46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1266 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1266  ThiS, thiamine-biosynthesis  100 
 
 		 67 aa  135  1e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2002  thiamine biosynthesis protein ThiS  59.7 
 
 		 86 aa  86.7  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.896977  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0731  thiamine biosynthesis protein ThiS  58.21 
 
 		 67 aa  80.5  0.000000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1564  ThiS, thiamine-biosynthesis  52.24 
 
 		 67 aa  77.4  0.00000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0619282 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0666  thiamine biosynthesis protein ThiS  52.24 
 
 		 70 aa  76.3  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1555  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.79 
 
 		 67 aa  62.8  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.112904 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0479  sulfur carrier protein ThiS  42.42 
 
 		 66 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.738565  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04970  sulfur carrier protein ThiS  42.42 
 
 		 66 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2482  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 		 66 aa  51.2  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.116747  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1633  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  39.06 
 
 		 347 aa  49.3  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1554  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 		 211 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.636206  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0035  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 		 66 aa  49.3  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.91579  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01842  sulfur carrier protein ThiS  40.91 
 
 		 66 aa  48.1  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4168  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 		 66 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.852753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0838  ThiS, thiamine-biosynthesis  31.34 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1345  thiamine biosynthesis protein ThiS  28.79 
 
 		 66 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1915  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.82 
 
 		 66 aa  47  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0610  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.84 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00214937  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3189  sulfur carrier protein ThiS  39.39 
 
 		 66 aa  46.6  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.580772  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5105  sulfur carrier protein ThiS  39.39 
 
 		 92 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.205609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2465  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.03 
 
 		 68 aa  45.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1773  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.29 
 
 		 72 aa  45.8  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4978  sulfur carrier protein ThiS  39.39 
 
 		 66 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1416  sulfur carrier protein ThiS  40.3 
 
 		 67 aa  44.7  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3474  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.94 
 
 		 66 aa  45.1  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0252712  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1262  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.84 
 
 		 67 aa  43.9  0.0007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3034  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.25 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00295138  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34640  sulfur carrier protein ThiS  31.25 
 
 		 64 aa  43.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0439272  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02970  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5331  sulfur carrier protein ThiS  36.36 
 
 		 71 aa  43.5  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.883696  normal  0.241111 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0360  sulfur carrier protein ThiS  37.88 
 
 		 66 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.18682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5155  sulfur carrier protein ThiS  37.88 
 
 		 66 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.404683  normal  0.862246 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3504  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.38 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.169395  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0444  sulfur carrier protein ThiS  36.36 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1268  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.34 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0448831  hitchhiker  0.00213488 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6397  sulfur carrier protein ThiS  35.48 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3235  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.5 
 
 		 66 aa  42  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.320513  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0612  sulfur carrier protein ThiS  39.68 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0072  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.3 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0988  thiamine biosynthesis protein ThiS  28.36 
 
 		 67 aa  41.6  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0800067  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0433  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 		 66 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2098  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 		 76 aa  40.8  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.219145  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2400  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.81 
 
 		 74 aa  40.8  0.006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0589  hypothetical protein  33.33 
 
 		 65 aa  40.8  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.519327  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3147  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.81 
 
 		 66 aa  40.4  0.009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.054012  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4741  sulfur carrier protein ThiS  35.94 
 
 		 66 aa  40  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.243463 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>