122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1554 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_1554  thiamine biosynthesis protein ThiS  100 
 
 
211 aa  432  1e-120  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.636206  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2165  thiamine biosynthesis protein ThiS  53.03 
 
 
66 aa  74.3  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0801  thiamine biosynthesis protein ThiS  54.55 
 
 
66 aa  71.6  0.000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1679  thiamine biosynthesis protein ThiS  53.03 
 
 
66 aa  68.9  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000223825  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0777  thiamine biosynthesis protein ThiS  48.48 
 
 
66 aa  66.6  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4701  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  37.93 
 
 
374 aa  65.5  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468322  normal  0.837099 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0597  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.94 
 
 
66 aa  63.2  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1749  thiamine biosynthesis protein ThiS  50.79 
 
 
65 aa  63.2  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000555242  normal  0.0141169 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1317  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.42 
 
 
66 aa  61.6  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0072  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.13 
 
 
78 aa  61.6  0.000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1135  thiamine biosynthesis protein ThiS  51.52 
 
 
66 aa  61.6  0.000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.477207  normal  0.0493363 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4741  sulfur carrier protein ThiS  45.45 
 
 
66 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.243463 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2432  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  40.91 
 
 
329 aa  59.3  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.129281  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2482  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.91 
 
 
66 aa  58.9  0.00000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.116747  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0433  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.94 
 
 
66 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0589  hypothetical protein  45.45 
 
 
65 aa  58.2  0.00000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.519327  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0643  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.18 
 
 
73 aa  58.2  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.85301  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0035  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.91 
 
 
66 aa  57.8  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.91579  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0670  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  39.39 
 
 
326 aa  56.6  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1345  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.91 
 
 
66 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0788  sulfur carrier protein ThiS  43.28 
 
 
67 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.450844  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0801  sulfur carrier protein ThiS  43.28 
 
 
67 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0697  sulfur carrier protein ThiS  43.28 
 
 
67 aa  56.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0641  sulfur carrier protein ThiS  43.28 
 
 
67 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0731  sulfur carrier protein ThiS  43.28 
 
 
67 aa  56.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4103  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.31 
 
 
90 aa  56.6  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.189024  decreased coverage  0.00486776 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0885  sulfur carrier protein ThiS  43.28 
 
 
67 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000164722  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4543  sulfur carrier protein ThiS  43.28 
 
 
67 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.528402 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0808  sulfur carrier protein ThiS  43.28 
 
 
67 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.47601e-48 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0612  sulfur carrier protein ThiS  43.28 
 
 
67 aa  56.2  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5331  sulfur carrier protein ThiS  42.42 
 
 
71 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.883696  normal  0.241111 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2933  ThiS, thiamine-biosynthesis  32.69 
 
 
98 aa  55.8  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0004662  hitchhiker  3.85019e-16 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4978  sulfur carrier protein ThiS  39.39 
 
 
66 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01842  sulfur carrier protein ThiS  42.42 
 
 
66 aa  55.8  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0666  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.45 
 
 
70 aa  55.5  0.0000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02970  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.42 
 
 
66 aa  55.5  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3147  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.94 
 
 
66 aa  55.5  0.0000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.054012  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2567  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 
66 aa  55.5  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.823918  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0035  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.81 
 
 
73 aa  55.1  0.0000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3504  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 
66 aa  55.5  0.0000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.169395  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5105  sulfur carrier protein ThiS  39.39 
 
 
92 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.205609  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0479  sulfur carrier protein ThiS  40.91 
 
 
66 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.738565  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1915  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 
66 aa  54.7  0.0000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04970  sulfur carrier protein ThiS  40.91 
 
 
66 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5155  sulfur carrier protein ThiS  39.39 
 
 
66 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.404683  normal  0.862246 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0360  sulfur carrier protein ThiS  39.39 
 
 
66 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.18682  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0731  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.94 
 
 
67 aa  53.9  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0792  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.45 
 
 
66 aa  53.5  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.464856  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0642  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.45 
 
 
66 aa  53.5  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0641  sulfur carrier protein ThiS  41.79 
 
 
67 aa  53.5  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0618  sulfur carrier protein ThiS  40.3 
 
 
67 aa  53.1  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0647  sulfur carrier protein ThiS  41.79 
 
 
67 aa  53.1  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0610  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 
67 aa  52.8  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00214937  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0667  thiamine biosynthesis protein ThiS  46.97 
 
 
75 aa  52.8  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.20728e-26 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4168  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 
66 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.852753  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2002  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 
86 aa  52.8  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.896977  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0654  thiamine biosynthesis protein ThiS  46.97 
 
 
75 aa  52.4  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0130451  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1077  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  37.88 
 
 
326 aa  51.6  0.000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129832  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1567  ThiS, thiamine-biosynthesis  42.03 
 
 
70 aa  50.4  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0927969  normal  0.455632 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3290  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  38.24 
 
 
331 aa  50.4  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1823  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.91 
 
 
66 aa  50.8  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.100624 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2062  sulfur carrier protein ThiS  40.91 
 
 
98 aa  50.4  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3189  sulfur carrier protein ThiS  39.39 
 
 
66 aa  50.4  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.580772  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2396  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  40.3 
 
 
327 aa  49.7  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1268  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 
67 aa  49.7  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0448831  hitchhiker  0.00213488 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3474  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 
66 aa  49.7  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0252712  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1984  sulfur carrier protein ThiS  40.91 
 
 
93 aa  49.7  0.00003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0044  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.62 
 
 
72 aa  49.3  0.00004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.164239  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1143  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.81 
 
 
70 aa  49.3  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0193117  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1158  sulfur transfer protein for thiamine biosynthesis  37.5 
 
 
65 aa  49.3  0.00005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2136  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.42 
 
 
73 aa  48.9  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1266  ThiS, thiamine-biosynthesis  33.33 
 
 
67 aa  48.9  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1555  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 
67 aa  48.9  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.112904 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2907  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.81 
 
 
75 aa  48.9  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3658  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 
67 aa  48.1  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3289  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 
66 aa  48.1  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.425824  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1841  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.71 
 
 
95 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.430269 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1185  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.31 
 
 
69 aa  47.4  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.029771  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2465  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.76 
 
 
68 aa  47  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1416  sulfur carrier protein ThiS  38.81 
 
 
67 aa  47  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1095  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.31 
 
 
68 aa  47  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.364292  normal  0.0606209 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1068  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.71 
 
 
63 aa  46.6  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.60648  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1262  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.82 
 
 
67 aa  46.6  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3862  ThiS, thiamine-biosynthesis  34.85 
 
 
67 aa  46.2  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0818304  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0071  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.31 
 
 
162 aa  46.2  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.290426  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1564  ThiS, thiamine-biosynthesis  37.88 
 
 
67 aa  45.4  0.0006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0619282 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2519  thiamine biosynthesis protein ThiS  46.97 
 
 
66 aa  45.4  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1856  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.94 
 
 
64 aa  45.4  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1573  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.94 
 
 
64 aa  45.4  0.0006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0171362  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0734  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.71 
 
 
63 aa  45.4  0.0006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0726  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 
66 aa  45.1  0.0009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00139474  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1191  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.48 
 
 
63 aa  44.3  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1633  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  33.33 
 
 
347 aa  44.7  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1058  hypothetical protein  36.36 
 
 
70 aa  44.3  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000643593  normal  0.078632 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0073  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 
66 aa  44.7  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2538  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.31 
 
 
69 aa  44.3  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.694439  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0963  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.08 
 
 
68 aa  44.7  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2589  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.34 
 
 
69 aa  44.7  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.851507  normal  0.0105127 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1334  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.45 
 
 
66 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0203428  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4065  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 
67 aa  44.3  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.58887  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>