65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0808 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_0808  thiamine biosynthesis sulfur transfer protein  100 
 
 
64 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.408006  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0726  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.75 
 
 
66 aa  53.1  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00139474  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1749  thiamine biosynthesis protein ThiS  47.62 
 
 
65 aa  53.1  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000555242  normal  0.0141169 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0610  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.31 
 
 
67 aa  52.8  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00214937  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2567  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.75 
 
 
66 aa  52.8  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.823918  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1191  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.5 
 
 
63 aa  52  0.000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1150  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.62 
 
 
63 aa  51.2  0.000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000104387  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0667  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.19 
 
 
75 aa  51.2  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.20728e-26 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0338  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.06 
 
 
67 aa  50.4  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3189  sulfur carrier protein ThiS  40.62 
 
 
66 aa  50.4  0.000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.580772  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0073  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.81 
 
 
66 aa  50.4  0.000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0734  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.5 
 
 
63 aa  50.1  0.000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1068  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.5 
 
 
63 aa  50.1  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.60648  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1179  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.38 
 
 
67 aa  49.7  0.00001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4065  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.94 
 
 
67 aa  49.7  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.58887  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1317  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.06 
 
 
66 aa  50.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0654  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.62 
 
 
75 aa  49.3  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0130451  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3290  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  42.19 
 
 
331 aa  48.5  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2136  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.71 
 
 
73 aa  48.1  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01842  sulfur carrier protein ThiS  39.06 
 
 
66 aa  47.4  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4103  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.94 
 
 
90 aa  47.4  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.189024  decreased coverage  0.00486776 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2400  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.54 
 
 
74 aa  47.4  0.00008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0479  sulfur carrier protein ThiS  42.19 
 
 
66 aa  47  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.738565  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04970  sulfur carrier protein ThiS  42.19 
 
 
66 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1865  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.92 
 
 
67 aa  46.2  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0959115  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4701  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  35.94 
 
 
374 aa  46.6  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468322  normal  0.837099 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5331  sulfur carrier protein ThiS  39.06 
 
 
71 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.883696  normal  0.241111 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2127  thiamine-biosynthesis protein ThiS  34.38 
 
 
67 aa  46.6  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3658  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.06 
 
 
67 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2062  sulfur carrier protein ThiS  37.5 
 
 
98 aa  45.8  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3289  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.94 
 
 
66 aa  46.2  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.425824  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1984  sulfur carrier protein ThiS  37.5 
 
 
93 aa  45.4  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0589  hypothetical protein  39.06 
 
 
65 aa  45.4  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.519327  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34640  sulfur carrier protein ThiS  39.06 
 
 
64 aa  44.7  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0439272  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2165  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.5 
 
 
66 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0642  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.91 
 
 
66 aa  44.3  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0792  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.91 
 
 
66 aa  44.3  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.464856  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0035  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.94 
 
 
66 aa  44.3  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.91579  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2638  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.14 
 
 
68 aa  44.3  0.0006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2933  ThiS, thiamine-biosynthesis  40.32 
 
 
98 aa  43.9  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0004662  hitchhiker  3.85019e-16 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3862  ThiS, thiamine-biosynthesis  34.38 
 
 
67 aa  43.9  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0818304  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0597  thiamine biosynthesis protein ThiS  26.56 
 
 
66 aa  43.9  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5155  sulfur carrier protein ThiS  37.5 
 
 
66 aa  42.7  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.404683  normal  0.862246 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3147  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.25 
 
 
66 aa  43.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.054012  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1554  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.38 
 
 
211 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.636206  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1142  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.3 
 
 
68 aa  43.1  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1573  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.94 
 
 
64 aa  42.7  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0171362  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1856  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.94 
 
 
64 aa  42.7  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0093  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.81 
 
 
66 aa  42.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.704796  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5105  sulfur carrier protein ThiS  35.94 
 
 
92 aa  41.6  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.205609  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0666  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.62 
 
 
70 aa  41.6  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0360  sulfur carrier protein ThiS  37.5 
 
 
66 aa  42  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.18682  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4978  sulfur carrier protein ThiS  35.94 
 
 
66 aa  42  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3504  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.81 
 
 
66 aa  42  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.169395  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1275  thiamine biosynthesis protein ThiS  29.69 
 
 
67 aa  41.6  0.004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.106306  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4168  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.5 
 
 
66 aa  41.6  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.852753  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1503  ThiS, thiamine-biosynthesis  35.82 
 
 
72 aa  41.2  0.004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2465  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 
68 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3313  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.38 
 
 
70 aa  41.2  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2224  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.62 
 
 
69 aa  40.8  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.179012 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2482  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.38 
 
 
66 aa  40.8  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.116747  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3474  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.38 
 
 
66 aa  40.8  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0252712  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02970  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.94 
 
 
66 aa  40.4  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0044  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.81 
 
 
72 aa  40.4  0.008  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.164239  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2432  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  37.1 
 
 
329 aa  40.4  0.009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.129281  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>