121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3292 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3292  thiamine biosynthesis protein ThiS  100 
 
 		 65 aa  131  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.212717 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1785  thiamine biosynthesis protein ThiS  67.69 
 
 		 65 aa  95.1  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.226514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1937  thiamine biosynthesis protein ThiS  67.69 
 
 		 65 aa  95.1  3e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.841225  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3069  thiamine biosynthesis protein ThiS  69.23 
 
 		 65 aa  90.5  8e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0208668  normal  0.582479 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2729  sulfur carrier protein ThiS  55.38 
 
 		 65 aa  77.4  0.00000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3709  sulfur carrier protein ThiS  55.38 
 
 		 65 aa  77.4  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3225  sulfur carrier protein ThiS  55.38 
 
 		 65 aa  77.4  0.00000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1774  sulfur carrier protein ThiS  55.38 
 
 		 65 aa  77.4  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3680  sulfur carrier protein ThiS  55.38 
 
 		 65 aa  77.4  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3738  sulfur carrier protein ThiS  55.38 
 
 		 65 aa  77.4  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2779  sulfur carrier protein ThiS  55.38 
 
 		 65 aa  77.4  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2696  sulfur carrier protein ThiS  58.46 
 
 		 65 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0411  sulfur carrier protein ThiS  58.46 
 
 		 65 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0390  sulfur carrier protein ThiS  58.46 
 
 		 65 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0329  sulfur carrier protein ThiS  56.92 
 
 		 65 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2773  sulfur carrier protein ThiS  56.92 
 
 		 65 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.374712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0314  sulfur carrier protein ThiS  56.92 
 
 		 65 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.388373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3509  sulfur carrier protein ThiS  56.92 
 
 		 65 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.20038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3007  sulfur carrier protein ThiS  52.31 
 
 		 65 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0338  sulfur carrier protein ThiS  55.38 
 
 		 65 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.518448  normal  0.375148 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2397  thiamine biosynthesis protein ThiS  58.46 
 
 		 67 aa  74.7  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0384  sulfur carrier protein ThiS  55.38 
 
 		 91 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3574  sulfur carrier protein ThiS  53.85 
 
 		 65 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000430861 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2465  thiamine biosynthesis protein ThiS  50.77 
 
 		 65 aa  70.9  0.000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.279126  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0894  thiamine biosynthesis protein ThiS  47.69 
 
 		 65 aa  69.7  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0249295  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0111  sulfur carrier protein ThiS  45.21 
 
 		 75 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0761015  normal  0.947366 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3644  sulfur carrier protein ThiS  44.93 
 
 		 71 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3320  sulfur carrier protein ThiS  44.93 
 
 		 71 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4313  thiamine biosynthesis protein ThiS  69.23 
 
 		 69 aa  65.1  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.383978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0035  thiamine biosynthesis protein ThiS  50 
 
 		 66 aa  63.2  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.91579  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0913  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.54 
 
 		 64 aa  54.3  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.133934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0207  sulfur carrier protein ThiS  44.62 
 
 		 65 aa  53.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.672002  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02970  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.78 
 
 		 66 aa  52.8  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0479  sulfur carrier protein ThiS  42.42 
 
 		 66 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.738565  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3474  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.42 
 
 		 66 aa  52  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0252712  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3034  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 		 66 aa  50.8  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00295138  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0196  sulfur carrier protein ThiS  37.88 
 
 		 65 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04970  sulfur carrier protein ThiS  40.91 
 
 		 66 aa  50.1  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5331  sulfur carrier protein ThiS  40.91 
 
 		 71 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.883696  normal  0.241111 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0040  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.45 
 
 		 65 aa  50.1  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.12194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3504  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 		 66 aa  49.3  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.169395  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2782  putative thiamine biosynthesis protein ThiS  42.42 
 
 		 66 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.408989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3651  thiamine biosynthesis protein ThiS  40 
 
 		 64 aa  48.5  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0021  thiamine biosynthesis protein ThiS  51.43 
 
 		 69 aa  47.8  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.71048  normal  0.598538 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0709  sulfur carrier protein ThiS  36.36 
 
 		 65 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.367637  normal  0.0347852 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6223  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 		 65 aa  47.8  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2400  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.33 
 
 		 74 aa  47  0.00008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3289  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 		 66 aa  47  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.425824  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3873  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 		 66 aa  47  0.00009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4003  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 		 66 aa  47  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2563  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.183271  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5998  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.8 
 
 		 81 aa  46.2  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.786244 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0988  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 		 67 aa  47  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0800067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4172  sulfur carrier protein ThiS  40 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.455905 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4034  sulfur carrier protein ThiS  36.36 
 
 		 66 aa  47  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00848806 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0913  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 		 64 aa  46.6  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0093  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.91 
 
 		 66 aa  46.2  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.704796  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34640  sulfur carrier protein ThiS  38.71 
 
 		 64 aa  46.6  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0439272  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1339  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 		 66 aa  46.6  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038066 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3718  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 		 66 aa  46.2  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.827217  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0774  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.71 
 
 		 68 aa  45.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.176558 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1455  hypothetical protein  36.36 
 
 		 75 aa  46.2  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.282408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0035  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.82 
 
 		 73 aa  45.4  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4278  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0658142  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0146  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 		 69 aa  44.7  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0252  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.43 
 
 		 70 aa  44.7  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6572  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.34 
 
 		 69 aa  44.3  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2501  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.62 
 
 		 78 aa  44.7  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000495099 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4533  sulfur carrier protein ThiS  34.85 
 
 		 66 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4741  sulfur carrier protein ThiS  38.81 
 
 		 66 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.243463 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2396  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  32.84 
 
 		 327 aa  43.5  0.0009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0204  sulfur carrier protein ThiS  33.33 
 
 		 66 aa  43.5  0.0009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0247781 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5105  sulfur carrier protein ThiS  37.88 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.205609  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0433  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.31 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2465  ThiS, thiamine-biosynthesis  34.85 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.637315  normal  0.928732 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0164  sulfur carrier protein ThiS  47.69 
 
 		 65 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2780  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.9 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0685562  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4978  sulfur carrier protein ThiS  37.88 
 
 		 66 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1345  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 		 66 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4103  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.62 
 
 		 90 aa  43.5  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.189024  decreased coverage  0.00486776 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5459  sulfur carrier protein ThiS  33.33 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.179752 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0801  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 		 66 aa  42.7  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03868  sulfur carrier protein ThiS  33.33 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0589  hypothetical protein  39.39 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.519327  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0610  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00214937  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0536  sulfur carrier protein ThiS  34.85 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.355428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4225  sulfur carrier protein ThiS  33.33 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5155  sulfur carrier protein ThiS  38.81 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.404683  normal  0.862246 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4482  sulfur carrier protein ThiS  33.33 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4493  sulfur carrier protein ThiS  28.79 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.439278  hitchhiker  0.00000334012 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0409  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.42 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0838013  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03821  hypothetical protein  33.33 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2098  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.23 
 
 		 76 aa  41.6  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.219145  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0667  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.91 
 
 		 75 aa  42  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.20728e-26 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0546  sulfur carrier protein ThiS  34.85 
 
 		 65 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.639054  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0558  sulfur carrier protein ThiS  34.85 
 
 		 65 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.577012 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0281  sulfur carrier protein ThiS  31.82 
 
 		 66 aa  42  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00415569 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01842  sulfur carrier protein ThiS  37.31 
 
 		 66 aa  42  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3147  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.054012  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4168  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.852753  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>