139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_2400 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_2400  thiamine biosynthesis protein ThiS  100 
 
 		 74 aa  146  8e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3504  thiamine biosynthesis protein ThiS  60 
 
 		 66 aa  73.9  0.0000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.169395  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5331  sulfur carrier protein ThiS  51.43 
 
 		 71 aa  67.8  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.883696  normal  0.241111 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0035  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.95 
 
 		 73 aa  68.2  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0479  sulfur carrier protein ThiS  53.73 
 
 		 66 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.738565  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0360  sulfur carrier protein ThiS  55.22 
 
 		 66 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.18682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04970  sulfur carrier protein ThiS  53.73 
 
 		 66 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4168  thiamine biosynthesis protein ThiS  52.24 
 
 		 66 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.852753  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5105  sulfur carrier protein ThiS  49.32 
 
 		 92 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.205609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5155  sulfur carrier protein ThiS  53.73 
 
 		 66 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.404683  normal  0.862246 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4978  sulfur carrier protein ThiS  52.24 
 
 		 66 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2465  thiamine biosynthesis protein ThiS  50.72 
 
 		 68 aa  63.2  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3189  sulfur carrier protein ThiS  49.25 
 
 		 66 aa  62  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.580772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4741  sulfur carrier protein ThiS  49.25 
 
 		 66 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.243463 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02970  thiamine biosynthesis protein ThiS  49.25 
 
 		 66 aa  58.9  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0433  thiamine biosynthesis protein ThiS  47.76 
 
 		 66 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2062  sulfur carrier protein ThiS  41.89 
 
 		 98 aa  58.2  0.00000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1984  sulfur carrier protein ThiS  41.89 
 
 		 93 aa  58.2  0.00000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4701  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  43.24 
 
 		 374 aa  57.8  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468322  normal  0.837099 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3235  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.78 
 
 		 66 aa  57.8  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.320513  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2098  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.79 
 
 		 76 aa  56.2  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.219145  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0044  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.24 
 
 		 72 aa  56.6  0.0000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.164239  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0666  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.85 
 
 		 70 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2127  thiamine-biosynthesis protein ThiS  43.28 
 
 		 67 aa  55.8  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0146  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.13 
 
 		 69 aa  55.8  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3147  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.79 
 
 		 66 aa  54.7  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.054012  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2567  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.28 
 
 		 66 aa  55.1  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.823918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0610  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.28 
 
 		 67 aa  54.3  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00214937  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1268  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.28 
 
 		 67 aa  54.3  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0448831  hitchhiker  0.00213488 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0731  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.79 
 
 		 67 aa  54.7  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3887  thiamine biosynthesis protein ThiS  47.76 
 
 		 66 aa  54.7  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2136  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.54 
 
 		 73 aa  53.9  0.0000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1345  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.3 
 
 		 66 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1077  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  41.79 
 
 		 326 aa  52.8  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129832  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1058  hypothetical protein  40.85 
 
 		 70 aa  52.8  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000643593  normal  0.078632 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0642  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.78 
 
 		 66 aa  52.8  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0792  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.78 
 
 		 66 aa  52.8  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.464856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01842  sulfur carrier protein ThiS  41.79 
 
 		 66 aa  52  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0338  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 		 67 aa  52  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0035  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.81 
 
 		 66 aa  52  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.91579  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1339  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.81 
 
 		 66 aa  50.8  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038066 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0071  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.88 
 
 		 162 aa  49.7  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.290426  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3474  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.46 
 
 		 66 aa  50.1  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0252712  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0963  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 		 68 aa  50.1  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0726  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.3 
 
 		 66 aa  48.9  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00139474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4278  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.28 
 
 		 66 aa  49.3  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0658142  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0314  sulfur carrier protein ThiS  38.81 
 
 		 65 aa  49.3  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.388373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4103  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.46 
 
 		 90 aa  48.9  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.189024  decreased coverage  0.00486776 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5998  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.74 
 
 		 81 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.786244 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1317  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.84 
 
 		 66 aa  48.1  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2696  sulfur carrier protein ThiS  37.31 
 
 		 65 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0411  sulfur carrier protein ThiS  37.31 
 
 		 65 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0390  sulfur carrier protein ThiS  37.31 
 
 		 65 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4065  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.79 
 
 		 67 aa  48.1  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.58887  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0329  sulfur carrier protein ThiS  35.82 
 
 		 65 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1142  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.76 
 
 		 68 aa  47.8  0.00005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3509  sulfur carrier protein ThiS  35.82 
 
 		 65 aa  47.4  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.20038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3007  sulfur carrier protein ThiS  35.82 
 
 		 65 aa  47.4  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2729  sulfur carrier protein ThiS  35.82 
 
 		 65 aa  47  0.00008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3709  sulfur carrier protein ThiS  35.82 
 
 		 65 aa  47  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1633  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  37.31 
 
 		 347 aa  47.4  0.00008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2782  putative thiamine biosynthesis protein ThiS  38.81 
 
 		 66 aa  47.4  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.408989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3225  sulfur carrier protein ThiS  35.82 
 
 		 65 aa  47  0.00008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1774  sulfur carrier protein ThiS  35.82 
 
 		 65 aa  47  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3680  sulfur carrier protein ThiS  35.82 
 
 		 65 aa  47  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3738  sulfur carrier protein ThiS  35.82 
 
 		 65 aa  47  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2779  sulfur carrier protein ThiS  35.82 
 
 		 65 aa  47  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3292  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.33 
 
 		 65 aa  47  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.212717 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0338  sulfur carrier protein ThiS  35.82 
 
 		 65 aa  47  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.518448  normal  0.375148 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0808  thiamine biosynthesis sulfur transfer protein  41.54 
 
 		 64 aa  47.4  0.00008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.408006  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5046  hypothetical protein  38.03 
 
 		 70 aa  46.6  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.461936  normal  0.383391 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3313  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.62 
 
 		 70 aa  45.8  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1937  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.33 
 
 		 65 aa  45.4  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.841225  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0384  sulfur carrier protein ThiS  34.33 
 
 		 91 aa  45.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2397  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.24 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0709  sulfur carrier protein ThiS  40.3 
 
 		 65 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.367637  normal  0.0347852 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1785  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.33 
 
 		 65 aa  45.4  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.226514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2907  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.24 
 
 		 75 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2773  sulfur carrier protein ThiS  34.33 
 
 		 65 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.374712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3290  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  39.44 
 
 		 331 aa  45.4  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0620  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.34 
 
 		 67 aa  45.4  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2933  ThiS, thiamine-biosynthesis  33.82 
 
 		 98 aa  44.7  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0004662  hitchhiker  3.85019e-16 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1455  hypothetical protein  36.99 
 
 		 75 aa  44.7  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.282408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3651  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.31 
 
 		 64 aa  44.7  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3658  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.33 
 
 		 67 aa  44.3  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3289  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.82 
 
 		 66 aa  44.7  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.425824  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0612  sulfur carrier protein ThiS  34.38 
 
 		 67 aa  44.3  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0774  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.94 
 
 		 68 aa  44.3  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.176558 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3574  sulfur carrier protein ThiS  32.84 
 
 		 65 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000430861 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0589  hypothetical protein  32.84 
 
 		 65 aa  43.9  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.519327  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3862  ThiS, thiamine-biosynthesis  34.33 
 
 		 67 aa  43.9  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0818304  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1185  thiamine biosynthesis protein ThiS  29.85 
 
 		 69 aa  43.5  0.0009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.029771  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0654  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.84 
 
 		 75 aa  43.5  0.0009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0130451  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4003  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.29 
 
 		 66 aa  43.5  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0913  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.79 
 
 		 64 aa  43.5  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5459  sulfur carrier protein ThiS  34.33 
 
 		 66 aa  43.5  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.179752 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3034  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.81 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00295138  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4034  sulfur carrier protein ThiS  34.29 
 
 		 66 aa  43.5  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00848806 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2522  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.31 
 
 		 77 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1555  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.31 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.112904 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>