79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1856 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_1573  thiamine biosynthesis protein ThiS  100 
 
 		 64 aa  122  2e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0171362  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1856  thiamine biosynthesis protein ThiS  100 
 
 		 64 aa  122  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2933  ThiS, thiamine-biosynthesis  42.19 
 
 		 98 aa  53.1  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0004662  hitchhiker  3.85019e-16 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0589  hypothetical protein  40.32 
 
 		 65 aa  51.6  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.519327  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0035  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.86 
 
 		 66 aa  51.2  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.91579  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2432  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  37.5 
 
 		 329 aa  49.7  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.129281  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0618  sulfur carrier protein ThiS  44.44 
 
 		 67 aa  49.3  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2072  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.51 
 
 		 66 aa  48.5  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.113816  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0667  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.19 
 
 		 75 aa  48.5  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.20728e-26 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0654  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.19 
 
 		 75 aa  48.1  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0130451  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0610  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.5 
 
 		 67 aa  47.8  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00214937  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3474  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.62 
 
 		 66 aa  47.8  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0252712  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2567  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.81 
 
 		 66 aa  47.8  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.823918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0338  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.06 
 
 		 67 aa  47.8  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1317  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.71 
 
 		 66 aa  47.8  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1150  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.5 
 
 		 63 aa  47  0.00008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000104387  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3658  thiamine biosynthesis protein ThiS  42 
 
 		 67 aa  47  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1823  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.62 
 
 		 66 aa  46.6  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.100624 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1749  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.1 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000555242  normal  0.0141169 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3504  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.48 
 
 		 66 aa  46.2  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.169395  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04970  sulfur carrier protein ThiS  37.1 
 
 		 66 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4103  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 		 90 aa  47  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.189024  decreased coverage  0.00486776 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1345  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.55 
 
 		 66 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3289  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.19 
 
 		 66 aa  46.6  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.425824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1095  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.06 
 
 		 68 aa  46.6  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.364292  normal  0.0606209 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0801  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.71 
 
 		 66 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0479  sulfur carrier protein ThiS  37.1 
 
 		 66 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.738565  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4168  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.48 
 
 		 66 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.852753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0726  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.94 
 
 		 66 aa  45.4  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00139474  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5105  sulfur carrier protein ThiS  37.1 
 
 		 92 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.205609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1922  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.48 
 
 		 62 aa  45.4  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.589844  normal  0.309934 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1077  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  37.5 
 
 		 326 aa  46.2  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129832  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02970  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.48 
 
 		 66 aa  45.1  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5331  sulfur carrier protein ThiS  37.1 
 
 		 71 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.883696  normal  0.241111 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1554  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.94 
 
 		 211 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.636206  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4978  sulfur carrier protein ThiS  37.1 
 
 		 66 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0777  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.94 
 
 		 66 aa  45.4  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1191  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.06 
 
 		 63 aa  45.4  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1068  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.5 
 
 		 63 aa  45.1  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.60648  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1656  thiamine biosynthesis protein ThiS  46.15 
 
 		 62 aa  45.1  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2136  thiamine biosynthesis protein ThiS  46 
 
 		 73 aa  45.4  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0612  sulfur carrier protein ThiS  38.46 
 
 		 67 aa  45.1  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2638  thiamine biosynthesis protein ThiS  42 
 
 		 68 aa  45.1  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3147  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.48 
 
 		 66 aa  45.1  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.054012  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0734  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.5 
 
 		 63 aa  45.1  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5155  sulfur carrier protein ThiS  37.1 
 
 		 66 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.404683  normal  0.862246 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3189  sulfur carrier protein ThiS  37.1 
 
 		 66 aa  44.7  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.580772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0647  sulfur carrier protein ThiS  41.27 
 
 		 67 aa  44.7  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3290  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  35.94 
 
 		 331 aa  43.9  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0641  sulfur carrier protein ThiS  39.68 
 
 		 67 aa  43.9  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0642  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.19 
 
 		 66 aa  43.9  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0792  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.19 
 
 		 66 aa  43.9  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.464856  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0641  sulfur carrier protein ThiS  39.68 
 
 		 67 aa  43.5  0.0009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0808  sulfur carrier protein ThiS  39.68 
 
 		 67 aa  43.5  0.0009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.47601e-48 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4543  sulfur carrier protein ThiS  39.68 
 
 		 67 aa  43.5  0.0009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.528402 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0801  sulfur carrier protein ThiS  39.68 
 
 		 67 aa  43.5  0.0009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0885  sulfur carrier protein ThiS  39.68 
 
 		 67 aa  43.5  0.0009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000164722  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0697  sulfur carrier protein ThiS  39.68 
 
 		 67 aa  43.5  0.0009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1268  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.94 
 
 		 67 aa  43.5  0.0009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0448831  hitchhiker  0.00213488 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0731  sulfur carrier protein ThiS  39.68 
 
 		 67 aa  43.5  0.0009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0788  sulfur carrier protein ThiS  38.1 
 
 		 67 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.450844  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4741  sulfur carrier protein ThiS  35.48 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.243463 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2127  thiamine-biosynthesis protein ThiS  34.38 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0808  thiamine biosynthesis sulfur transfer protein  35.94 
 
 		 64 aa  42.7  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.408006  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2482  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.87 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.116747  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0433  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.48 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2522  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.48 
 
 		 77 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0360  sulfur carrier protein ThiS  35.48 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.18682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1633  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  34.38 
 
 		 347 aa  42.4  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0044  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.1 
 
 		 72 aa  42.4  0.002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.164239  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0670  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  33.87 
 
 		 326 aa  42.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1555  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.38 
 
 		 67 aa  42  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.112904 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1416  sulfur carrier protein ThiS  36.92 
 
 		 67 aa  42  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0093  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.25 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.704796  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3862  ThiS, thiamine-biosynthesis  37.1 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0818304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4701  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  40 
 
 		 374 aa  40.8  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468322  normal  0.837099 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0071  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.73 
 
 		 162 aa  40.8  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.290426  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0597  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.25 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1135  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.5 
 
 		 66 aa  40.8  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.477207  normal  0.0493363 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>