136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_2165 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_2165  thiamine biosynthesis protein ThiS  100 
 
 		 66 aa  136  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1554  thiamine biosynthesis protein ThiS  53.03 
 
 		 211 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.636206  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2432  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  42.42 
 
 		 329 aa  65.1  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.129281  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2584  hypothetical protein  43.94 
 
 		 80 aa  61.6  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1135  thiamine biosynthesis protein ThiS  48.48 
 
 		 66 aa  61.2  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.477207  normal  0.0493363 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2907  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.42 
 
 		 75 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3313  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.91 
 
 		 70 aa  58.5  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2522  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.62 
 
 		 77 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4065  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.94 
 
 		 67 aa  57.4  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.58887  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1749  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.16 
 
 		 65 aa  56.2  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000555242  normal  0.0141169 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1158  sulfur transfer protein for thiamine biosynthesis  40.62 
 
 		 65 aa  56.2  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2567  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 		 66 aa  56.6  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.823918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2683  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.91 
 
 		 75 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.809629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5046  hypothetical protein  40.91 
 
 		 70 aa  55.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.461936  normal  0.383391 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2933  ThiS, thiamine-biosynthesis  42.42 
 
 		 98 aa  55.8  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0004662  hitchhiker  3.85019e-16 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3433  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.91 
 
 		 75 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0072  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.82 
 
 		 78 aa  56.2  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0667  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.94 
 
 		 75 aa  55.5  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.20728e-26 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0035  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.91 
 
 		 66 aa  55.5  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.91579  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0726  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.91 
 
 		 66 aa  55.1  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00139474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2062  sulfur carrier protein ThiS  42.42 
 
 		 98 aa  55.1  0.0000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1984  sulfur carrier protein ThiS  42.42 
 
 		 93 aa  55.1  0.0000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1823  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.42 
 
 		 66 aa  54.7  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.100624 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0610  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.91 
 
 		 67 aa  54.3  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00214937  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0589  hypothetical protein  45.45 
 
 		 65 aa  54.3  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.519327  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0654  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.94 
 
 		 75 aa  53.9  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0130451  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0642  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.42 
 
 		 66 aa  53.5  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0792  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.42 
 
 		 66 aa  53.5  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.464856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0801  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.42 
 
 		 66 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0777  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 		 66 aa  53.1  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1268  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 		 67 aa  52.8  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0448831  hitchhiker  0.00213488 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1679  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 		 66 aa  52.8  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000223825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1317  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 		 66 aa  52  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0073  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.82 
 
 		 66 aa  52  0.000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1369  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.13 
 
 		 69 aa  50.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0915348  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3658  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 		 67 aa  50.4  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01842  sulfur carrier protein ThiS  40.91 
 
 		 66 aa  50.4  0.000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1567  ThiS, thiamine-biosynthesis  37.68 
 
 		 70 aa  49.7  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0927969  normal  0.455632 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1058  hypothetical protein  37.88 
 
 		 70 aa  50.1  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000643593  normal  0.078632 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19401  hypothetical protein  39.13 
 
 		 70 aa  49.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.952724 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0597  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 		 66 aa  49.7  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4701  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  36.36 
 
 		 374 aa  50.1  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468322  normal  0.837099 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2136  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 		 73 aa  49.7  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0670  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  33.33 
 
 		 326 aa  49.3  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14741  hypothetical protein  39.13 
 
 		 69 aa  48.9  0.00002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.214043  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0963  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.08 
 
 		 68 aa  48.9  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1865  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 		 67 aa  49.3  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0959115  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1633  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  34.85 
 
 		 347 aa  48.5  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0093  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 		 66 aa  48.1  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.704796  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3290  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  39.39 
 
 		 331 aa  48.5  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4168  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 		 66 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.852753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13201  hypothetical protein  40 
 
 		 70 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.537163 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02970  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 		 66 aa  48.1  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14601  hypothetical protein  39.13 
 
 		 69 aa  47.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2482  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 		 66 aa  47.4  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.116747  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0643  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.35 
 
 		 73 aa  47.8  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.85301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04970  sulfur carrier protein ThiS  40.91 
 
 		 66 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0479  sulfur carrier protein ThiS  40.91 
 
 		 66 aa  47  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.738565  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3189  sulfur carrier protein ThiS  36.36 
 
 		 66 aa  47.4  0.00008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.580772  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2729  sulfur carrier protein ThiS  45.45 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3709  sulfur carrier protein ThiS  45.45 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0338  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.5 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0071  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.24 
 
 		 162 aa  46.6  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.290426  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3225  sulfur carrier protein ThiS  45.45 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1774  sulfur carrier protein ThiS  45.45 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3680  sulfur carrier protein ThiS  45.45 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3738  sulfur carrier protein ThiS  45.45 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2779  sulfur carrier protein ThiS  45.45 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3944  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.23 
 
 		 71 aa  46.2  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000530679  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5105  sulfur carrier protein ThiS  37.88 
 
 		 92 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.205609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3007  sulfur carrier protein ThiS  43.94 
 
 		 65 aa  45.4  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4978  sulfur carrier protein ThiS  37.88 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0247  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.81 
 
 		 78 aa  45.4  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0975224  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0788  sulfur carrier protein ThiS  40.3 
 
 		 67 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.450844  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0801  sulfur carrier protein ThiS  40.3 
 
 		 67 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1191  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.81 
 
 		 63 aa  45.1  0.0004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0697  sulfur carrier protein ThiS  40.3 
 
 		 67 aa  45.1  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0808  sulfur carrier protein ThiS  40.3 
 
 		 67 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.47601e-48 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0641  sulfur carrier protein ThiS  40.3 
 
 		 67 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0885  sulfur carrier protein ThiS  40.3 
 
 		 67 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000164722  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0731  sulfur carrier protein ThiS  40.3 
 
 		 67 aa  45.1  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2696  sulfur carrier protein ThiS  39.39 
 
 		 65 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0329  sulfur carrier protein ThiS  40.91 
 
 		 65 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0411  sulfur carrier protein ThiS  39.39 
 
 		 65 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4543  sulfur carrier protein ThiS  40.3 
 
 		 67 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.528402 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1068  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.81 
 
 		 63 aa  45.1  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.60648  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14361  hypothetical protein  37.68 
 
 		 69 aa  44.7  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1275  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.26 
 
 		 67 aa  44.7  0.0004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.106306  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0314  sulfur carrier protein ThiS  39.39 
 
 		 65 aa  44.7  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.388373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0390  sulfur carrier protein ThiS  39.39 
 
 		 65 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0808  thiamine biosynthesis sulfur transfer protein  37.5 
 
 		 64 aa  44.7  0.0004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.408006  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1915  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.3 
 
 		 66 aa  44.3  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1564  ThiS, thiamine-biosynthesis  34.85 
 
 		 67 aa  44.3  0.0006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0619282 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0895  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.23 
 
 		 72 aa  43.9  0.0007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1345  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 		 66 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3289  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 		 66 aa  43.9  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.425824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5155  sulfur carrier protein ThiS  36.36 
 
 		 66 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.404683  normal  0.862246 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5331  sulfur carrier protein ThiS  36.36 
 
 		 71 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.883696  normal  0.241111 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0433  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 		 66 aa  42.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1503  ThiS, thiamine-biosynthesis  33.33 
 
 		 72 aa  43.5  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>