112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1416 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1416  sulfur carrier protein ThiS  100 
 
 
67 aa  135  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0612  sulfur carrier protein ThiS  73.13 
 
 
67 aa  106  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0801  sulfur carrier protein ThiS  50.75 
 
 
67 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0697  sulfur carrier protein ThiS  50.75 
 
 
67 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0641  sulfur carrier protein ThiS  50.75 
 
 
67 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0731  sulfur carrier protein ThiS  50.75 
 
 
67 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0885  sulfur carrier protein ThiS  50.75 
 
 
67 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000164722  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4543  sulfur carrier protein ThiS  50.75 
 
 
67 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.528402 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0808  sulfur carrier protein ThiS  50.75 
 
 
67 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.47601e-48 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0618  sulfur carrier protein ThiS  50.75 
 
 
67 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0641  sulfur carrier protein ThiS  50.75 
 
 
67 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0647  sulfur carrier protein ThiS  49.25 
 
 
67 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0788  sulfur carrier protein ThiS  50.75 
 
 
67 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.450844  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0479  sulfur carrier protein ThiS  47.76 
 
 
66 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.738565  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04970  sulfur carrier protein ThiS  46.27 
 
 
66 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4168  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.3 
 
 
66 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.852753  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2933  ThiS, thiamine-biosynthesis  46.27 
 
 
98 aa  57.8  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0004662  hitchhiker  3.85019e-16 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0035  thiamine biosynthesis protein ThiS  46.27 
 
 
66 aa  57.8  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.91579  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2567  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.28 
 
 
66 aa  57.4  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.823918  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1268  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.59 
 
 
67 aa  57  0.00000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0448831  hitchhiker  0.00213488 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0589  hypothetical protein  43.28 
 
 
65 aa  56.2  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.519327  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3658  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.79 
 
 
67 aa  55.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0654  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.79 
 
 
75 aa  55.8  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0130451  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0667  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.28 
 
 
75 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.20728e-26 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02970  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.79 
 
 
66 aa  54.7  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5331  sulfur carrier protein ThiS  40.3 
 
 
71 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.883696  normal  0.241111 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2136  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.78 
 
 
73 aa  53.5  0.0000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5105  sulfur carrier protein ThiS  38.81 
 
 
92 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.205609  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1317  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.3 
 
 
66 aa  53.1  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4978  sulfur carrier protein ThiS  38.81 
 
 
66 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1262  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.28 
 
 
67 aa  53.5  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2127  thiamine-biosynthesis protein ThiS  46.15 
 
 
67 aa  52.4  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1345  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.28 
 
 
66 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1915  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.81 
 
 
66 aa  52  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5155  sulfur carrier protein ThiS  37.31 
 
 
66 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.404683  normal  0.862246 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0360  sulfur carrier protein ThiS  37.31 
 
 
66 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.18682  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0433  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.81 
 
 
66 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4741  sulfur carrier protein ThiS  38.81 
 
 
66 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.243463 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0610  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.81 
 
 
67 aa  51.2  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00214937  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3474  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.79 
 
 
66 aa  51.6  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0252712  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3289  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.78 
 
 
66 aa  51.6  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.425824  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2482  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.82 
 
 
66 aa  51.2  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.116747  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1633  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  38.81 
 
 
347 aa  50.8  0.000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3504  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.3 
 
 
66 aa  50.4  0.000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.169395  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2522  thiamine biosynthesis protein ThiS  40 
 
 
77 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1077  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  41.79 
 
 
326 aa  48.1  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129832  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2432  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  38.81 
 
 
329 aa  48.1  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.129281  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2396  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  38.81 
 
 
327 aa  47.8  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4103  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.54 
 
 
90 aa  47.8  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.189024  decreased coverage  0.00486776 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0792  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.81 
 
 
66 aa  47.8  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.464856  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0642  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.81 
 
 
66 aa  47.8  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1058  hypothetical protein  41.79 
 
 
70 aa  47.4  0.00007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000643593  normal  0.078632 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1554  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.81 
 
 
211 aa  47  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.636206  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1823  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.33 
 
 
66 aa  46.6  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.100624 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3235  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.31 
 
 
66 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.320513  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0777  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.84 
 
 
66 aa  46.2  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0877  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.84 
 
 
65 aa  46.6  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0304024  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0838  ThiS, thiamine-biosynthesis  31.34 
 
 
67 aa  46.2  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0643  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.76 
 
 
73 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.85301  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3290  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  38.24 
 
 
331 aa  45.1  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1266  ThiS, thiamine-biosynthesis  40.3 
 
 
67 aa  44.7  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1785  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.31 
 
 
65 aa  44.3  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.226514  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3944  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.78 
 
 
71 aa  44.7  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000530679  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1937  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.31 
 
 
65 aa  44.3  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.841225  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3862  ThiS, thiamine-biosynthesis  41.79 
 
 
67 aa  44.3  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0818304  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1135  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.79 
 
 
66 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.477207  normal  0.0493363 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0072  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.34 
 
 
78 aa  44.3  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0801  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.31 
 
 
66 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2072  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.84 
 
 
66 aa  43.9  0.0008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.113816  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5046  hypothetical protein  35.82 
 
 
70 aa  43.9  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.461936  normal  0.383391 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3189  sulfur carrier protein ThiS  38.81 
 
 
66 aa  43.5  0.0009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.580772  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0726  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.81 
 
 
66 aa  43.5  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00139474  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1564  ThiS, thiamine-biosynthesis  40.3 
 
 
67 aa  43.5  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0619282 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0071  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.65 
 
 
162 aa  42.7  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.290426  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3147  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.81 
 
 
66 aa  43.5  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.054012  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2538  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.76 
 
 
69 aa  42.7  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.694439  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0734  thiamine biosynthesis protein ThiS  40 
 
 
63 aa  43.1  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2062  sulfur carrier protein ThiS  37.31 
 
 
98 aa  43.5  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1984  sulfur carrier protein ThiS  37.31 
 
 
93 aa  43.5  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2465  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.76 
 
 
68 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2165  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.82 
 
 
66 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2519  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.78 
 
 
66 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1068  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.46 
 
 
63 aa  42.4  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.60648  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4701  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  41.27 
 
 
374 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468322  normal  0.837099 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1334  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.78 
 
 
66 aa  42  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0203428  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1432  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.78 
 
 
66 aa  42  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0567426  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1567  ThiS, thiamine-biosynthesis  31.88 
 
 
70 aa  41.6  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0927969  normal  0.455632 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0044  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.27 
 
 
72 aa  42  0.003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.164239  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1856  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.92 
 
 
64 aa  42  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1573  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.92 
 
 
64 aa  42  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0171362  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3433  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.24 
 
 
75 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1153  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 
68 aa  42  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2683  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.24 
 
 
75 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.809629  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2584  hypothetical protein  35.29 
 
 
80 aa  41.6  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0731  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.81 
 
 
67 aa  41.6  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0247  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 
78 aa  41.6  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0975224  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1339  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.34 
 
 
66 aa  41.2  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0038066 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01842  sulfur carrier protein ThiS  37.31 
 
 
66 aa  41.2  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0035  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.82 
 
 
73 aa  41.2  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2239  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.88 
 
 
70 aa  41.2  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.423585 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>