008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0579  thiamine biosynthesis protein ThiS  47.14 
 
 		 70 aa  47  0.00009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.16999  hitchhiker  0.00610226 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1043  ThiS, thiamine-biosynthesis  36.36 
 
 		 66 aa  46.6  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1455  hypothetical protein  36.36 
 
 		 75 aa  46.6  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.282408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0578  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.85 
 
 		 70 aa  47  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0252  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.71 
 
 		 70 aa  45.8  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0667  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.92 
 
 		 75 aa  46.2  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.20728e-26 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2780  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 		 78 aa  45.4  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0685562  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0196  sulfur carrier protein ThiS  37.88 
 
 		 65 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4884  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.42 
 
 		 66 aa  45.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4278  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 		 66 aa  45.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0658142  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2501  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.62 
 
 		 78 aa  45.4  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000495099 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3289  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 		 66 aa  44.7  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.425824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0726  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 		 66 aa  44.7  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00139474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1857  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 		 67 aa  44.3  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0877  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.38 
 
 		 65 aa  44.3  0.0006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0304024  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1773  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 		 72 aa  43.9  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2782  putative thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 		 66 aa  43.9  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.408989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0774  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.29 
 
 		 68 aa  43.9  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.176558 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1633  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  27.27 
 
 		 347 aa  43.9  0.0008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0620  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.31 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2432  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  34.85 
 
 		 329 aa  43.5  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.129281  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3313  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.82 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1604  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.29 
 
 		 68 aa  43.5  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.36595  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1369  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.88 
 
 		 69 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0915348  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1785  thiamine biosynthesis protein ThiS  48.57 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.226514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14741  hypothetical protein  31.88 
 
 		 69 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.214043  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19401  hypothetical protein  31.88 
 
 		 70 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.952724 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1142  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.76 
 
 		 68 aa  42.7  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>